Omics-technieken en gegevensanalyse (B-KUL-I0U28B)

Dit is een vertaalde versie. Originele versie in Engels.
5 studiepuntenEngels28 urenTweede semester
POC Bioinformatics

Uitbreiding van de kennis van gentechnologie naar genoomschaal, gericht op experimentele analyse van de realisatie van genetische informatie doorheen de verschillende moleculair-biologische niveaus.

De student verwerft inzicht in de meest gangbare technologieën op de verschillende moleculair-biologische niveaus (genoom/transcriptoom/proteoom). De student kan deze reproduceren, de bruikbaarheid inschatten en kritisch evalueren bij specifieke toepassingen aan de hand van concrete voorbeelden, aangereikt door de docent.

Op basis van de complexiteit voor al deze niveaus (DNA/RNA/eiwit/metabolieten) kent en begrijpt de student geschikte hoge-doorvoertechnieken. De student kent en begrijpt de gangbare identificatietechnieken (sequentiebepaling/microarray, massaspectrometrie) en kan de bekomen biologische informatie analyseren en interpreteren, op basis van bioinformatische en experimentele technieken

Kennis van statistiek, wiskundige basis van matrixcalculus, basisbegrippen van bioinformatica (DNA databanken en hun gebruik), kennis van microbiologie, biochemie, gentechnologie.


Dit opleidingsonderdeel is een voorwaarde voor het opnemen van volgende opleidingsonderdelen:
I0U20A : Geïntegreerd bio-informaticaproject

Dit opleidingsonderdeel is identiek aan de volgende opleidingsonderdelen:
I0P49A : Bioinformatica en genoomtechnologie
I0U28A : Omics-technieken en gegevensanalyse (Niet meer aangeboden dit academiejaar)

Onderwijsleeractiviteiten

2 sp. Genoomanalyse (B-KUL-I0V62a)

2 studiepuntenEngelsWerkvorm: College17 urenTweede semester
POC Bio-ingenieurswetenschappen

- Overzicht van genoomcomplexiteit en genoommapping-technieken
- Hoge-doorvoer sequentieanalysetechnieken
- Genoomschaal chemische synthese technieken voor nucleïnezuren
- Bioinformatische analyse van genomen
- Genoomannotatie
- Vergelijkende en metagenoomanalyse

Hand-outs en nota's

1 sp. Transcriptoomanalyse (B-KUL-I0V63a)

1 studiepuntenEngelsWerkvorm: College9 urenTweede semester
POC Bio-ingenieurswetenschappen

  • Transcriptoomanalysetechnieken
  • Bioinformatische analyse van transcriptoomdata
  • Gerelateerde biostatistiek

Cursustekst / slides
Hand-outs en nota’s

2 sp. Proteoom- en metaboloomanalyse (B-KUL-I0V64a)

2 studiepuntenEngelsWerkvorm: College2 urenTweede semester
POC Bio-ingenieurswetenschappen

  • Eiwitexpressie en analyse
  • Proteoomanalysetechnieken
  • Principle van massaspectrometrie
  • Peptidomica
  • Metaboloomanalyse
  • Bioinformatische analyse van proteoomdata
  • Voorbeelden en toepassingen

Cursustekst / slides
Handouts en nota’s

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Omics-technieken en gegevensanalyse (B-KUL-I2U28b)

Type : Examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Open vragen
Leermateriaal : Cursusmateriaal, Computer


- Open domeinvragen die peilen naar kennis, begrip, analyse en synthese van het cursusmateriaal
- Techniekvragen: definiëren en illustreren van specifieke technologieën (kennis, begrip en analyse)
- Definitievragen die synthesevaardigheden vereisen
- Oefeningen tijdens het examen die peilen naar de kritische evaluatie en keuze van specifieke technologieën voor specifieke toepassingen