Bioinformatica en genoomtechnologie (B-KUL-I0P49A)
Doelstellingen
Uitbreiding van de kennis van gentechnologie naar genoomschaal, gericht op experimentele analyse van de realisatie van genetische informatie doorheen de verschillende moleculair-biologische niveaus.
De student verwerft inzicht in de meest gangbare technologieën op de verschillende moleculair-biologische niveaus (genoom/transcriptoom/proteoom/metaboloom). De student kan deze reproduceren, de bruikbaarheid inschatten en kritisch evalueren bij specifieke toepassingen aan de hand van concrete voorbeelden, aangereikt door de docent.
Op basis van de complexiteit voor al deze niveaus (DNA/RNA/eiwit/metabolieten) kent en begrijpt de student geschikte hoge-doorvoertechnieken. De student kent en begrijpt de gangbare identificatietechnieken (Sequentiebepaling/microarray, massaspectrometrie) en kan de bekomen biologische informatie analyseren en interpreteren, op basis van bioinformatische en experimentele technieken.
Begintermen
Kennis van statistiek, wiskundige basis van matrixcalculus, basisbegrippen van bioinformatica (DNA- databanken en hun gebruik), kennis van microbiologie, biochemie, gentechnologie.
Volgtijdelijkheidsvoorwaarden
Dit opleidingsonderdeel is een voorwaarde voor het opnemen van volgende opleidingsonderdelen:
I0P52A : Geïntegreerd practicum (GIP): moleculaire biotechnologie (Niet meer aangeboden dit academiejaar)
I0I31A : Geïntegreerd practicum (GIP): moleculaire biotechnologie
Identieke opleidingsonderdelen
Dit opleidingsonderdeel is identiek aan de volgende opleidingsonderdelen:
I0U28B : Omics-technieken en gegevensanalyse
Plaats in het onderwijsaanbod
- Master of Statistics and Data Science (on campus) (Leuven) (Statistics and Data Science for Biometrics) 120 sp.
- Courses for Exchange Students Faculty of Bioscience Engineering (Leuven)
- Master of Bioscience Engineering: Cellular and Genetic Engineering (Leuven) 120 sp.
Onderwijsleeractiviteiten
2 sp. Genoomanalyse (B-KUL-I0V62a)
Inhoud
- Overzicht van genoomcomplexiteit en genoommapping-technieken
- Hoge-doorvoer sequentieanalysetechnieken
- Genoomschaal chemische synthese technieken voor nucleïnezuren
- Bioinformatische analyse van genomen
- Genoomannotatie
- Vergelijkende en metagenoomanalyse
Studiemateriaal
Hand-outs en nota's
Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen
1 sp. Transcriptoomanalyse (B-KUL-I0V63a)
Inhoud
- Transcriptoomanalysetechnieken
- Bioinformatische analyse van transcriptoomdata
- Gerelateerde biostatistiek
Studiemateriaal
Cursustekst / slides
Hand-outs en nota’s
Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen
2 sp. Proteoom- en metaboloomanalyse (B-KUL-I0V64a)
Inhoud
- Eiwitexpressie en analyse
- Proteoomanalysetechnieken
- Principle van massaspectrometrie
- Peptidomica
- Metaboloomanalyse
- Bioinformatische analyse van proteoomdata
- Voorbeelden en toepassingen
Studiemateriaal
Cursustekst / slides
Handouts en nota’s
Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen
1 sp. Interactieanalyse van biomolecules (B-KUL-I0V65a)
Inhoud
- In vitro interactoomanalysetechnieken
- In vivo interactoomanalysetechnieken
- Voorbeelden en toepassingen
Studiemateriaal
Cursustekst / slides
Hand-outs en nota’s
Evaluatieactiviteiten
Evaluatie: Bioinformatica en genoomtechnologie (B-KUL-I2P49a)
Toelichting
- Open domeinvraag die peilt naar kennis, begrip, analyse en synthesse van het cursusmateriaal
- Techniekvraag: definiëren en illustreren van specifieke technologiëen (Kennis, Begrip & analyse)
- Definitievragen die een synthesevaardigheden vereisen
- Oefening tijdens het examen die peilt naar de kritische evaluatie en keuze van specifieke technologieën voor specifieke toepassingen