De opleiding stelt zich tot doel de arts bijkomende inzichten te geven in de relaties tussen gezondheid en de fysieke activiteit in het algemeen en de sportbeoefening in het bijzonder.

De algemene opleidingsdoelen van de masteropleiding in de sportgeneeskunde zijn:
1. het beheersen van algemene competenties op een gevorderd niveau als het vermogen in de sportgeneeskunde (inclusief de gerelateerde sportwetenschappen) om op een wetenschappelijke wijze te denken en handelen, het kunnen omgaan met complexe problemen, het kunnen reflecteren, het vermogen tot communiceren met medische vakgenoten en leken;
2. het beheersen van algemene wetenschappelijke competenties in de sportgeneeskunde op een gevorderd niveau als het kunnen gebruiken van methoden en technieken in medisch onderzoek, het kunnen ontwerpen van onderzoek, het vermogen tot originaliteit en creativiteit in het kunnen samenwerken in een multidisciplinaire omgeving;
3. een gevorderd begrip van en inzicht in de wetenschappelijk-disciplinaire kennis van de sportgeneeskunde;
4. het beheersen van de competenties nodig voor het uitoefenen van de sportmedische praktijk op een wetenschappelijk gefundeerde basis.

Op het einde van de opleiding beschikt de student over:
1. een proces van medisch en kinesiologisch probleemoplossen. Dit betekent de vaardigheid van het systematisch werken, het hanteren van het juiste diagnostische proces, aangepast aan de soort hulpvraag en het kiezen van het juiste beleid op basis van de meest geactualiseerde wetenschappelijke inzichten en een voldoende kennis en vaardigheid om alle voorkomende sportgerelateerde aspecten te kunnen behandelen;
2. een breed kennis- en vaardighedenpakket om in staat te zijn met andere disciplines/hulpverleners samen te werken;
3. de juiste attitudes en sociale en communicatieve vaardigheden om met respect met een patiënt of sporter om te gaan.