Optioneel in fase
Eerste semester
Tweede semester
Beide semesters
Niet ingericht
Dit jaar
Volgend jaar
Wisselende jaren
Extern
Voorwaarden
Docenten
Onderwijstaal
Duur
Identieke opleidingsonderdelenBioinformatica en structurele biologie (B-KUL-G0O59B)
Uitgesloten voor examencontractDoelstellingen
De student is vertrouwd met volgende termen en kan zelfstandig basis bioinformatische oefeningen maken en resultaten interpreteren inzake volgende elementen:
- Genoom-, sequentie- en structuurdatabanken
- Experimentele structurele biologie methodes: proteïne-kristallografie, single particle cryoEM en bio-NMR
- Structurele bio-informatica
- Visualisatie en analyse van de structuur en interacties van biomacromoleculen
- Analyse van nucleotide- en aminozuursequenties
- Sequentiealignering
- Paargewijze en multipele sequentie-alignering
- Locale en globale aligneringsmethoden
- BLAST
- Fylogenetische bomen op basis van sequentie
- Krachtvelden en inleiding tot biomoleculaire modellering
Begintermen
Basis biochemie van aminozuren, nucleotiden, proteines, basisconcepten van statistiek, basisconcepten van evolutie en moleculaire biologie
Identieke opleidingsonderdelen
Dit opleidingsonderdeel is identiek aan de volgende opleidingsonderdelen:
X0D23A : Bioinformatics
G00C0A : Bioinformatica
Plaats in het onderwijsaanbod
- Schakelprogramma: Master in de biochemie en de biotechnologie (voor professionele bachelors biochemie en voor professionele bachelors in de biomedische laboratoriumtechnieken) (Leuven) 60 sp.
- Bachelor in de biochemie en de biotechnologie (programma voor studenten gestart vóór 2023-2024) (Leuven) 180 sp.
- Bachelor in de chemie (Leuven) (Minor biochemie en biotechnologie) 180 sp.
- Bachelor in de chemie (Leuven) (Minor verbreding) 180 sp.
- Bachelor in de biologie (Leuven) (Minor biochemie en biotechnologie) 180 sp.
- Bachelor in de biochemie en de biotechnologie (programma voor studenten gestart in 2023-2024 of later) (Leuven) 180 sp.
Onderwijsleeractiviteiten
4 sp. Bioinformatica (B-KUL-G0O59a)
Inhoud
De student is vertrouwd met volgende termen en kan zelfstandig basis bioinformatische oefeningen maken en resultaten interpreteren inzake volgende elementen.
Genoom-, sequentie- en structuurdatabanken
Analyse van nucleotide- en aminozuursequenties
Sequentie-alignering
Paargewijze en multipele sequentie-alignering
Locale en globale aligneringsmethoden
BLAST
Fylogenetische bomen op basis van sequentie
Studiemateriaal
Zelfgemaakte slides en oefeningenbundel, inhoud gebaseerd op hoofdstukken uit commercieel handboek
Toelichting werkvorm
Blended onderwijs - Oefensessie
hoorcolleges en computeroefenzittingen
Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen
2 sp. Structurele biologie (B-KUL-G0O60a)
Inhoud
De student is vertrouwd met volgende termen en kan zelfstandig basis bioinformatische oefeningen maken en resultaten interpreteren inzake volgende elementen.
Experimentele structurele biologie methodes: proteïne-kristallografie, single particle cryoEM en bio-NMR
Structurele bio-informatica
Krachtvelden en inleiding tot biomoleculaire modellering
Visualisatie en analyse van de structuur en interacties van biomacromoleculen
Studiemateriaal
Oefeningenopgaven in Toledo
Toelichting onderwijstaal
Onderdeel van een Nederlandstalige bachelor-opleiding, maar kan in Engels gegeven worden (cursus en oefeningen zijn al in het Engels)
Toelichting werkvorm
Blended onderwijs - Gastcollege - Oefensessie
Oefenzittingen in de computerklas waar topics uit de hoorcolleges in de praktijk omgezet. Hierbij worden hoofdzakelijk publiek toegankelijke gereedschappen gebruikt.
Evaluatieactiviteiten
Evaluatie: Bioinformatica en structurele biologie (B-KUL-G2O59b)
Toelichting
Het oefeningenexamen gaat door op de pc en is open boek.
het schriftelijke gedeelte is gesloten boek en zal enkel bestaan uit meerkeuzevragen. Studenten dienen voor beide onderdelen te slagen. Een onvoldoende voor één van deze onderdelen resulteert in een maximale score van 9/20.
Toelichting bij herkansen
Identiek als eerste zittijd