Bioinformatica en genoomtechnologie (B-KUL-I0P49A)

Dit is een vertaalde versie. Originele versie in Engels.
6 studiepuntenEngels37 urenTweede semester
POC Bio-ingenieurswetenschappen

Uitbreiding van de kennis van gentechnologie naar genoomschaal, gericht op experimentele analyse van de realisatie van genetische informatie doorheen de verschillende moleculair-biologische niveaus.

De student verwerft inzicht in de meest gangbare technologieën op de verschillende moleculair-biologische niveaus (genoom/transcriptoom/proteoom/metaboloom). De student kan deze reproduceren, de bruikbaarheid inschatten en kritisch evalueren bij specifieke toepassingen aan de hand van concrete voorbeelden, aangereikt door de docent.

Op basis van de complexiteit voor al deze niveaus (DNA/RNA/eiwit/metabolieten) kent en begrijpt de student geschikte hoge-doorvoertechnieken. De student kent en begrijpt de gangbare identificatietechnieken (Sequentiebepaling/microarray, massaspectrometrie) en kan de bekomen biologische informatie analyseren en interpreteren, op basis van bioinformatische en experimentele technieken.

 

Kennis van statistiek, wiskundige basis van matrixcalculus, basisbegrippen van bioinformatica (DNA- databanken en hun gebruik), kennis van microbiologie, biochemie, gentechnologie. 


Dit opleidingsonderdeel is een voorwaarde voor het opnemen van volgende opleidingsonderdelen:
I0P52A : Geïntegreerd practicum (GIP): moleculaire biotechnologie (Niet meer aangeboden dit academiejaar)
I0I31A : Geïntegreerd practicum (GIP): moleculaire biotechnologie

Dit opleidingsonderdeel is identiek aan de volgende opleidingsonderdelen:
I0U28B : Omics-technieken en gegevensanalyse

Onderwijsleeractiviteiten

2 sp. Genoomanalyse (B-KUL-I0V62a)

2 studiepuntenEngelsWerkvorm: College17 urenTweede semester
POC Bio-ingenieurswetenschappen

- Overzicht van genoomcomplexiteit en genoommapping-technieken
- Hoge-doorvoer sequentieanalysetechnieken
- Genoomschaal chemische synthese technieken voor nucleïnezuren
- Bioinformatische analyse van genomen
- Genoomannotatie
- Vergelijkende en metagenoomanalyse

Hand-outs en nota's

1 sp. Transcriptoomanalyse (B-KUL-I0V63a)

1 studiepuntenEngelsWerkvorm: College9 urenTweede semester
POC Bio-ingenieurswetenschappen

  • Transcriptoomanalysetechnieken
  • Bioinformatische analyse van transcriptoomdata
  • Gerelateerde biostatistiek

Cursustekst / slides
Hand-outs en nota’s

2 sp. Proteoom- en metaboloomanalyse (B-KUL-I0V64a)

2 studiepuntenEngelsWerkvorm: College2 urenTweede semester
POC Bio-ingenieurswetenschappen

  • Eiwitexpressie en analyse
  • Proteoomanalysetechnieken
  • Principle van massaspectrometrie
  • Peptidomica
  • Metaboloomanalyse
  • Bioinformatische analyse van proteoomdata
  • Voorbeelden en toepassingen

Cursustekst / slides
Handouts en nota’s

1 sp. Interactieanalyse van biomolecules (B-KUL-I0V65a)

1 studiepuntenEngelsWerkvorm: College9 urenTweede semester
POC Bio-ingenieurswetenschappen

  • In vitro interactoomanalysetechnieken
  • In vivo interactoomanalysetechnieken
  • Voorbeelden en toepassingen

Cursustekst / slides
Hand-outs en nota’s

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Bioinformatica en genoomtechnologie (B-KUL-I2P49a)

Type : Examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Open vragen
Leermateriaal : Formularium, Computer


- Open domeinvraag die peilt naar kennis, begrip, analyse en synthesse van het cursusmateriaal
- Techniekvraag: definiëren en illustreren van specifieke technologiëen (Kennis, Begrip & analyse)
- Definitievragen die een synthesevaardigheden vereisen
- Oefening tijdens het examen die peilt naar de kritische evaluatie en keuze van specifieke technologieën voor specifieke toepassingen