Bachelor in de biochemie en de biotechnologie (Leuven)

CQ Bachelor in de biochemie en de biotechnologie (Leuven)

Opleiding

Wat vind je op deze webpagina?

Op deze pagina’s kun je als (toekomstige) student o.a. het officieel studieprogramma raadplegen. 

Je vindt ook alles over toelatingsvoorwaarden en aanvullende opleidingen, detailinformatie over de opleidingsonderdelen, je uurrooster per week …

Ben je toekomstig student?

Neem dan zeker eerst een kijkje op de pagina van de bachelor in de biochemie en de biotechnologie.

Je leest er alles over

- Inhoud van de opleiding

- Beginprofiel

- Toekomstmogelijkheden

- Infomomenten & brochures

- Je campus

- ...

Profiel

Toelatingsvoorwaarden

Bachelor in de biochemie en de biotechnologie (programma voor studenten gestart in 2023-2024 of later) (Leuven)onderwijsaanbod.kuleuven.be/2024/opleidingen/n/SC_57400723.htm#activetab=voorwaardenBachelor in de biochemie en de biotechnologie (programma voor studenten gestart vóór 2023-2024) (Leuven)onderwijsaanbod.kuleuven.be/2024/opleidingen/n/SC_51016672.htm#activetab=voorwaarden

Doelstellingen

DE OPLEIDING 'BACHELOR IN DE BIOCHEMIE EN DE BIOTECHNOLOGIE' HEEFT VOLGENDE LEERRESULTATEN:

De bachelor in de biochemie en de biotechnologie:

KENNIS EN INZICHT
1.  beschikt over fundamentele kennis van en inzicht in de biochemie en de biotechnologie, heeft kennis van en inzicht in de samenhang en het onderscheid tussen de subdisciplines van de biochemie en de biotechnologie, en kan de eigen discipline situeren in een brede wetenschappelijke context
2.  beschikt over relevante kennis van en inzicht in de biologie, chemie, fysica en wiskunde en kan deze integreren in zijn eigen vakgebied
3.  heeft algemene inzichten verworven op vlak van wetenschapsfilosofie en levensbeschouwing

TOEPASSEN VAN KENNIS EN INZICHT
4.  heeft de vaardigheden en het inzicht om onder gepaste begeleiding volgende stappen te zetten in een concreet wetenschappelijk onderzoek in het domein van de biochemie en de biotechnologie:
a.  de nodige vakliteratuur en bio-informatische gegevens in publieke databaken opzoeken
b.  eenvoudige modellen en een abstracte manier van denken toepassen bij het oplossen van wetenschappelijke vragen
c.  een wetenschappelijke probleemstelling formuleren
d.  een gepaste oplossingsprocedure beredeneren
e.  een chemische en biologische risicoanalyse uitvoeren verbonden aan geplande experimenten
f.  een wetenschappelijk experiment of theoretisch project plannen en uitvoeren
g.  de gevonden data verwerken tot een aanschouwelijk geheel
h.  en dit alles volgens de veiligheidsregels en op wetenschappelijk integere wijze

OORDEELSVORMING
5.  kan binnen een gegeven thema de vakliteratuur beoordelen
6.  kan de chemische en biologische risico’s verbonden aan biochemisch-biotechnologische experimenten inschatten en kritisch beoordelen
7.  kan onder begeleiding de resultaten van zowel eigen onderzoek als literatuuronderzoek verwerken, kritisch interpreteren, becommentariëren in het licht van een welbepaalde onderzoeksvraag en hieruit besluiten trekken
8.  kan het belang van zijn eigen onderzoeksactiviteiten en van de biochemisch-biotechnologische discipline in het algemeen plaatsen binnen de context van de wetenschap alsook in een maatschappelijke context

COMMUNICATIE
9.  kan zowel in een teamverband functioneren als zelfstandig werken
10.  kan een beargumenteerd standpunt innemen en dit mondeling verdedigen tegenover mede-studenten
11.  kan in het Nederlands zowel schriftelijk als mondeling communiceren en presenteren, en dit op originele wijze en met correcte bronvermelding
12.  heeft voldoende kennis van het Engels om vakliteratuur te lezen, colleges en lezingen te volgen, zelf een rapport te schrijven en examens af te leggen

LEERVAARDIGHEDEN EN VORMINGSDOELEN
13.  is in staat om zelfstandig leeractiviteiten te plannen en deze planning op te volgen
14.  kan de nodige inzichten opdoen omtrent de heersende standpunten rond een opgegeven thema om vervolgens zelf tot een beredeneerde eigen opinie te komen

AFHANKELIJK VAN DE GEKOZEN MINOR, BEHEERST DE BACHELOR VOLGENDE AANVULLENDE LEERRESULTATEN:
15.  MINOR VERBREDING: heeft verbredende kennis van en inzicht in enkele andere wetenschapsgebieden en kan deze verbinden met de opgedane biochemisch-biotechnologische kennis
16.  MINOR BIOLOGIE: heeft theoretische en praktische basiskennis van en inzicht in de biologie en haar subdisciplines en kan deze verbinden met de opgedane biochemisch-biotechnologische kennis
17.  MINOR CHEMIE: heeft theoretische en praktische basiskennis van en inzicht in de chemie en haar subdisciplines en kan deze verbinden met de opgedane biochemisch-biotechnologische kennis
18.  MINOR BUSINESS AND INNOVATION: heeft kennis en inzicht in de processen van de economie die de ontwikkeling en uitbouw van innoverende projecten ondersteunen

DE OPLEIDING BACHELOR IN DE BIOCHEMIE EN DE BIOTECHNOLOGIE HEEFT VOLGENDE VORMINGSDOELEN:

1.  Zich bewust zijn van de internationale dynamiek binnen het eigen wetenschapsdomein.

2.  Zich bewust zijn van het belang van het eigen wetenschapsdomein in de maatschappelijke discussie omtrent duurzaamheid.

Loopbaan

Contact

Kwaliteit van de opleiding

Hier vind je een overzicht van de resultaten van de interne kwaliteitszorgmethode COBRA.

Onderwijskwaliteit op het niveau van de opleiding

Blauwdruk
Bestand PDF document Blauwdruk_BA_Biochemie en biotechnologie.pdf

COBRA 2019-2023
Bestand PDF document COBRA-fiche_BA_Biochemie en biotechnologie.pdf

Onderwijskwaliteit op het niveau van de universiteit


Meer info?

SC Bachelor in de biochemie en de biotechnologie (programma voor studenten gestart in 2023-2024 of later) (Leuven)

programma

Je studieloopbaanbegeleider vind je op de webpagina met studieloopbaanbegeleiders van de faculteit wetenschappen.

Bij de inroostering van colleges, oefeningen, practica en excursies wordt rekening gehouden met de opleidingsonderdelen die opgenomen werden in dit schema: zie http://wet.kuleuven.be/apps/traject/.

Voor de hoorcolleges, oefeningen, practica en excursies kan niet gegarandeerd worden dat elke minor overlapvrij kan ingeroosterd worden.

Tijdens je derde bachelor kan je les volgen aan een buitenlandse universiteit via vaste uitwisselingspakketten. Lees meer over uitwisseling tijdens de bachelor op naar het buitenland.

In 2023–2024 is de Faculteit Wetenschappen gestart met een hervorming in de bacheloropleiding. Het nieuwe bachelorprogramma wordt fase per fase ingevoerd, terwijl het oude programma fase per fase wordt afgebouwd.

Studenten die in 2022-2023 of vroeger in de opleiding gestart zijn en in kader van hun persoonlijk dossier bijkomende vragen hebben aangaande de hervorming van de bacheloropleiding nemen contact op met de studieloopbaanbegeleider.

SC Bachelor in de biochemie en de biotechnologie (programma voor studenten gestart vóór 2023-2024) (Leuven)

programma

Je studieloopbaanbegeleider vind je op de webpagina met studieloopbaanbegeleiders van de faculteit wetenschappen.

Bij de inroostering van colleges, oefeningen, practica en excursies wordt rekening gehouden met de opleidingsonderdelen die opgenomen werden in dit schema: zie http://wet.kuleuven.be/apps/traject/.
Voor de hoorcolleges, oefeningen, practica en excursies kan niet gegarandeerd worden dat elke minor overlapvrij kan ingeroosterd worden.

Tijdens je derde bachelor kan je les volgen aan een buitenlandse universiteit via vaste uitwisselingspakketten. Lees meer over uitwisseling tijdens de bachelor op naar het buitenland.

In 2023-2024 startte de Faculteit Wetenschappen met een hervorming in de bacheloropleiding. Het nieuwe bachelorprogramma wordt fase per fase ingevoerd, terwijl het oude programma fase per fase wordt afgebouwd. Studenten die in 2022-2023 of vroeger in de opleiding gestart zijn en in kader van hun persoonlijk dossier bijkomende vragen hebben aangaande de hervorming van de bacheloropleiding nemen contact op met de studieloopbaanbegeleider.

printECTS33.xsl

ECTS Religie, zingeving en levensbeschouwing (B-KUL-A08C7A)

3 studiepunten Nederlands 13 Tweede semesterTweede semester

Doelstellingen

  • Studenten zijn in staat om de plaats en het belang van religie, zingeving en levensbeschouwing in de hedendaagse cultuur en samenleving uit te leggen.
  • Studenten zijn in staat om aan te geven welke mens- en wereldbeelden aanwezig zijn in fenomenen in samenleving en cultuur, zoals media, economie en onderwijs, en zij kunnen hierover kritisch reflecteren.
  • Studenten zijn in staat te verwoorden hoe zij zich levensbeschouwelijk uitgedaagd weten door een confrontatie met een eigentijdse, contextueel verankerde, godsdienstwetenschappelijk en theologisch onderbouwde benadering van de Bijbelse traditie en zij kunnen de eigenheid van deze traditie formuleren.
  • Studenten zijn in staat tot persoonlijke reflectie, onderbouwde stellingname en dialoog met medestudenten over religieuze en levensbeschouwelijke vragen in het kader van het eigen vakgebied en in relatie tot belangrijke maatschappelijke bezorgdheden zoals ecologische, economische en sociale duurzaamheid.
  • Studenten zijn in staat om de waarde van religie, zingeving en levensbeschouwing te benoemen, ook in verband met aspecten van het eigen leven, en zij kunnen kritisch stil staan bij hun eigen levensbeschouwelijke vooroordelen en vooronderstellingen. Ze zien in dat wetenschap alleen niet volstaat om een maatschappij vorm te geven.
  • Studenten zijn in staat om hun verantwoordelijkheid voor en roeping in de maatschappij van morgen onder woorden te brengen en zij kunnen verduidelijken hoe de Bijbelse traditie hen aanspoort om hun professionele identiteit te ontwikkelen als dienst aan de samenleving, met bijzondere aandacht voor de meest kwetsbaren, bijvoorbeeld in het kader van de actuele duurzaamheidscrisis.

Begintermen

Dit college vergt geen specifieke voorkennis. Een eerste kennismaking met de filosofische manier van denken is wel een pluspunt. Wat de motivatie betreft, wordt van de studenten verwacht dat zij als kritisch gevormde universitair geschoolden bereid zijn om stil te staan bij hun eigen functioneren in en verantwoordelijkheid voor de maatschappij van morgen.

Identieke opleidingsonderdelen

P0S31A: Religie, zingeving en levensbeschouwing

Onderwijsleeractiviteiten

Religie, zingeving en levensbeschouwing (B-KUL-A08C7a)

3 studiepunten : College 13 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

Dit opleidingsonderdeel nodigt studenten uit om na te denken over wat het betekent mens te zijn in een wereld vormgegeven door wetenschap en technologie. Het reikt hen inhouden, denkkaders en leessleutels aan die hen kunnen helpen om te reflecteren over zichzelf, de wereld en de grote vragen van het leven. Het opleidingsonderdeel maakt hen ook duidelijk hoe maatschappelijke kwesties en uitdagingen verbonden zijn met uiteenlopende religieuze en levensbeschouwelijke visies en vooronderstellingen. Op die manier wil het opleidingsonderdeel studenten brengen tot een complexer en genuanceerder begrip van henzelf, hun medemensen en de samenleving, alsook tot een scherper bewustzijn van hun eigen levensbeschouwelijk profiel. Studenten worden eveneens uitgedaagd om hun eigen persoonlijke en professionele spiritualiteit te vormen in gesprek met religie, wetenschap en technologie.

Het opleidingsonderdeel gaat uit van de vaststelling dat we leven in een dubbelzinnige tijd. Enerzijds plukken we vandaag de vruchten van een ongeziene vooruitgang die mogelijk werd door wetenschap, technologie en kapitalisme. Anderzijds worden we echter geconfronteerd met een veelvoud aan crisissen waarvan niet duidelijk is of enkel nog meer wetenschap, technologie en economische groei voldoende zijn om ze op te lossen. Zo is er sprake van een ecologische crisis waarvan nogal wat denkers zeggen dat het om een spirituele crisis gaat die we dan ook als zodanig moeten aanpakken. Het opleidingsonderdeel grijpt de claim dat de ecologische crisis een spirituele crisis is aan om de vraag te stellen wat spiritualiteit nu eigenlijk is en welke bronnen van spiritualiteit ons vandaag ter beschikking staan. Het onderzoekt ook hoe de ecologische crisis, en in het bijzonder de opwarming van de aarde, als een spiritueel probleem geduid kan worden en hoe het maatschappelijk debat over de opwarming van de aarde vragen oproept over onder meer de verhouding tussen natuurwetenschap en het alledaagse leven alsook over de verhouding tussen ecologisme en religie. Vragen die aan de orde gesteld worden zijn de volgende: Welke rol kan of moet de natuurwetenschap spelen in het organiseren van de samenleving? Wat is de verhouding tussen natuurwetenschap en politiek? Kan natuurwetenschap de functie van religie overnemen? Mogen we uit natuurwetenschappelijke bevindingen levensbeschouwelijke conclusies trekken? En zo ja, welke dan? Is de natuurwetenschap een bron van spiritualiteit en zingeving? Heeft religie bijdragen aan de ecologische crisis en/of kan ze bijdragen het oplossen ervan? En zo ja, welke ideeën uit de verschillende wereldreligies kunnen hierbij helpen? Wat moeten we aanvangen met de kritiek dat ecologie een nieuwe religie is geworden? Zit er een grond van waarheid in dit verwijt? En zo ja, wat kunnen we er uit leren?

Naast de colleges wordt van de studenten verwacht dat ze één van de universiteitsbrede RZL-modules doorlopen.

Studiemateriaal

Een nieuw cursusboek is in voorbereiding en zou tegen februari 2025 beschikbaar zijn.

Bijkomend studiemateriaal (beschikbaar in Toledo):

  • Slides ter ondersteuning van de lessen
  • Mediatheek met videofragmenten
  • Indien relevant: extra voorbeelden of illustraties

Toelichting werkvorm

Het hart van het opleidingsonderdeel bestaat in een grondige lectuur van het cursusboek. Tijdens de hoorcolleges helpt de docent de studenten op weg met de lectuur van het cursusboek door hen te wijzen op rode draden, verbanden en aandachtspunten. De colleges worden ondersteund door slides. Het is wenselijk zorgvuldig te noteren.

Het opleidingsonderdeel wil expliciet aanzetten tot persoonlijke reflectie en uitwisseling. De studenten krijgen daarom bij het begin van het semester een reflectie-opdracht. Deze reflectie-opdracht wordt tijdens de eerste les uitgelegd.

Er is ook steeds ruimte voor vragen en bedenkingen van de studenten. Deze kunnen op elk moment tijdens de colleges binnengebracht worden of kunnen na afloop van de les gesteld worden (ook via e-mail of via een polleverywhere-link die doorheen het semester actief blijft). Studenten worden op die manier uitgenodigd het leertraject actief zelf vorm te geven. De input door de studenten kan ook georganiseerd worden door middel van enquêtes of met behulp van het discussieforum.

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Religie, zingeving en levensbeschouwing (B-KUL-A28C7a)

Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk, Paper/Werkstuk
Vraagvormen : Open vragen
Leermateriaal : Cursusmateriaal

Toelichting

De evaluatie bestaat uit drie delen: (1) de reflectie-opdracht, (2) het voltooien van een van de universiteitsbrede RZL-modules  en (3) een schriftelijk examen aan het einde van het semester. Het examen peilt naar begrip van en inzicht in het cursusboek alsook naar de mate waarin studenten diepgaand nagedacht hebben over de thema’s die in het opleidingsonderdeel aan de orde waren en de mate waarin ze het cursusboek met zin voor detail bestudeerd hebben. Het examen bestaat uit drie vragen: (1) een synthese- en reflectievraag die peilt naar globaal inzicht en de mate waarin persoonlijk nagedacht werd over de inhouden van het cursusboek, (2) een open vraag die peilt naar inzicht en begrip van een meer specifiek onderdeel van het cursusboek en een (3) stelling of begripsverklaring of gelijkaardige vraag die wil nagaan met hoeveel zin voor detail de studenten het cursusboek doorgenomen hebben. Tijdens het examen mag het geannoteerde cursusboek geraadpleegd worden.

Het eindresultaat R voor het opleidingsonderdeel komt tot stand door volgende scores op te tellen en te herleiden tot een punt op 20:

  • S1: score voor de reflectie-opdracht (beoordeeld op 10);
  • S2: score voor het voltooien van een van de universiteitsbrede RZL-modules (beoordeeld op 3; volledig afgewerkt = 3/3 en niet volledig afgewerkt = 0/3);
  • S3: score voor de synthese- en reflectievraag op het examen (beoordeeld op 10);
  • S4: score voor de open vraag op het examen (beoordeeld op 5);
  • S5: score voor de stelling of begripsverklaring op het examen (beoordeeld op 2).

Het eindresultaat voor het opleidingsonderdeel wordt berekend met behulp van de volgende formule in Excel: R = ROUND((((S1+S2+S3+S4+S5)*20)/30);0).

Wanneer de inleveringstermijn van de reflectie-opdracht niet wordt gerespecteerd, wordt de opdracht beschouwd als niet-ingeleverd, wat in de puntentelling neerkomt op een score 0. De indiendeadline wordt meegedeeld via Toledo.

Toelichting bij herkansen

In geval van een onvoldoende op het geheel herneemt de student het schriftelijke examen.

Wie niet geslaagd was voor het geheel, maar wel voor de reflectie-opdracht, neemt de score voor de reflectie-opdracht mee naar de derde examenperiode. Ontbrekende elementen kunnen eventueel nog aangevuld worden met het oog op een hogere score.

Ook de score voor het voltooien van een universiteitsbrede RZL-module gaat mee naar de derde examenperiode. Dit onderdeel kan niet herkanst worden.

Er is geen overdracht van deelresultaten naar een volgend academiejaar.

De puntenverdeling, ontvankelijkheidsvoorwaarden en voorwaarden om te slagen tijdens de derde examenperiode zijn dezelfde als bij de eerste examenkans. De indiendeadline voor de herziene opdracht wordt medegedeeld via Toledo.

ECTS Marketing engineering (B-KUL-D0H54A)

6 studiepunten Nederlands 39 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

Doelstellingen

Bij het voltooien van dit opleidingsonderdeel kan de student:


- de voornaamste primaire en secundaire data bronnen binnen marketing aangeven en verduidelijken
- marketing vraagstukken oplossen aan de hand van verschillende marketing (beslissings)modellen:
       o beargumenteren welke methode het meest geschikt is voor een bepaald marketing vraagstuk
       o beargumenteren welke data/informatie vereist is om de gekozen methode toe te passen
       o analyseren van de vereiste data
       o interpreteren van de output van een marketing model
       o op basis van o.a. inzichten uit data analyse een gefundeerde marketing beslissing nemen

Begintermen

Bij aanvang van dit opleidingsonderdeel is het:

* essentieel een inleidend vak Marketing gevolgd te hebben, omdat we ons zullen verdiepen in een aantal specifieke marketing topics
* aanbevolen om een minimum aan basiskennis van (beschrijvende en verklarende) statistiek en regressieanalyse te hebben

 

Plaats in het onderwijsaanbod

Onderwijsleeractiviteiten

Marketing engineering (B-KUL-D0H54a)

6 studiepunten : College 39 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

Marketing Engineering geeft een beter inzicht in belangrijke marketing aspecten door de analyse van reële marketing problemen. Het hoofddoel van deze cursus is om kennis te verbreden door verschillende fundamentele marketing modellen en analysetechnieken te bespreken en zelf ook uit te voeren. Marketeers worden geconfronteerd met steeds snellere veranderingen in de markt, en moeten enerzijds marktgegevens verzamelen en anderzijds inzichten genereren uit reeds bestaande gegevens en informatie. Vandaag de dag is het voor marketing managers niet meer voldoende om alleen een grondige kennis van marketing concepten te bezitten. Meer en meer worden feiten-gebaseerde analyses en de aanwending van beslissingsmodellen gevraagd om de marketingstrategie van een onderneming te ondersteunen. In deze cursus zullen we theorie linken met de praktijk. Begrijpen hoe markting data verzameld wordt (dataverzameling), alsook weten welke analysetechnieken gebruikt moeten worden (data-analyse) zal managers een competitief voordeel geven. In deze cursus zullen de nodige know-how en tools worden aangeleerd die je in staat zullen stellen om de juiste informatie te verzamelen en te analyseren met als doel betere marketing plannen op te stellen, betere doelgroepen te selecteren, …. , kortom, betere beslissingen te nemen. Een bedrijfskundige vertaalslag naar de bruikbaarheid van deze analysetechnieken voor marketing beslissingsnemers wordt hierbij beklemtoond. Meer specifiek, zal er een overzicht gegeven worden van een aantal kwantitatieve methoden, voor welke vraagstukken deze kunnen gebruikt worden en hoe deze kunnen ingezet worden ter ondersteuning bij marketing beslissingen. Dit wordt telkens geïllustreerd aan de hand van enkele praktijk cases.

Volgende deeldomeinen zullen nader belicht worden in de cursus:
- Informatieverzameling binnen marketing
- Segmentatie, Targeting & Positionering beslissingen
- Marketing-Mix beslissingen
 

Studiemateriaal

Studiemateriaal
* Het verplichte en aanvullende studiemateriaal voor dit opleidingsonderdeel bestaat uit geselecteerde hoofstukken, een set van business cases, een selectie van academische artikels, powerpoint slides en al het bijkomend materiaal behandeld tijdens de colleges. Voor meer informatie zie Toledo.
* In de cursus zal gebruik gemaakt worden van Excel en R.
Toledo
*Bij dit opleidingsonderdeel wordt gebruik gemaakt van Toledo.

Toelichting werkvorm

Van de studenten worden volgende leeractiviteiten verwacht:

 

- Studenten maken tijdens de hoorcolleges kennis met verschillende beslissingsmodellen toegepast binnen het marketing veld. 

- Studenten werken in groep enkele bedrijfscasussen uit waarbij ze de theorie aangebracht in de hoorcolleges toepassen op een concreet marketing vraagstuk. Groepen worden ad random door de docent ingedeeld.

- Studenten nemen actief deel aan de interactieve werkcolleges, waar zij de conclusies van hun groep op de bedrijfscasus verdedigen. 

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Marketing engineering (B-KUL-D2H54a)

Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk, Paper/Werkstuk, Self assessment/Peer assessment, Medewerking tijdens contactmomenten
Vraagvormen : Open vragen
Leermateriaal : Geen

Toelichting

Evaluatiekenmerken

*De evaluatie bestaat uit een “eindexamen” en “evaluatie doorheen het jaar”.

1) Het eindexamen is een schriftelijk, gesloten boek examen dat bestaat uit open vragen, inclusief toepassingsvragen.
2) De evaluatie doorheen het jaar bestaat uit  individuele en groepsopdrachten doorheen het jaar, actieve deelname en peerassessment.

*De eerste opdrachten starten reeds in februari. De inleveringstermijn en deadline van de groepsopdrachten worden vastgelegd door de docent en via Toledo meegedeeld.

Bepaling eindresultaat

Het opleidingsonderdeel wordt beoordeeld door de docent(en), zoals meegedeeld via Toledo en de examenregeling. Het resultaat wordt berekend en uitgedrukt met een geheel getal op 20 en is een gewogen cijfer dat als volgt wordt bepaald:

  • Het onderdeel "eindexamen" en het onderdeel "evaluatie doorheen het jaar" wordt respectievelijk voor 50% en 50%  verrekend in het eindresultaat.
  • Indien men een onvoldoende behaalt voor het eindexamen (namelijk een score onder 9.5/20) wordt de score op het opleidingsonderdeel gelijkgesteld aan de score op het "eindexamen".

* Indien de student niet deelneemt aan één (of meerdere) van de deelevaluaties, wordt de beoordeling van de niet afgelegde deelevaluatie(s) meegeteld als een 0-score binnen het gewogen eindresultaat.

*Indien de vastgelegde inleveringstermijn van een opdracht niet wordt gerespecteerd, wordt een 0 score gegeven voor die opdracht, tenzij om een zwaarwichtige reden na aanvraag een nieuwe indieningsdatum wordt bepaald.

*Een individuele afwijking van de groepsscore is mogelijk. Er kan op basis van een peer review namelijk een correctie van -10% tot +10% toegepast worden op de score van de groepswerkjes. Bij vrijbuiterproblemen (afgeleid uit de peer review) kan er van de vooropgestelde correctie van -10% afgeweken worden. Tevens kan er een correctie van -10% tot +10% toegepast worden op basis van medewerking tijdens de colleges.

 

Toelichting bij herkansen

*De evaluatiekenmerken en de bepaling eindresultaat van de tweede examenkans verschillen van die van de eerste examenkans.

*Studenten die doorheen het jaar een score onder de 12/20 haalden op één of meerdere groepswerkjes dienen voor derde examenperiode (dit) deze groepswerkje(s) individueel te herwerken. Elk herwerkt groepswerkje telt mee voor 2  van de 20 punten (10%). Het niet-deelnemen aan één van deze opdrachten leidt tot 0 score voor deze opdracht. 
De resterende punten van het eindresultaat komen van het schriftelijk examen en bestaat uit open vragen, inclusief toepassingsvragen.

*Bijvoorbeeld, als een student bij eerste examen kans op 2 groepswerkjes onder de 12/20 scoort, moet hij deze twee groepswerkjes herwerken voor 20% van de punten. (2*10% =20%). De resterende 80% van het eindresultaat komt van het eindexamen.

*Indien men geen voldoende behaalt voor het schriftelijk examen (namelijk een score onder 9.5/20) wordt de score op het opleidingsonderdeel gelijkgesteld aan de score op het schriftelijk examen.

*Bij de tweede examenkans worden behaalde resultaten voor medewerking tijdens contactmomenten en peer review niet opnieuw in rekening gebracht

ECTS Economics of Innovation and Intellectual Property (B-KUL-D0T32A)

6 ECTS English 39 Second termSecond term Cannot be taken as part of an examination contract

Aims

This course will introduce students to the field of the economics of innovation and intellectual property. Among other topics, it will cover questions such as the following:
 

• Why is investment in research, development and eventually innovation different from investing into tangible assets?
• Why is investment into research, development and innovation subject to market failure?
• How does market structure affect the incentives to innovate?
• Why do industrialized economies have institutions for securing intellectual property rights (IPRs) such as patents, trademarks, and copyrights, and how should these IPRs be designed to be effective?
• How do other government policies support innovation?
 

 

 

Previous knowledge

Although there are no required prerequisites for this course, students should be familiar with basic microeconomic concepts such as profit maximization and production functions.

It is also assumed that students are familiar with basic statistics, like interpreting results of linear regression models, for instance.

 

Is included in these courses of study

Onderwijsleeractiviteiten

Economics of Innovation and Intellectual Property (B-KUL-D0T32a)

6 ECTS : Lecture 39 Second termSecond term

Content

In the course we will discuss theoretical concepts and models of innovation and intellectual property, and also discuss empirical research on the economics of innovation and intellectual property.
In addition to attending lectures, the students will have the opportunity to check their performance during the semester in online quizzes provided via Toledo.

Course material

Course material:

  • Lecture slides, uploaded on Toledo
  • Reading materials will be distributed via Toledo.

Toledo is used for this learning activitity

Format: more information

The focus of this course is on the "Economics of Innovation and Intellectual Property". Students are expected to critically and thoroughly study the theory and examples that are presented during the lectures.

 

Evaluatieactiviteiten

Evaluation: Economics of Innovation and Intellectual Property (B-KUL-D2T32a)

Type : Partial or continuous assessment with (final) exam during the examination period
Description of evaluation : Written, Paper/Project, Self assessment/Peer assessment
Type of questions : Multiple choice, Closed questions, Open questions
Learning material : Calculator

Explanation

FEATURES OF THE EVALUATION

• The evaluation consists of:

  • Group assignments (paper) with peer assessment
  • Online tests, which will be published on Toledo
  • A written, closed-book exam

• Students can use a NON-graphic calculator during the exam.
• Regarding the (group) assignments, the deadlines will be determined by the lecturer and communicated via Toledo.

DETERMINATION OF FINAL GRADES
 

• The grades are determined by the lecturer as communicated via Toledo and stated in the examination schedule. The result is calculated and communicated as a number on a scale of 20.
• The final grade is a weighted score and consists of:

  • The group assignments (paper) count for 30% of the final grade
  • The online tests count for 10% of the final grade
  • The final exam counts for 60% of the final grade

• If the set deadline for the online tests was not respected, the student will receive 0 for that online test, unless the student asked the lecturer to arrange a new deadline. This request needs to be motivated by grave circumstances
• If the set deadline for the paper was not respected, all students of the group will receive 0 for the paper, unless they asked the lecturer to arrange a new deadline. This request needs to be motivated by grave circumstances
• Peer assessment is used to determine a variation of maximum 4 out of the 20 points that are allocated to the group assignments
• If a student does not participate in the group assignments, the grade for these partial evaluations will be a 0-grade within the calculations of the final grade
• If there is a deficit score (<10/20) for the final exam, this exam grade becomes the final grade for the course. Hence, a minimum grade of 10/20 for the final exam is required to pass the course
• If the student does not participate in the final exam, the final grade of the course will be NA (not taken) for the whole course

SECOND EXAMINATION OPPORTUNITY

• The features of the evaluation and/or determination of grades are the same as for the first examination opportunity

• The grades obtained on the online tests remain valid: they will be copied to the second exam opportunity and count for 10% of the final grade. If the student did not participate in the online tests (in the first examination period), the grade for these partial evaluations will be a 0-grade within the calculations of the final grade
• The grades obtained on the paper (group assignment) remain valid: they will be copied to the second exam opportunity and count for 30% of the final grade. If the student did not participate in the group assignments (in the first examination period), the grade for these partial evaluations will be a 0-grade within the calculations of the final grade
• The final exam at the second exam opportunity counts for the other 60% of the final grade
• If there is a deficit score (<10/20) for the final exam, this exam grade becomes the final grade for the course. Hence, a minimum grade of 10/20 for the final exam is required to pass the course
• If the student does not participate in the final exam, the final grade of the course will be NA (not taken) for the whole course
 

ECTS Geïntegreerd practicum in de biochemie en biotechnologie II (B-KUL-G00D1A)

3 studiepunten Nederlands 48 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract
Govers Sander |  N.

Doelstellingen

De studenten kunnen:

  • experimentele procedures volgen (i.e. handvaardigheid en praktische ervaring opdoen) op basis van een handleiding en hierbij gelijktijdig alle veiligheidsregels in acht nemen.
  • literatuurstudie uitvoeren naar DNA mutaties in reportereiwitten en vectorconstructen en op basis van deze informatie een kloneringsplan begrijpen en optimaliseren
  • Basistechnieken voor de manipulatie van DNA beheersen
  • correcte interpretatie uitvoeren van de resultaten waarbij de juiste negatieve en positieve controles worden meegenomen

Begintermen

Elementaire laboratoriumvaardigheden en kennis van laboratoriumveiligheid zoals aangeleerd in G0O57C Geïntegreerd practicum in de biochemie en biotechnologie I.
Basiskennis van de klassen van (bio)moleculen en hun chemische en/of biologische eigenschappen zoals onderwezen in G0N01C Grondslagen van de chemie, G0N08A Bio-organische chemie, G0O51B Analytische biochemie’, G0N20E Dynamische biochemie en G0O53C Moleculaire biologie.

Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



SOEPEL( G0O57C ) OF SOEPEL( X0B43D )


G0O57CG0O57C : Geïntegreerd practicum in de biochemie en biotechnologie I
X0B43DX0B43D : Geïntegreerd practicum

Onderwijsleeractiviteiten

Geïntegreerd practicum biochemie en biotechnologie II (B-KUL-G00D1a)

3 studiepunten : Practicum 48 Eerste semesterEerste semester
Govers Sander |  N.

Inhoud

In dit practicum zullen de studenten, gebruik makende van de moleculaire technieken die ze aangereikt kregen tijdens de tweede fase in het OPO G0O57C Geïntegreerd practicum in de biochemie en biotechnologie I, complexere probleemstellingen aanpakken met focus op het domein van de gentechnologie. Hierbij moeten ze relevante technieken beheersen en optimaliseren, alsook in een bredere context de link leggen met het onderzoeksveld.

Studiemateriaal

Zal worden beschikbaar gesteld: practicumhandleiding

Toelichting werkvorm

- Deelnemen onder toezicht aan laboratoriumsessies ondersteund door bio-informatische werkzaamheden in de PC-klas

- Uitvoeren van opdrachten

- Opstellen van een werkplan

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Geïntegreerd practicum in de biochemie en biotechnologie II (B-KUL-G20D1a)

Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Verslag, Self assessment/Peer assessment, Medewerking tijdens contactmomenten, Vaardigheidstoets
Leermateriaal : Cursusmateriaal

Toelichting

De evaluatie gebeurt tijdens het semester en is gebaseerd op

  • Permanente evaluatie (60%)
    • Attitude: de voorbereiding van de proeven via gerichte individuele bevraging bij aanvang van het practicum, de inzet tijdens de uitvoering van de proeven, het volgen van Goede-Laboratorium-Praktijken (GLP) en naleven van de veiligheidsvoorschriften tijdens de uitvoering van de proeven
    • Het bijhouden van een laboschrift (individueel)
    • Het werken in teamverband
    • Het opstellen van een haalbaar werkplan voor de uitvoering van de experimenten
    • Uitvoeren van online testen over de context van de practica sessies voor de aanvang ervan
  • Opdrachten met beoordeling (40%)
    • Eindverslag over de uitgevoerde experimenten

 

De deelname aan de practica en de vervulling van de bijhorende taken zijn verplicht. Afwezigheid is enkel gewettigd in geval van medische redenen of bijzonder aantoonbare familiale omstandigheden (te staven via een officieel document). Bij afwezigheid dient de docent of assistent zo snel mogelijk geïnformeerd te worden, bij voorkeur voor de aanvang van het practicum. Het gemiste practicum moet ingehaald worden volgens afspraak met de practicumcoördinator. Een student die ongewettigd afwezig is op één of meerdere van de practica, krijgt automatisch een onvoldoende. Het opleidingsonderdeel wordt dan beschouwd als niet afgelegd (NA). Systematisch verwaarlozen van één of meerdere geëvalueerde onderdelen leidt tot strafpunten.

 

Dit opleidingsonderdeel kan niet getolereerd worden.

Toelichting bij herkansen

 

ECTS Biomoleculaire kinetica en thermodynamica (B-KUL-G00D2A)

3 studiepunten Nederlands 26 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract
N.

Doelstellingen

De studenten kunnen bindingsevenwichten en kinetica van biomoleculen analyseren.

De studenten begrijpen hoe enzymen activatie energie verlagen.

De studenten kunnen een beschrijving geven van hoe moleculair transport over een membraan verloopt.

De studenten kunnen oxidatieve fosforylering beschrijven.

De studenten kunnen thermodynamische functies gebruiken om biochemische processen te beschrijven. De studenten zijn tevens op de hoogte van belangrijke technieken ter bepaling van deze functies.

De studenten kunnen een thermodynamische beschrijving geven van oppervlakteverschijnselen die van belang zijn in de biochemie

De studenten kunnen een thermodynamische beschrijving geven van micellen en begrijpen het belang ervan in de biochemie

De studenten kunnen activiteiten en activiteitscoëfficiënten gebruiken en begrijpen het belang ervan in de biochemie

De studenten kunnen colligatieve eigenschappen thermodynamisch beschrijven en voorbeelden aanhalen van hun belang in de biochemie

Onderwijsleeractiviteiten

Biomoleculaire kinetica en thermodynamica (B-KUL-G00D2a)

3 studiepunten : College 26 Tweede semesterTweede semester
N.

Inhoud

Cassusen

  • Thermofiele micro-organismen en thermostabiele eiwitten
  • Longsurfactanten en oppervlaktespanning
  • Berekende en experimenteel gemeten pH-waarden
  • Antivrieseiwitten: vriespuntverlaging en toepassingen
  • (Over)leven in zoutwater: osmose en toepassingen

Studiemateriaal

Slides, papers

Toelichting werkvorm

Casusgebaseerd college - Hoorcollege

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Biomoleculaire kinetica en thermodynamica (B-KUL-G20D2a)

Type : Examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Open vragen, Gesloten vragen
Leermateriaal : Formularium, Rekenmachine

Toelichting

De student moet slagen voor beide delen (kinetica en thermodynamica), zoniet is de score maximaal 9/20.

ECTS Chemical Biology (B-KUL-G00D5A)

3 ECTS English 26 Second termSecond term Cannot be taken as part of an examination contract

Aims

  • Understanding of using chemical methods and components and their analyses to study and manipulate biological systems
  • Understanding of the use of click-chemistry and bio-orthogonal reactions in livings systems (Carolyn Bertozzi, Nobel price 2022)

Previous knowledge

Basic knowledge in biochemistry as acquired in G0N04C Celbiologie en biochemie, G0N08A Bio-organische chemie, G0O55A Chemie van Natuurproducten and G0N20E Dynamische biochemie, or equal courses.

Is included in these courses of study

Onderwijsleeractiviteiten

Chemical Biology (B-KUL-G00D5a)

3 ECTS : Lecture 26 Second termSecond term

Content

  • Substrate analogs (IPTG, X-gal, enzyme inhibitors...)
  • Chemical mutagens (MMS...)
  • Chemical cross-linkers
  • Chemical labeling techniques (biotinylation, click chemistry...)
  • Artificial metabolites
  • Artificial amino acids (and nucleotides?)
  • ... used in research and in vitro/in vivo applications

Course material

Slides, recordings

Evaluatieactiviteiten

Evaluation: Chemical Biology (B-KUL-G20D5a)

Type : Exam during the examination period
Description of evaluation : Oral, Written
Type of questions : Open questions

Explanation

The final exam is closed-book with written preparation and oral explanation.

ECTS Practicum: synthese en analyse van biomoleculen (B-KUL-G00D6A)

3 studiepunten Nederlands 54 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract
N.

Doelstellingen

  • de basismechanismen herkennen van de organische chemie zoals die gezien werden in G0N08A Bio-organische chemie en G0O55A Chemie van natuurproducten.
  • op basis van een uitgeschreven handleiding met kennis van zaken een eenvoudige organische synthese van een natuurproduct kunnen uitvoeren binnen een beperkt tijdsbestek.
  • de algemene concepten kennen van de organische chemie en die kunnen toepassen in biochemische reactiewegen en de biosynthese van natuurproducten. Deze concepten bieden een basisinzicht in het fundamenteel organisch-chemisch verloop van biochemische reacties met nadruk op de reactiemechanismen.
  • op een kwaliteitsvolle manier een product na synthese kunnen opzuiveren en karakteriseren.

Begintermen

Basiskennis in de organische chemie, biochemie en moleculaire biologie

Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



GELIJKTIJDIG(G0O55B )


G0O55BG0O55B : Chemie van natuurproducten

Onderwijsleeractiviteiten

Practicum: Synthese en Analyse van Biomoleculen (B-KUL-G00D6a)

3 studiepunten : Practicum 54 Tweede semesterTweede semester
N.

Inhoud

  • Isolatie van R-(+)-limoneen uit appelsienschil door stoomdestillatie
  • Extractie van cafeïne uit thee
  • Synthese van het kopercomplex van tetrafenylporfyrine
  • Synthese van 2-propionylcyclohexanon: toepassing op enamines
  • Enzymatische resolutie van 1-fenylethanol
  • Meerstapssynthese van een peptidomimeticum
  • Biosynthese van vanille in E. coli (KU Leuven iGEM 2008)
  • Biotinelabeling?

Studiemateriaal

Practicumhandleiding

Laboschrift

Toelichting werkvorm

Laboratoriumactiviteit onder begeleiding van assistenten

Voorbereiding met prelab.

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Practicum: synthese en analyse van biomoleculen (B-KUL-G20D6a)

Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Verslag, Medewerking tijdens contactmomenten, Vaardigheidstoets
Leermateriaal : Cursusmateriaal

Toelichting

Practica (on-campus en online opdrachten hieraan verbonden) zijn verplicht. Ongewettigde afwezigheid of het niet inleveren van opdrachten, zal resulteren in "NA - niet afgelegd".

 

Studenten die zich onvoldoende voorbereid voor een practicumsessie aandienen, kunnen de toegang tot het practicum worden ontzegd.

 

Permanente evaluatie door assistenten/docenten: voorbereiding (prelab test) (30% gewicht), resultaten (30% gewicht), werkhouding (10% gewicht).

Toelichting bij herkansen

 

ECTS Medische Biotechnologie (B-KUL-G00D7A)

5 studiepunten Nederlands 30 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

Doelstellingen

Kennis en inzicht
Dit opleidingsonderdeel draagt bij tot:
-   kennis en inzicht in de medische biotechnologie en moleculaire geneeskunde, met een focus op gentransfer en genetische manipulatie in cellen en proefdieren, en gentherapie bij de mens

- kennis, inzicht en kunnen toepassen van technieken voor het bestuderen van de cellulaire processen van gezonde en zieke cellen, weefsels en organismen

- kennis, inzicht en kunnen toepassen van technieken die worden gebruikt bij het uitvoeren van wetenschappelijk onderzoek, voor het maken van cellulaire en proefdiermodellen, en bij het bestuderen/ontrafelen van het moleculaire mechanisme van menselijke aandoeningen

- kennis en inzicht in de meest recente onderzoeksmethoden en -technieken in biomedisch wetenschappelijk onderzoek en hun toepassing bij de studie van menselijke aandoeningen in normale en ziekteomstandigheden.
- kennis, inzicht in de huidige portfolio aan gentransfer en gentherapie mogelijkheden voor humane toepassingen op de markt

- kennis, inzicht in ethische aspecten rond het gebruik van proefdieren in wetenschappelijk onderzoek voor biomedische doeleinden

- kennis, inzicht in ethische aspecten rond het gebruik van gentransfer methodes en technologie
- kennis, inzicht in veiligheidsaspecten van gentransfer methoden in biomedisch wetenschappelijk onderzoek (regelgeving en zorgvuldig omgaan met biologisch/chemisch materiaal)


Vaardigheden
Dit opleidingsonderdeel brengt de volgende vaardigheden bij:
Informatievaardigheden
-   initiatie om relevante gegevens (literatuur, onderzoeksdata) binnen het (biomedische) vakgebied te verzamelen en te analyseren.
Communicatievaardigheden
- Wetenschappelijke literatuur/stellingen op constructieve basis bediscussiëren en beargumenteren
Attitudes
De afgestudeerde geeft blijk van
-   een integere en constructief-kritische houding
-   een respectvolle en verantwoordelijke houding tegenover medestudenten en anderen

De afgestudeerde kan

- deze kennis en inzichten toepassen voor het ontwikkelen van een cel- of proefdiermodel

- deze kennis en inzichten toepassen voor het ontwikkelen van een gentransfer of gentherapeutische aanpak

 

In dit opleidingsonderdeel krijgen de studenten inzicht in de mogelijkheden, de werking en ontwikkeling van recombinante DNA, gentransfer- en gentherapeutische technieken in het biomedisch onderzoek en hun toepassingen in de geneeskunde. De verschillende procedures en hun onderliggende mechanismen zullen behandeld en geïllustreerd worden met recente voorbeelden. 

 

Begintermen

Kennis van en inzicht in de moleculaire genetica en basistechnieken in de moleculaire (cel)biologie

Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



GELIJKTIJDIG( G0O53C ) OF GELIJKTIJDIG( X0B26B )


G0O53CG0O53C : Moleculaire biologie
X0B26BX0B26B : Moleculaire biologie

Identieke opleidingsonderdelen

E05E2A: Medische biotechnologie: genetische manipulatie bij proefdieren en gentherapie
U05D8A: Medische biotechnologie: genetische manipulatie bij proefdieren en gentherapie

Onderwijsleeractiviteiten

Medische biotechnologie: genetische manipulatie bij proefdieren en gentherapie (B-KUL-G00D7a)

5 studiepunten : College 30 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

1) Genetische manipulatie van dieren
-    Zygootinjectie in zoogdieren
Methodologie en procedures; Karakterisatie van transgene dieren; Alternatieve procedures; Toepassingen (overexpressie, suppressie, conditionele wijzigingen, etc.)
-    Gerichte genwijzigingen (‘Gene targeting’)
Elementen en constructie van een targeting vector; Types van wijzigingen (knockout, mutatie, weefsel-specifieke en induceerbare wijzigingen, cre/lox, gene trapping); Embryonale stamcellen; Homologe recombinatie; Blastocyt injectie en embryo aggregatie; Kiembaan transmissie; Karakterisatie van genetisch gemanipuleerde muizen; Gerelateerde procedures (embryo & sperma vriezen, in vitro embryo cultuur, etc); Toepassingen
- Gene silencing & gene activation
Antisense strategieën (RNA interference, morfolino oligomer knockdown); Artificiële transcriptiefactoren; Toepassingen
-    Large-scale mutagenese
Forward & reverse genetics; Large-scale ENU mutagenese; TILLING
-    Nuclear transfer (cloning): Principe; Toepassingen

2) rDNA/rProteïne productie
-    Prokaryotische en eukaryotische expressie-systemen;
Toepassingen: Diagnostica, Therapeutische moleculen (farmaca, enzymes, antilichamen, vaccins), Commerciële producten

3) Gentherapie
-    Klassieke Gentherapie
Ex vivo en in vivo gentherapie; Virale vector systemen (adenovirale, adeno-geassocieerde virale, (onco)retrovirale, lentivirale, herpes simplex virale vectoren); Non-virale vector systemen (directe injectie, liposomen, receptor-gemedieerde endocytose); Recente ontwikkelingen: replicerende episomale vectoren en artificiële chromosomen
-    Alternatieve gentherapieën gebaseerd op gerichte gen-inactivering of mutatie-correctie
Expressie inhibitie; Therapeutische correctie op DNA niveau; Therapeutische correctie op RNA niveau
-    Gentherapie voor erfelijke ziekten
Mucoviscidose; ADA-SCID; hypercholesterolemie; hemofilie; a1-antitrypsine deficiëntie
-    Gentherapie tegen kanker
Overexpressie van tumor-suppressor genen; inactivering van oncogenen; prodrug therapie; immunotherapie
-    Gentherapie tegen chronische infectieziekten
Therapeutische aanpak bij AIDS/HIV; Hepatitis

4) Celtherapie
-   Stamcellen
Omnipotent, pluripotent, autoloog, allogeen, nucleaire transfer, induced pluripotent stamcellen, fate mapping, dedifferentiatie en transdifferentiatie; Toepassingen

5) Xenotransplantatie
-   Donordieren
mogelijke risico’s en oplossingen

Studiemateriaal

Powerpoint presentaties
Besproken wetenschappelijke publicaties

Eigen nota’s

Toelichting werkvorm

Hoorcollege met actieve interactie
In beperkte mate: opdrachten, incluis lezen van en discussie over wetenschappelijke publicaties.

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Medische Biotechnologie (B-KUL-G20D7a)

Type : Examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Mondeling, Schriftelijk
Vraagvormen : Open vragen, Gesloten vragen

Toelichting

Evaluatievorm: gesloten boek; mondeling met schriftelijke voorbereiding
Over de leerstof van beide docenten wordt geëxamineerd op hetzelfde examenmoment. Beide delen leerstof wegen gelijk; vragen gespreid over de leerstof. De studenten kunnen de antwoorden schriftelijk voorbereiden, en daarna mondeling toelichten bij de betreffende docent.

ECTS Anorganische Chemie (B-KUL-G00D8A)

6 studiepunten Nederlands 40 Tweede semesterTweede semester

Doelstellingen

Het opleidingsonderdeel “Anorganische Chemie” introduceert belangrijke concepten uit de anorganische chemie, die studenten in staat stellen om voorspellingen te doen over de structuur en stabiliteit van anorganische verbindingen, evenals over de ligging van het chemisch evenwicht bij complexvormingsreacties en redoxreacties.  De specifieke doelstellingen van de cursus “Anorganische Chemie” zijn:

 

- Doelstelling 1: De studenten kunnen structuren van anorganische verbindingen beschrijven aan de hand van dichtste bolstapelingen of verbonden polyeders, en ze kunnen geometrische berekeningen over deze structuren uitvoeren

- Doelstelling 2: De studenten kunnen het donor-acceptor concept gebruiken om experimentele waarnemingen in de anorganische chemie te verklaren

- Doelstelling 3: De studenten kunnen het verband leggen tussen de opsplitsing van d-orbitalen en de elektronische, magnetische en thermodynamische eigenschappen van transitiemetaalverbindingen

- Doelstelling 4: De studenten kunnen elektronentelregels toepassen op organometaalcomplexen

- Doelstelling 5: De studenten kunnen evenwichtsconstanten en standaardreductiepotentialen berekenen aan de hand van standaard thermodynamische grootheden en thermodynamische cycli

- Doelstelling 6: De studenten kunnen experimenten ontwerpen voor de bepaling van stabiliteitsconstanten van metaalcomplexen

- Doelstelling 7: De studenten kunnen eenvoudige Pourbaixdiagrammen berekenen

- Doelstelling 8: De studenten kunnen speciatiediagrammen en Pourbaixdiagrammen berekenen met thermodynamische software en deze diagrammen interpreteren

Begintermen

De studenten zijn vertrouwd met grondslagen van de chemie en de chemische thermodynamica

Identieke opleidingsonderdelen

X0D07B: Anorganische Chemie
G0O29B: Metalen en katalyse

Onderwijsleeractiviteiten

Anorganische Chemie: hoorcollege (B-KUL-G00D8a)

4 studiepunten : College 24 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

  • Anorganische structuurchemie: bolstapelingen en verbonden polyeders
  • Donor-acceptor interacties (inclusief Lewis zuren-basen, HSAB)
  • Opsplitsing van d-orbitalen en gevolgen voor transitiemetaalchemie
  • Elektronentelregels voor organometaalverbindingen
  • Meting en berekening van stabiliteitsconstanten
  • Meting en berekening van standaardreductiepotentialen
  • Speciatiediagrammen van metaalcomplexen
  • Pourbaixdiagrammen

 

Studiemateriaal

Cursusnota’s en slides

Dit materiaal wordt ter beschikking gesteld op Toledo.

Anorganische Chemie: oefeningen (B-KUL-G00D9a)

2 studiepunten : College 16 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

De oefeningen bij de cursus “Anorganische Chemie” zijn in de eerste plaats bedoeld om de theorie aan de hand van voorbeelden verder te illustreren.

  • Berekeningen met bolstapelingen
  • Toepassing van elektronentelregels
  • Gevolgen van opsplitsing van d-orbitalen
  • Thermodynamische berekeningen van stabiliteitsconstanten en standaardreductiepotentialen
  • Stapsgewijze berekening en interpretatie van Pourbaix-diagrammen
  • Berekening van speciatiediagrammen en Pourbaix-diagrammen met Hydra/Medusa software

 

Studiemateriaal

Cursusnota’s en slides

Dit materiaal wordt ter beschikking gesteld op Toledo.

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Anorganische Chemie (B-KUL-G20D8a)

Type : Examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Open vragen, Gesloten vragen
Leermateriaal : Cursusmateriaal, Rekenmachine

Toelichting

 

Schriftelijk examen

Het punt voor dit vak is de som van de deelpunten op de verschillende vragen.

ECTS Computationele Biochemie (B-KUL-G00F3A)

6 studiepunten Nederlands 26 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract
N.

Doelstellingen

Na dit vak te hebben gevolgd zal de student:

• de basiswerking van een computer begrijpen. Hij of zij heeft een goed begrip van welke taken geschikt zijn om met behulp van een computer te worden uitgevoerd.

• de belangrijkste elementen van een algoritme kennen, en zal de efficiëntie van een programma in algemene termen kunnen evalueren.

• weten hoe gegevens die relevant zijn voor een bepaald biochemisch probleem kunnen worden geabstraheerd en opgeslagen in een geschikte gegevensstructuur, gebruikmakend van bestaande gegevenstypen of speciale gegevensstructuren.

• in staat zijn werkende programma's te schrijven voor eenvoudige of middelzware problemen, gebruikmakend van een programmeertaal zoals Python.

• zijn of haar eigen code kunnen koppelen aan geschikte bibliotheekfuncties.

• code kunnen gebruiken om toegang te krijgen tot relevante online biochemische gegevensbronnen.

• een biochemisch probleem kunnen aanpakken met behulp van computationele methoden.

Het vak wordt helemaal via blended learning gedoceerd.

De bedoeling is om de verscheidenheid aan taken die relevant zijn voor biochemici en die met computers aangepakt kunnen worden te bestuderen.

Begintermen

Algemene kennis van biochemie. Er wordt geen kennis van programmeren verwacht.

Onderwijsleeractiviteiten

Computationele Biochemie: Inleiding (B-KUL-G00F3a)

1 studiepunten : College 4 Tweede semesterTweede semester
N.

Inhoud

Beginselen van het programmeren, en het nut van computationele methoden in de biochemie.

Studiemateriaal

Video’s en slides met de nodige theoretische achtergrond zullen via Toledo beschikbaar worden gemaakt.

Toelichting werkvorm

Blended onderwijs

De eerste sessies van dit vak worden al met ‘blended learning’ gedoceerd, maar lijken meer op een traditioneel hoorcollege. Het werken van een computerprogramma wordt uitgelegd in algemene termen, en het nut van computationele methoden wordt via voorbeelden uitgelegd.

Computationele Biochemie: Oefeningen (B-KUL-G00F4a)

5 studiepunten : Practicum 22 Tweede semesterTweede semester
N.

Inhoud

Praktische oefeningen, met momenten waar feedback gegeven wordt aan de hele groep.

Programmeren van eenvoudige algemene taken.

Gebruik van bibliotheken van functies, en koppeling met databases.

Oplossen van een biochemisch probleem door een programma te schrijven.

Studiemateriaal

Materiaal voor computeroefeningen, beschikbaar via Toledo.

Toelichting werkvorm

Blended onderwijs - Oefensessie - PC-sessie

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Computationele Biochemie (B-KUL-G20F3a)

Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Self assessment/Peer assessment, Vaardigheidstoets
Vraagvormen : Open vragen
Leermateriaal : Cursusmateriaal, Computer

Toelichting

Formatieve feedback wordt tijdens de praktische sessies gegeven. De studenten evalueren zichzelf voor hun werk tijdens de oefensessies. Summatieve evaluatie gebeurt via twee vaardigheidstoetsen die op een computer worden afgenomen. De toetsen vinden plaats zonder internettoegang.

ECTS Een socio-ecologische inleiding tot duurzaamheid (B-KUL-G0D70A)

3 studiepunten Nederlands 20 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

Doelstellingen

1. Leerdoelen

De student kan de betekenis en samenhang van de ‘Megatrends’ en hun achtergrond, de ‘Sustainable Development Goals’, de ‘Sustainability Doughnut’ en de ‘Planetary Boundaries’ verwoorden.

De student kan de discussie over de termen ‘duurzaamheid’ en ‘duurzame ontwikkeling’ duiden.

De student kan zowel de ecologische, economische, sociale, ethische als culturele dimensies van duurzaamheidskwesties concreet illustreren.

De student kan een aantal maatregelen in het domein van de eigen discipline die geschikt zijn om duurzaamheid te vergroten, opsommen, en toelichten welke impact ze (kunnen) hebben.

De student kan diversiteit en een open ethiek als basiskenmerk van ‘cultures of sustainability’ verder toelichten vanuit de idee van veerkracht en systeemdenken in een sociaal-maatschappelijke context.

De student kan systeemdenken (beperkt) toepassen bij het kritisch bekijken en vervolgens beoordelen van duurzaamheidscontroverses aangebracht in de media.

De student kan het belang van transdisciplinaire samenwerking en teamwerk in het kader van duurzaamheid en duurzame ontwikkeling voor specifieke cases aangebracht in krantenartikels uitleggen, door concrete relevante onderzoeksvragen van diverse wetenschapsdomeinen te verwoorden.

 

2. Vormingsdoelen

De student kan een respectvolle discussie over aspecten van duurzaamheid voeren met studenten uit de eigen zowel als uit andere disciplines, en getuigt hierbij van zorgvuldigheid, verantwoordelijkheidszin en een ethische ingesteldheid.

De student is bereid en in staat om op een kritische wijze deel te nemen aan de maatschappelijke discussie omtrent duurzaamheid vanuit de eigen expertise in haar/zijn discipline.

De student is ‘actiecompetent’, m.a.w. de cursus heeft capaci­teiten én het engagement bijgebracht om actief bij te dragen aan het aanpakken van de structurele oorzaken van duurzaamheidskwesties.

 

Identieke opleidingsonderdelen

G0D70B: Een socio-ecologische inleiding tot duurzaamheid

Plaats in het onderwijsaanbod

Onderwijsleeractiviteiten

Een socio-ecologische inleiding tot duurzaamheid: theorie (B-KUL-G0D70a)

1 studiepunten : College 10 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

In dit onderdeel worden de verschillende aspecten van het begrip duurzaamheid (ecologisch, sociaal, economisch) toegelicht. Daarnaast wordt de methodologie aangebracht om duurzaamheidskwesties te leren doorgronden en er mee om te gaan of een oplossing ervoor na te streven (systeemdenken, transdisciplinariteit, de honest broker positie, ‘political moves’ herkennen, de betekenis van bestaande machtsverhoudingen en ideologieën inschatten). Dit alles gebeurt op basis van feitenkennis in verband met de ‘Megatrends’, de ‘Planetary Boundaries’, de ‘Sustainability Doughnut’ en de ‘Sustainable Development Goals’. Hierbij zal ook aandacht besteed worden aan specifieke disciplinaire aspecten, gekaderd in een bredere systemische en transdisciplinaire context.

Studiemateriaal

Cursustekst, colleges, slides, artikels, SPOC on-line leermodules.

Een socio-ecologische inleiding tot duurzaamheid: opdracht (B-KUL-G0D71a)

2 studiepunten : Opdracht 10 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

In dit onderdeel worden de studenten in interdisciplinaire teams verdeeld. Ze krijgen een aantal opdrachten aansluitend bij de theorie te vervullen, in en buiten de contactmomenten, om vaardigheden relevant voor duurzaamheid te verkennen. Anderzijds geven ze elkaar en de docenten feedback, tijdens en na het leerproces dat ze doorlopen.

Studiemateriaal

Syllabus en media-materiaal, materiaal in de toledo-leeromgeving, discussie/praktijk-sessies

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Een socio-ecologische inleiding tot duurzaamheid (B-KUL-G2D70a)

Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Paper/Werkstuk, Presentatie, Self assessment/Peer assessment
Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen, Gesloten vragen
Leermateriaal : Cursusmateriaal

Toelichting

De evaluatie bestaat uit twee delen: een vormend proces in teamverband (deels gescoord via peer-evaluatie, en telt mee voor 6 van de 20 delen van de examenscore), en een afrondend, individueel te schrijven essay (buiten de examenperiode (net voor of tijdens de blokperiode), en dit telt mee voor 14 van de 20 delen van de examenscore). Wanneer meerkeuze-vragen worden gebruikt, wordt gis-correctie toegepast.

Elke student dient aan elk van de onderdelen deel te nemen om te kunnen slagen voor het geheel. Er is geen herkansing mogelijk voor het vormend proces dat in teamverband tijdens het jaar wordt doorlopen. De score van dit onderdeel wordt bij een herkansing overgedragen vanuit de eerste zittijd. Bijdrage in de evaluatie van dit procesonderdeel blijft 6 van de 20 punten bij een herkansing.

Toelichting bij herkansen

Er is geen herkansing mogelijk voor het vormend proces dat in teamverband tijdens het jaar wordt doorlopen. De score van dit onderdeel wordt bij een herkansing overgedragen vanuit de eerste zittijd. Bijdrage in de evaluatie van dit procesonderdeel blijft 6 van de 20 punten bij een herkansing.

ECTS Wetenschapscommunicatie: biochemie en biotechnologie (B-KUL-G0D93A)

3 studiepunten Nederlands 22 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

Doelstellingen

Opgelet: dit opleidingsonderdeel kan enkel gevolgd worden door studenten van de Faculteit Wetenschappen.

Na dit opleidingsonderdeel zijn de studenten vertrouwd met het gebruik van het Nederlands én Engels als taal in een communicatie over wetenschappen.

De studenten moeten in staat zijn om:

- de criteria te identificeren waaraan technisch-wetenschappelijke vakteksten en populair-wetenschappelijke teksten beantwoorden;

- de criteria voor populair- en/of technisch wetenschappelijke teksten zelf toe te passen bij het uitwerken van dergelijke teksten

- de wetenschappelijke schrijfstijl te hanteren bij het schriftelijk rapporteren van wetenschappelijk onderzoek en een wetenschappelijke tekst logisch en samenhangend structureren

- wetenschappelijke ideeën of concrete resultaten van metingen of berekeningen e.d. duidelijk te kunnen formuleren in een zakelijke tekst met correcte bronvermelding én dit in de taal die gangbaar is binnen het wetenschappelijk domein, en hierover mondeling te communiceren.

Begintermen

Studenten kunnen dit opo enkel opnemen nadat ze min. 51 stp behaald of getolereerd hebben van de 1ste bachelorfase.

De Nederlandse taal correct kunnen spreken en schrijven.
Engelstalige teksten kunnen lezen en begrijpen.

Voor de studenten van de bachelor Geografie en bacheolor Geologie geldt dat dit opo enkel opgenomen kan worden indien ze het opo G0O69B 'Fysische geografie' gevolgd hebben of aan het volgen zijn. De studenten hebben de kennis van fysische geografie nodig voor het zelfstudieluik van G0N14A.

Volgtijdelijkheidsvoorwaarden

129

Identieke opleidingsonderdelen

G0M75A: Wetenschapscommunicatie: biologie
G0D81A: Wetenschapscommunicatie: informatica
G0D83A: Wetenschapscommunicatie: wiskunde
G0D85A: Wetenschapscommunicatie: fysica
G0D87A: Wetenschapscommunicatie: geologie
G0D89A: Wetenschapscommunicatie: chemie
G0D91A: Wetenschapscommunicatie: geografie
X0E15A: Wetenschapscommunicatie voor biowetenschappen
X0E17A: Wetenschapscommunicatie: chemie
X0E19A: Wetenschapscommunicatie: fysica
X0E21A: Wetenschapscommunicatie: informatica
X0E25A: Wetenschapscommunicatie: wiskunde

Onderwijsleeractiviteiten

Wetenschapscommunicatie: biochemie en biotechnologie: hoorcollege (B-KUL-G0D93a)

0.8 studiepunten : College 6 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

1. Schrijven over wetenschappelijk onderzoek:

- wetenschappelijk of technisch rapport
- populair-wetenschappelijke tekst
 
2. Mondeling communiceren:
- algemene aspecten van mondelinge communicatie
- praktische regels voor het maken van een presentatie

 

Studiemateriaal

Crauwels M. & West L. 2007. Wetenschap communiceren. Tips voor het schrijven en presenteren van wetenschappelijk onderzoek. ACCO, 169p.

Wetenschapscommunicatie: biochemie en biotechnologie: oefeningen (B-KUL-G0D94a)

2.2 studiepunten : Opdracht 16 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

Door middel van schrijf- en presentatie-opdrachten leren studenten mondeling en schriftelijk communiceren over onderwerpen uit de biochemie en biotechnologie. Tijdens de inleidende werkcolleges krijgen de studenten toelichting bij de uit te voeren opdrachten.

Studenten moeten een populair-wetenschappelijke tekst in het Nederlands schrijven en een technisch-wetenschappelijke samenvatting in het Engels. Zij moeten ook een mondeling presentatie geven, die gefilmd wordt. 

Studenten moeten feedback geven op elkaars teksten, en een zelf-reflectie schrijven over hun presentatie. Vervolgens moeten zij de feedback actief verwerken tot een nieuwe tekstversie.

De docent geeft feedback op de tekst en beoordeelt de kwaliteit van de peer-feedback en van de zelfreflectie.

Tot slot moeten de studenten finale versies van de tekst inleveren en een finale presentatie geven.

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Wetenschapscommunicatie: biochemie en biotechnologie (B-KUL-G2D93a)

Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Paper/Werkstuk, Presentatie, Medewerking tijdens contactmomenten
Leermateriaal : Cursusmateriaal

Toelichting

Dit opo maakt deel uit van de leerlijn academische taalvaardigheid. Zowel in de schrijf- als in de presentatieopdrachten wordt academische taalvaardigheid geëvalueerd. Studenten maken reflectieopdrachten over taalvaardigheid in een taalportfolio.

Studenten dienen aan alle leeractiviteiten deel te nemen en alle opdrachten uit te voeren. Afwezigheden moeten gewettigd zijn met een doktersattest.
Meer gedetailleerde informatie over de evaluatie wordt gegeven tijdens de werkcolleges die per discipline worden georganiseerd.

Toelichting bij herkansen

De tweede examenkans bestaat uit de herwerking van het ontwerp/product. Deelname en/of presentaties kunnen niet hernomen worden. Voor een student die in de loop van het academiejaar niet voldeed aan de aanwezigheidsplicht of geen presentatie heeft gegeven, blijft de score "niet afgelegd" (NA) behouden.

ECTS Vergelijkende ontwikkelingsbiologie (B-KUL-G0M33D)

3 studiepunten Nederlands 33 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

Doelstellingen

(1) Op een vergelijkende manier (in diverse modelorganismen) een 3-dimensionaal inzicht verwerven in algemene ontwikkelingsbiologische processen:
- de vroege ontwikkeling vanaf de bevruchting: fertilisatie, klieving en gastrulatie en neurulatie
- de organogenese vanaf de drie kiembladen bij zoogdieren. 
(2) Basisprincipes van de moleculaire processen van ontwikkelingsbiologie begrijpen
(3) Vertrouwd geraken met hedendaagse moleculaire onderzoeksmethodes aan de hand van voorbeelden in de les en een paperopdracht.
(4) Leren discussie voeren omtrent algemene ontwikkelingsbiologische probleemstellingen (bvb. stamcelonderzoek, regeneratie). 
(5) Het practicum heeft naast interpreterend observeren als bijkomend doel de studenten te verplichten tot 3-dimensioneel denken, vertrekkend van 2-dimensionele seriële coupes. Afwisselend met digitale practica gaan de studenten zelf aan de slag in het labo, o.a. met dissecties, stereomicroscopie en het zelf maken van kleimodellen. 
(6) Leren hoe genfunctie onderzoek verloopt aan de hand van een individuele opdracht in het Engels.

Begintermen

Algemene basiskennis van dierkunde en biodiversiteit bij dieren zoals aangeboden in het opleidingsonderdeel " Bouw en functie van dieren" en "diversiteit van dieren" of equivalent.

Identieke opleidingsonderdelen

X0D18B: Ontwikkelingsbiologie
G0M33C: Vergelijkende ontwikkelingsbiologie
X0D18A: Ontwikkelingsbiologie

Onderwijsleeractiviteiten

Vergelijkende ontwikkelingsbiologie: hoorcollege (B-KUL-G0M33a)

2.1 studiepunten : College 18 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

De cursus gaat dieper in op basisaspecten van de ontwikkelingsbiologie, met een focus op vertebraten ontwikkeling. We vertrekken vanuit een vergelijkende benadering van fertilisatie en morfologische aspecten van vroege embryonale ontwikkeling, van klievingsdelingen tot en met neurulatie. Hierna volgt een inleiding tot de moleculaire principes van ontwikkeling, waarna deze worden geïllustreerd aan de hand van voorbeelden uit de vroege ontwikkeling. Organogenese wordt eveneens inleidend behandeld aan de hand van voorbeelden uit verschillende kiembladen. We ronden af met twee hoofdstukken over stamcellen en regeneratie.  

Deze cursusinhoud is afgestemd op de inhoud van het verplichte practicum.

Studiemateriaal

Lesslides beschikbaar op Toledo.

Boek "Developmental Biology" 11th edition, Gilbert en Barresi

Toelichting werkvorm

Interactief hoorcollege

Vergelijkende ontwikkelingsbiologie: practicum (B-KUL-G0M34a)

0.9 studiepunten : Practicum 15 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

Het practicum sluit aan bij en ondersteunt het hoorcollege.
Tijdens practica worden volgende topics begeleid uitgewerkt:

Module 1: Moleculaire technieken in biologisch onderzoek (digitaal)

Module 2: Vroege embryonale ontwikkeling van de kikker (digitaal en praktisch)

Module 3: Embryonale ontwikkeling en organogenese van de muis (digitaal en praktisch)

Studiemateriaal

Moleculaire technieken (digitaal aangeboden)

Research papers

Embryonale stadia van kikker en muis

Online atlas muis

Toelichting werkvorm

Practicum

Online opdrachten

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Vergelijkende ontwikkelingsbiologie (B-KUL-G2M33d)

Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk, Paper/Werkstuk
Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen, Gesloten vragen

Toelichting

De punten van het vak zijn als volgt verdeeld: practicum: 6/20, theorie: 14/20. Om te kunnen slagen voor het vak moet je minstens 10/20 behalen als eindscore en slagen op zowel de onderdelen practicum en theorie. Het practicum wordt geëvalueerd in deelopdrachten met deadlines. Het niet halen van de deadline resulteert in 0 op de deelopdracht.

Toelichting bij herkansen

Voor het theorie of practicumonderdeel kan vrijstelling bekomen worden mits geslaagd. Modaliteiten van practicum herkansing dienen besproken te worden met de docent. 

ECTS Grondslagen van de chemie (B-KUL-G0N01C)

9 studiepunten Nederlands 87 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract
Clays Koen (coördinator) |  Clays Koen |  Depotter Griet |  Dirix Carolien

Doelstellingen

Studenten kunnen:
(theorie)

- alle aangeleerde principes (zie inhoud) op een gestructureerde manier uitleggen, met inbegrip van figuren, afleidingen, berekeningen
- verbanden leggen tussen de gezien hoofdstukken/delen van de cursus, met inbegrip van figuren, afleidingen en berekeningen.
(oefeningen)
- gecombineerde berekeningen uitvoeren aan de hand van alle aangeleerde principes, met correct gebruik van eenheden.
(practica)
- een aantal praktische chemische basisvaardigheden op een correcte, nauwkeurige en veilige manier uitvoeren.
- experimentele waarnemingen interpreteren en experimentele resultaten verwerken.
- resultaten van een experiment correct rapporteren.

-  een aantal maatregelen in het domein van de chemie die geschikt zijn om duurzaamheid te vergroten, opsommen, en toelichten welke impact ze (kunnen) hebben.

Identieke opleidingsonderdelen

X0E41A: Grondslagen van de chemie
X0C33C: Grondslagen van de chemie

Onderwijsleeractiviteiten

Grondslagen van de chemie: hoorcollege 1 (B-KUL-G0N01a)

3.3 studiepunten : College 26 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

INLEIDING: SITUERING EN IMPACT VAN DE CHEMIE

 

DEEL A.  DE WERELD VAN ATOMEN EN MOLECULEN

A.1.    Atoomstructuur

A.2.    Periodiciteit van atomaire eigenschappen

A.3.    De chemische binding

 

DEEL B. GASSEN, VLOEISTOFFEN, VASTE STOFFEN EN MENGSELS

B.1.     Intermoleculaire krachten

B.2.     Gassen en gasmengsels

B.3.     Vloeistoffen

B.4.     Vaste stoffen

B.5.     Mengsels

 

DEEL C. CHEMISCHE KINETICA

C.1.    Concentratie en snelheid: de differentiale en de integrale vorm van de snelheidsvergelijking

C.2.    De botsingstheorie en factoren die de reactiesnelheid beïnvloeden

C.3.    Reactiemechanismes

 

DEEL D. CHEMISCHE THERMODYNAMICA

D.1.    De reversibiliteit van scheikundige reacties, het dynamische evenwicht

D.2.     Rekenen met de evenwichtsconstante Kev, de reactiequotiënt Q en de omzettingsgraad a.

D.3.    Energetische aspecten van het chemisch evenwicht

D.4.    Entropische aspecten van het chemisch evenwicht

D.5.    Vrije energie G

D.6.    Verband thermodynamica (deel D) – kinetica (deel C)

 

DEEL E. EVENWICHTSREACTIES

 

E.1.      Zuur-base-reacties als protontransferreacties

E.1.1.   Zuren en basen in de Brönsted-Lowry theorie

E.1.2.   Protontransferreactie

E.1.3.   De autoprotolyse van water

E.1.4.   De pH-schaal en de pH van oplossingen

E.1.5.   De pOH van oplossingen

E.1.6.   Zwakke zuren en zwakke basen in water

E.1.7.   Zuur(dissociatie)constante Ka en base(ionisatie)constante Kb

E.1.8.   De sterkte van zuren in water

E.1.9.   De pH van waterige oplossingen van zwakke zuren en basen

E.1.10. De pH van waterige oplossingen van een polyprotisch zuur

E.1.11. Anorganische verbindingen die, opgelost in water, zure of basische eigenschappen vertonen

E.1.12. Buffers

 

E.2.      Redoxreacties als elektrontransferreacties

E.2.1.   Oxidantia en reductantia

E.2.2.   Redoxhalfreacties, beter “reductiehalfreacties”

E.2.3.   Het schrijven van de reductiehalfreacties voor een gegeven Ox/Red koppel

E.2.4.   Het koppelen van reductiehalfreacties voor het schrijven van redoxreacties

E.2.5.   Galvanische cellen

E.2.6.   De celpotentiaal, ook wel bronspanning genoemd

E.2.7.   De celpotentiaal E en de standaard vrije energie G

E.2.8.   Het verband tussen de evenwichtsconstante voor een redoxreactie en het verschil in standaardredoxpotentiaal voor de halfreacties

E.2.9.   De Nernstvergelijking

 

E.3.      Verband tussen protontransferreacties en elektrontransferreacties

E.3.1.   Reductiehalfreacties in zuur, neutraal of basisch milieu

 

E.4.     Neerslagreacties

E.4.1.         De moleculaire aard van oplossen

E.4.2.         De oplosbaarheid van ionische verbindingen in water als solvent

E.4.3.         De oplosbaarheid en het oplosbaarheidsproduct

 

E.5.     Complexatiereacties

E.5.1.    Stabiliteitsconstante of dissociatieconstante voor complexe ionen

E.5.2.     Overzicht van mogelijke liganden

E.5.3.     Het centraal kation

E.5.4.     Het coördinatiegetal

E.5.5.     De drijfveer voor het vormen van complexe ionen

E.5.6.     Factoren die KST beïnvloeden

E.5.7.     Liganduitwisselingsreacties - complexatiereacties in water

 

E.6.     Globaal verband tussen de verschillende soorten evenwichtsreacties

E.6.1.    Kwalitatief verband

 

In dit opleidingsonderdeel maakt de student ook kennis met de relevantie en hedendaagse uitdagingen van de chemie.

 

Studiemateriaal

Book of Data, Revised Nuffield Advanced Science, Longman Group, 166pp.

Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

G0N01D : Grondslagen van de chemie

Grondslagen van de chemie: hoorcollege 2 (B-KUL-G0N38a)

1.1 studiepunten : College 9 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

DEEL E. EVENWICHTSREACTIES

 

E.1.        Zuur-base-reacties als protontransferreacties

E.1.13.    pH indicatoren

E.1.14.    Titraties

 

E.2.      Redoxreacties als elektrontransferreacties

E.2.10. Concentratiecellen

E.2.11. Practische, (primaire, niet oplaadbare) cellen

E.2.12. Electrolyse en de elektrolysewetten van Faraday

E.2.13. Secundaire, wel heroplaadbare, batterijen

 

E.3.      Verband tussen protontransferreacties en elektrontransferreacties

E.3.2.    Opeenvolgende halfreacties en hun standaardredoxpotentialen

E.3.3.    Reactiemechanisme en katalyse bij redoxreacties

E.3.4.    Electrolyse van waterige oplossingen

E.3.5.    Redoxindicatoren

E.3.6.    Redoxtitraties

 

E.4.       Neerslagreacties

E.4.4.    Het verband tussen oplosbaarheid en de pH

E.4.5.    Het verband tussen oplosbaarheid en de redoxpotentiaal

 

E.5.       Complexatiereacties

E.5.8.    Verband tussen complexatiereacties en neerslagreacties

E.5.9.    Verband tussen complexatiereacties en protontransferreacties

E.5.10.   Verband tussen complexatiereacties en elektrontransferreacties

 

E.6.       Globaal verband tussen de verschillende soorten evenwichtsreacties

E.6.2.    Kwantitatief verband

E.6.3.    Een practische toepassing: de extractie van Au uit erts

E.6.4.    Biologische relevantie van complexatie. Een voorbeeld.

Grondslagen van de chemie: oefeningen 1 (B-KUL-G0N39a)

1.9 studiepunten : Practicum 15 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

Oefeningen bij theoretische gedeelte Hoorcollege 1

Toelichting werkvorm

Oefensessie

Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

G0N01D : Grondslagen van de chemie

Grondslagen van de chemie: oefeningen 2 (B-KUL-G0N40a)

1 studiepunten : Practicum 7 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

Oefeningen bij theoretisch gedeelte Hoorcollege 2

Toelichting werkvorm

Oefensessie

Grondslagen van de chemie: practicum 1 (B-KUL-G0N41a)

0.8 studiepunten : Practicum 15 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

Labo-oefeningen die inhoudelijk aansluiten bij theoretisch gedeelte Hoorcollege 1.

Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

G0N01D : Grondslagen van de chemie

Grondslagen van de chemie: practicum 2 (B-KUL-G0N42a)

0.9 studiepunten : Practicum 15 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

Labo-oefeningen die inhoudelijk aansluiten bij theoretisch gedeelte Hoorcollege 2.

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Grondslagen van de chemie (B-KUL-G2N01c)

Type : Examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Open vragen
Leermateriaal : Formularium, Rekenmachine

Toelichting

- oefeningen (schriftelijk) en theorie (schiftelijk) worden geëvalueerd tijdens de examenperiode.
- practica worden tijdens het semester geëvalueerd (permanente evaluatie). Er wordt voor het OLA practicum geen
herexamen aangeboden.
- Practica (on-campus en online opdrachten hieraan verbonden) zijn verplicht. Indien ongewettigd afwezig of bij niet inleveren van opdrachten zal de toegang tot het examen geweigerd worden.
- Book of Data mag steeds gebruikt worden.

- Voor het examenonderdeel (schriftelijke) oefeningen moet minstens 1/6 behaald worden, en voor het onderdeel (schriftelijk) theorie moet minstens 1/10 behaald worden. Indien één van deze twee grenzen niet behaald wordt, is het eindtotaal gelijk aan de som van de onderdelen, maar met een maximum van 9/20.

Toelichting bij herkansen

Er wordt voor het OLA practicum GEEN tweede examenkans aangeboden.  Het deelcijfer voor dit onderdeel  (uit permanente evaluatie) wordt overgenomen van de eerste examenkans.

ECTS Wiskunde I (B-KUL-G0N02B)

6 studiepunten Nederlands 60 Eerste semesterEerste semester

Doelstellingen

De student leert de noodzakelijke wiskundige basis voor de natuurwetenschappelijke opleidingsonderdelen.

Begintermen

Wiskundige basiskennis uit het secundair onderwijs, onder andere afgeleiden en integralen. 

Identieke opleidingsonderdelen

X0E76A: Wiskunde I

Plaats in het onderwijsaanbod

Onderwijsleeractiviteiten

Wiskunde I: hoorcollege (B-KUL-G0N02a)

3 studiepunten : College 24 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

Calculus van functies van één en meerdere veranderlijken

1) Getallen: natuurlijke getallen, volledige inductie, reële getallen en complexe getallen.
2) Elementaire functies, goniometrische functies, exponentiële functie en logaritme.
3) Afgeleiden, verloop van functies, extrema, Taylorveelterm.
4) Bepaalde en onbepaalde integralen, integratietechnieken, berekening van oppervlakte
5) Differentiaalvergelijkingen: scheiding van veranderlijken en lineair met constante coëfficiënten.
6) Functies van meer veranderlijken, grafiek en niveaukrommen.
7) Partiële afgeleiden, stationaire punten en extrema, extrema onder nevenvoorwaarden.
8) Vectoren, gradiënt, scalair product.

Studiemateriaal

Cursustekst

Wiskunde I: oefeningen (B-KUL-G0N43a)

3 studiepunten : Practicum 36 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

Wekelijks vinden er oefenzittingen plaats.

Calculus van functies van één en meerdere veranderlijken

1) Getallen: natuurlijke getallen, volledige inductie, reële getallen en complexe getallen.
2) Elementaire functies, goniometrische functies, exponentiële functie en logaritme.
3) Afgeleiden, verloop van functies, extrema, Taylorveelterm.
4) Bepaalde en onbepaalde integralen, integratietechnieken, berekening van oppervlakte
5) Differentiaalvergelijkingen: scheiding van veranderlijken en lineair met constante coëfficiënten.
6) Functies van meer veranderlijken, grafiek en niveaukrommen.
7) Partiële afgeleiden, stationaire punten en extrema, extrema onder nevenvoorwaarden.
8) Vectoren, gradiënt, scalair product.

Studiemateriaal

Cursustekst

Toledo

Toelichting werkvorm

Oefensessie

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Wiskunde I (B-KUL-G2N02b)

Type : Examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen
Leermateriaal : Cursusmateriaal, Rekenmachine

Toelichting

Meerkeuzevragen: zonder giscorrectie

ECTS Algemene natuurkunde I (B-KUL-G0N03B)

9 studiepunten Nederlands 80 Beide semestersBeide semesters Uitgesloten voor examencontract

Doelstellingen

Studie van de fundamentele kenmerken van de materie, de wetmatigheden die de eigenschappen en het gedrag van de materie
bepalen, en hun toepassingen in een aantal concrete systemen. Tot de doelstellingen behoren zowel het verwerven van kennis als het opbouwen van inzicht hieromtrent. De nadruk wordt gelegd op de brede toepasbaarheid van de behandelde wetmatigheden en beschrijvingen van de materie. Dit moet de student toelaten de bestudeerde basiseigenschappen en -wetmatigheden toe te passen voor het begrijpen en analyseren van een brede waaier van fysische eigenschappen en fenomenen die zich manifesteren in diverse materievormen en deelgebieden van de wetenschap.

Begintermen

Geen voorkennis Fysica vereist. De cursus vereist wel elementaire wiskundige basistechnieken (calculus).

Onderwijsleeractiviteiten

Algemene natuurkunde I: hoorcollege 1 (B-KUL-G0N03a)

3 studiepunten : College 24 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

Hoofdstukken uit het boek van Giancoli:

1. Inleiding, meten en schatten
2. Beweging beschrijven: kinematica in één dimensie
3. Kinematica in twee en drie dimensies; vectoren
4. Dynamica: de bewegingswetten van Newton
5. De wetten van Newton: wrijving, cirkelvormige beweging, weerstandskrachten
6. De zwaartekracht en de synthese van Newton
7. Arbeid en energie
8. Behoud van energie
9. Impuls
13. Vloeistoffen
14. Trillingen
15. Golfbeweging
16. Geluid
 

Studiemateriaal

Giancoli, "Physics for Scientists and Engineers with Modern Physics +masteringphysics, Custom reprint KU Leuven, 2014, ISBN 9781783991662. Opgelet: koop enkel een tweedehandsboek als je

1) er een code mee krijgt om in te loggen op Mastering Physics

2) die code voor de eerste keer minder dan 4 jaar geleden gebruikt is. De codes blijven slechts voor 4 academiejaren geldig.

Toelichting werkvorm

Interactief hoorcollege met demonstraties.

Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

G0N03C : Algemene natuurkunde I

Algemene natuurkunde I: oefeningen 1 (B-KUL-G0N44a)

3 studiepunten : Practicum 24 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

Zie OLA hoorcollege 1

Studiemateriaal

Zie OLA hoorcollege 1

Toelichting werkvorm

Laboratoriumsessie - Oefensessie

Groepjes van ongeveer 15 studenten bestuderen fysische toepassingen door het oplossen van concrete probleemstellingen.

Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

G0N03C : Algemene natuurkunde I

Algemene natuurkunde I: hoorcollege 2 (B-KUL-G00D3a)

1.25 studiepunten : College 10 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

Hoofdstukken uit het boek van Giancoli:

10. Rotatiebeweging
11. Impulsmoment; algemene rotatie
12. Statisch evenwicht; elasticiteit en breuk
36. Speciale relativiteitstheorie
37. Vroege kwantumtheorie en modellen van het atoom
38. Kwantummechanica
39. Kwantummechanica van atomen

Studiemateriaal

Giancoli, "Physics for Scientists and Engineers with Modern Physics, Custom reprint KU Leuven, 2014, ISBN 9781783991662.

Algemene natuurkunde I: oefeningen 2 (B-KUL-G00D4a)

1 studiepunten : Practicum 8 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

Zie OLA Hoorcollege 2

Studiemateriaal

Zie OLA Hoorcollege 2

Toelichting werkvorm

Groepjes van ongeveer 15 studenten bestuderen fysische toepassingen door het oplossen van concrete probleemstellingen.

Algemene Natuurkunde I: Practicum (B-KUL-G00F2a)

0.75 studiepunten : Practicum 14 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

Zie OLA Hoorcolleges 1 & 2

Studiemateriaal

Zie OLA Hoorcolleges 1 & 2

Toelichting werkvorm

Laboratoriumsessie

Teams van twee studenten voeren practicumproeven uit

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Algemene natuurkunde I (B-KUL-G2N03b)

Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Gesloten vragen, Meerkeuzevragen, Open vragen
Leermateriaal : Formularium, Rekenmachine

Toelichting

Het practicum telt voor 3/20 punten en het schriftelijk examen voor 17/20. Het schriftelijk examen wordt in 3 stukken verdeeld. Een eerste tussentijdse examen vindt plaats in week 10 van semester 1, een tweede rond week 8 van semester 2, en een eindexamen in de junizittijd. De respectievelijke gewichten zijn 3 ptn, 4 ptn en 10 ptn. De twee tussentijdse examens beperken zich tot oefeningen, terwijl het eindexamen ook theoretische elementen bevat. Het eerste tussentijdse oefeningenexamen gaat over de leerstof tot dan toe gezien, het tweede oefeningenexamen over de leerstof gezien tussen de twee oefeningenexamens. Het eindexamen gaat over de gehele leerstof. De student is geslaagd indien er een minimum van 10/20 punten is gescoord op het geheel. Deelname aan het practicum is noodzakelijk om aan het eindexamen te mogen deelnemen.

Toelichting bij herkansen

De punten van de tussentijdse testen van het eerste en tweede semester zullen niet meer worden meegeteld in de 2e examenkans. Voor het practicum is geen herkansing mogelijk. De punten van het practicum van de eerste examenkans worden in dezelfde verhouding overgedragen naar de tweede examenkans.

ECTS Algemene natuurkunde I (B-KUL-G0N03C)

6 studiepunten Nederlands 48 Beide semestersBeide semesters Uitgesloten voor examencontract

Doelstellingen

Studie van de fundamentele kenmerken van de materie, de wetmatigheden die de eigenschappen en het gedrag van de materie
bepalen, en hun toepassingen in een aantal concrete systemen. Tot de doelstellingen behoren zowel het verwerven van kennis als het opbouwen van inzicht hieromtrent. De nadruk wordt gelegd op de brede toepasbaarheid van de behandelde wetmatigheden en beschrijvingen van de materie. Dit moet de student toelaten de bestudeerde basiseigenschappen en -wetmatigheden toe te passen voor het begrijpen en analyseren van een brede waaier van fysische eigenschappen en fenomenen die zich manifesteren in diverse materievormen en deelgebieden van de wetenschap.

Begintermen

Geen voorkennis Fysica vereist. De cursus vereist wel elementaire wiskundige basistechnieken (calculus).

Onderwijsleeractiviteiten

Algemene natuurkunde I: hoorcollege 1 (B-KUL-G0N03a)

3 studiepunten : College 24 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

Hoofdstukken uit het boek van Giancoli:

1. Inleiding, meten en schatten
2. Beweging beschrijven: kinematica in één dimensie
3. Kinematica in twee en drie dimensies; vectoren
4. Dynamica: de bewegingswetten van Newton
5. De wetten van Newton: wrijving, cirkelvormige beweging, weerstandskrachten
6. De zwaartekracht en de synthese van Newton
7. Arbeid en energie
8. Behoud van energie
9. Impuls
13. Vloeistoffen
14. Trillingen
15. Golfbeweging
16. Geluid
 

Studiemateriaal

Giancoli, "Physics for Scientists and Engineers with Modern Physics +masteringphysics, Custom reprint KU Leuven, 2014, ISBN 9781783991662. Opgelet: koop enkel een tweedehandsboek als je

1) er een code mee krijgt om in te loggen op Mastering Physics

2) die code voor de eerste keer minder dan 4 jaar geleden gebruikt is. De codes blijven slechts voor 4 academiejaren geldig.

Toelichting werkvorm

Interactief hoorcollege met demonstraties.

Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

G0N03B : Algemene natuurkunde I

Algemene natuurkunde I: oefeningen 1 (B-KUL-G0N44a)

3 studiepunten : Practicum 24 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

Zie OLA hoorcollege 1

Studiemateriaal

Zie OLA hoorcollege 1

Toelichting werkvorm

Laboratoriumsessie - Oefensessie

Groepjes van ongeveer 15 studenten bestuderen fysische toepassingen door het oplossen van concrete probleemstellingen.

Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

G0N03B : Algemene natuurkunde I

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Algemene natuurkunde I (B-KUL-G2N03c)

Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen, Gesloten vragen
Leermateriaal : Formularium, Rekenmachine

Toelichting

Het schriftelijk examen wordt in twee stukken verdeeld. Een tussentijdse examen vindt plaats in week 10 van semester 1, en een eindexamen in de junizittijd. De respectievelijke gewichten zijn 5 ptn en 15 ptn. Het tussentijdse examen beperkt zich tot oefeningen, terwijl het eindexamen ook theoretische elementen bevat. Het tussentijdse oefeningenexamen gaat over de leerstof tot dan toe gezien. Het eindexamen gaat over de gehele leerstof. De student is geslaagd indien er een minimum van 10/20 punten is gescoord op het geheel.

Toelichting bij herkansen

De punten van het tussentijdse examen van het eerste semester zullen niet meer worden meegeteld in de 2e examenkans. Bij herkansing wordt de eindscore volledig bepaald door het eindexamen tijdens de zittijd.

 

ECTS Celbiologie en biochemie (B-KUL-G0N04C)

9 studiepunten Nederlands 80 Beide semestersBeide semesters Uitgesloten voor examencontract
Crauwels Marion (coördinator) |  Crauwels Marion

Doelstellingen

De studenten geraken goed vertrouwd met de (bio)chemische samenstelling en structurele opbouw van levende cellen. Belangrijk hierbij is het kunnen aantonen van de nauwe relatie tussen (sub)cellulaire structuren en hun functies. Bovendien leren de studenten de processen kennen die leiden tot groei, deling en differentiatie van cellen, evenals de wijzen waarop virussen en andere infectieuze partikels zich kunnen vermeerderen. Hierbij zal er ook dieper worden ingegaan op de celcyclus en fouten die hierin optreden die kunnen leiden tot kanker en op geprogrammeerde celdood, als mechanisme om ‘slecht werkende cellen’ selectief te verwijderen.

 

In het tweede cursusgedeelte maken de studenten nader kennis met fundamentele transport-, stofwisselings- en informatieverwerkingsprocessen die zich afspelen in levende cellen en verwerven ze inzicht in de mechanismen waardoor deze gereguleerd worden. Hierbij wordt een grondige, inzichtelijk onderbouwde kennis van de centrale metabole reactiewegen die instaan voor de energievoorziening van de cel nagestreefd.  De studenten kunnen tevens aan de hand van voorbeelden illustreren hoe cellen hun levensactiviteiten aanpassen aan de omgevingscondities. 

 

Er wordt ook veel aandacht besteed aan de methoden die gebruikt worden in de celbiologie. Verschillende van de technieken die in het practicum worden gebruikt worden ook in het hoorcollege besproken.

 

De leerinhoud van deze cursus wordt - in overleg met de andere titularissen van de opleiding - complementair ingevuld aan deze van andere opleidingsonderdelen uit de bacheloropleidingen Biologie en Biochemie en biotechnologie, meer in het bijzonder Genetica(waarin de principen van erfelijkheid worden belicht) en Bio-organische chemie (waarin de chemische aspecten van biomoleculen worden behandeld).  Hierdoor leert ook de student de verschillende leerinhouden van inhoudelijk aansluitende biologische/biochemische opleidingsonderdelen in een ruimer verband te plaatsen. 

​De student kan een aantal maatregelen in het domein van de celbiologie en biochemie die geschikt zijn om duurzaamheid te vergroten, opsommen, en toelichten welke impact ze (kunnen) hebben, rekening houdend met ecologische, economische, ethische en sociale aspecten van duurzaamheid.

Begintermen

Basiskennis biologie, chemie en fysica uit het secundair onderwijs is een voordeel.

Onderwijsleeractiviteiten

Celbiologie en biochemie: hoorcollege 1 (B-KUL-G0M65a)

4.5 studiepunten : College 36 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

 

 

 

1. Structuur, eigenschappen en functies van biomoleculen. Koolhydraten. Lipiden. Proteïnen. Nucleïnezuren.
 

2. Bouw en functie van de cel en de celorganellen. Het ontstaan van het leven. De celtheorie. Prokaryote versus eukaryote cellen. De endosymbiosetheorie. Overzicht van de celorganellen en subcellulaire structuren en hun functies. De secretieweg van de cel.
 

3. Celgroei en celdeling. Celdeling bij prokaryoten. Mitose en de celdeling bij eukaryoten. Vergelijking mitose en meiose (reductiedeling). Methoden voor het kweken en tellen van cellen.
 

4. Celdifferentiatie. Ontstaan van meercelligheid. Structuur en eigenschappen van differentiërende cellen. Structurele interacties en verbanden tussen cellen.

5. Virussen, prionen en viroïden. Structuur. DNA- en RNA-virussen. Gastheercellen. Lytische en lysogene infectiecycli. Hoe ontstaan prionen?
 

6. Transmembranair transport. Permeabiliteit. Passief transport: diffusie en osmose; gefaciliteerde diffusie. Actief transport. Exocytose en endocytose.
 

7. Inleiding tot het celmetabolisme. Voeding en energievoorziening van de cel. Autotroof-heterotroof. Anabolisme-katabolisme. Enzymen en biochemische reactiepaden. Energierijke verbindingen. Regulatiemechanismen van het celmetabolisme. Experimentele methoden voor de studie van de cellulaire stofwisseling.
 

8. Cellulaire ademhaling. Katabolisme. Glycolyse. Krebscyclus. Oxidatieve fosforylatie. De electronentransportketen en chemiosmose. Fermentatie. Connecties met andere metabole wegen.

 

9. Fotosynthese. Lichtreacties. Calvincyclus. Alternatieve mechanismen van koolstoffixatie in aride milieus.
 

10. Regulatie van cellulaire activiteit. Communicatie cel-milieu en cel-cel. Membranaire en intracellulaire receptoren. Intracellulaire signaaltransductie en responsen. Regulatiemechanismen van de genexpressie en van de celcyclus. Hoe gaan cellen om met stressfactoren uit hun omgeving?

In dit opleidingsonderdeel maakt de student ook kennis met de relevantie en hedendaagse uitdagingen van de biochemie en biotechnologie.

Studiemateriaal

Een cursus (twee delen) is beschikbaar (Acco)

Biology (Raven) is een aanrader, maar niet noodzakelijk.

slides van tijdens de hoorcolleges zijn beschikbaar op Toledo

e-oefeningen voor de metabolische wegen zijn beschikbaar op Toledo

Toelichting onderwijstaal

De cursus wordt gedoceerd in het Nederlands

Celbiologie en biochemie: hoorcollege 2 (B-KUL-G0M62a)

1.2 studiepunten : College 8 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

In Celbiologie II krijgen de studenten een inzicht in de verschillende methoden die gebruikt worden om de macromoleculen te karakteriseren en onderling van elkaar te scheiden evenals de methoden om (sub)cellulaire structuur te onderzoeken via bvb verschillende microscopische analyses.  Tenslotte komen ook de experimentele methoden aan bod voor de studie van cellulaire responsen op veranderende omgevingsfactoren.

 

Verder wordt er dieper ingegaan op:

 

1. Geprogrammeerde celdood. Mechanisme van apoptosis. Onderscheid met necrosis. Celveroudering

2. Controle van de celcyclus.

Studiemateriaal

Een cursustekst wordt voorzien (bij Acco)

powerpoint slides komen op toledo

youtube filmpjes worden gebruikt ter ondersteuning van de leerstof

Biology (Raven) is een aanrader als handboek

Toelichting onderwijstaal

Celbiologie en biochemie wordt in het Nederlands gedoceerd

Celbiologie en biochemie: oefeningen 1 (B-KUL-G0N45a)

2.1 studiepunten : Practicum 16 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

Herkennen van celstructuren aan de hand van elektronenmicroscopische opnamen;
Vlot herkennen van de verschillende klassen van biomoleculen
Oefeningen op mitose en meiose
Oefeningen op metabolische reactiewegen

Studiemateriaal

De cursus (deel I en deel II) bevat ook de oefeningen (op het einde van elk hoofdstuk). (verkrijgbaar bij Acco)

voor de metabolische wegen zijn er e-oefeningen en er wordt van de studenten verwacht dat ze deze oplossen voor ze naar de oefensessies ronde metabolische wegen komen.

 

Toelichting onderwijstaal

De oefensessies worden in het Nederlands gedoceerd

Toelichting werkvorm

Oefensessie

Oefeningen/werkzittingen

Celbiologie en biochemie: practicum 1 (B-KUL-G0N46a)

1.2 studiepunten : Practicum 20 Beide semestersBeide semesters

Inhoud

Er zijn vier practica, twee in elk semester

- Biochemische scheidingstechnieken: analyse van proteïnen met behulp van SDS-PAGE
- Biochemische scheidingstechnieken: scheiding van een mengsel van aminozuren en suikers met behulp van ionenuitwisselings- en dunnelaagchromatografie
- Moleculaire biologie: het karakteriseren van nucleïnezuren met behulp van restrictie-enzymen
- Enzymkinetiek
- Bacteriële groei en invloed van chloramfenicol en penicilline

Studiemateriaal

Een aparte handleiding voor de practica is beschikbaar (bij Acco)

 

Toelichting onderwijstaal

De practica worden in het Nederlands gedoceerd

Toelichting werkvorm

De practica duren elk ongeveer 5 uur. De studenten zullen per twee de experimenten uitvoeren en per twee ook het verslag maken

Voor de start van het practicum wordt er een test afgenomen

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Celbiologie en biochemie (B-KUL-G2N04c)

Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen
Leermateriaal : Geen

Toelichting

In juni is er een examen dat zal meetellen voor 14 van de 20 punten
Op de practica van het eerste semester staan 2 punten.
Op de practica van het tweede semester staan 2 punten.
Tussen week 10 en week 13 van het eerste semester zal een toets worden afgenomen die meetelt voor 2 van de 20 punten.
Dit zal een schriftelijk examen zijn tijdens het eerste uur van een les. Voor de tussentijdse test zijn er multiple choice vragen en wordt giscorrectie toegepast
Deelname aan de practica en indienen van de verslagen is verplicht, niet deelnemen aan de practica leidt tot uitsluiting van het examen en dit is niet te corrigeren in september.

Het examen in juni zal de volledige leerstof omvatten. Om geslaagd te zijn moet de student 10/20 halen op het schriftelijk examen in juni of september
 

Toelichting bij herkansen

De punten van de tussentijdse test in December zullen niet meer worden meegeteld in de 2e examenkans. De punten van het practicum nog wel. De score op het examen wordt dus omgerekend naar 16/20 en hierbij komen de punten/vier van het practicum. Om geslaagd te zijn moet de student 10/20 halen op het schriftelijke examen. 

ECTS Bio-organische chemie (B-KUL-G0N08A)

6 studiepunten Nederlands 61 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract
Smet Mario (coördinator) |  Depotter Griet |  Dirix Carolien |  Smet Mario

Doelstellingen

De studenten kunnen de eigenschappen en reactiviteit van organische functionele groepen in eigen woorden uitleggen. 
De studenten kunnen een reactie aanvullen met de reactieproducten en het reactiemechanisme stapsgewijs opschrijven en uitleggen. 
De studenten kunnen met behulp van  molecuulmodellen de aangeleerde principes van stereochemie toepassen op eenvoudige organische moleculen. 
De studenten kunnen de substituenteffecten toepassen.
De studenten kunnen aan een eenvoudige organische molecule de correcte IUPAC naam geven.
De studenten kunnen een aantal eenvoudige organische syntheses in het laboratorium uitvoeren.
De studenten herkennen de principes van reactiviteit van organische moleculen in een aantal eenvoudige biochemische cycli zoals de glycolyse, vetzuursynthese en –afbraak en Krebscyclus.
De studenten zijn vertrouwd met de structuren weergegeven in het formularium ‘Overzicht nomenclatuur en structuren’, kunnen deze herkennen en de functie ervan in een (bio)chemische context toelichten.

De student kan de discussie over de termen ‘duurzaamheid’ en ‘duurzame ontwikkeling’ duiden.

De student kan een aantal maatregelen in het domein van technologie en wetenschap die geschikt zijn om duurzaamheid te vergroten, opsommen en toelichten welke impact ze (kunnen) hebben.

Begintermen

Interesse tonen voor de chemie van de levende materie.
De student is handvaardig en kan een constant werkritme aanhouden.

Identieke opleidingsonderdelen

X0E39B: Bio-organische chemie
X9X03B: Bio-organische chemie
X9X03A: Bio-organische chemie

Onderwijsleeractiviteiten

Bio-organische chemie (B-KUL-G0N08a)

3.6 studiepunten : College 29 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

De hoorcolleges behandelen volgende onderwerpen:
Substituenteffecten
Alkanen en cycloalkanen
Alkenen
Stereochemie
Nucleofiele substitutie en eliminatie
Alcoholen en thiolen
Ethers
Aldehyden en ketonen
Koolhydraten
Aminen
Carbonzuren
Derivaten van carbonzuren
Lipiden
Aminozuren, eiwitten en enzymen
Fosfaten en fosfaatesters
Aromaten, fenolen en anilinen
Heteroaromaten
Nucleotiden en nucleinezuren

Studiemateriaal

Handboek
Kopie powerpointpresentatie
Set molecuulmodellen
Brochure ‘Overzicht nomenclatuur en structuren’
Toledo
Handleiding practicum en werkzittingen

Bio-organische chemie: oefeningen (B-KUL-G0N51a)

1.5 studiepunten : Practicum 12 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

Werkzittingen met volgende thema’s:
Notaties van alkanen en alkenen

Substituenteffecten
Stereochemie
Reactiemechanismen
Koolhydraten
Aminozuren
Aromaten, elektrofiele aromatische substitutie
 

Studiemateriaal

Handboek
Kopie powerpointpresentatie
Set molecuulmodellen
Brochure ‘Overzicht nomenclatuur en structuren’
Toledo
Handleiding practicum en werkzittingen

Toelichting werkvorm

Oefensessie

Bio-organische chemie: practica (B-KUL-G0N52a)

0.9 studiepunten : Practicum 20 Tweede semesterTweede semester

Inhoud

Practica met volgende thema’s:
Cis-trans isomerisatie
Vorming van een chiraal alcohol
Koolhydraten
Esters
Olie en vet
Condensatie- en oxidatiereactie
Aminozuren

Studiemateriaal

Handboek
Kopie powerpointpresentatie
Set molecuulmodellen
Brochure ‘Overzicht nomenclatuur en structuren’
Toledo
Handleiding practicum en werkzittingen

Toelichting werkvorm

Studenten die zich onvoldoende voorbereid in de practicumsessies aandienen, kan de toegang ontzegd worden.

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Bio-organische chemie (B-KUL-G2N08a)

Type : Examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Open vragen, Gesloten vragen
Leermateriaal : Formularium

Toelichting

- oefeningen en theorie worden geëvalueerd tijdens de examenperiode.
- practica worden tijdens het semester geëvalueerd (permanente evaluatie). Er wordt voor het OLA practicum geen herexamen aangeboden.
- practica (on-campus en online opdrachten hieraan verbonden) zijn verplicht. Indien ongewettigd afwezig of bij niet inleveren van opdrachten zal de toegang tot het examen geweigerd worden.”
- zowel voor het examenonderdeel theorie als voor het examenonderdeel oefeningen moet minstens 3,2/8 behaald worden. Indien aan één van deze voorwaarden niet voldaan is, is het eindtotaal gelijk aan de som van de onderdelen (theorie, oefeningen en practicum) met een maximum van 9/20.
- tijdens het examen is het gebruik van het formularium 'Overzicht nomenclatuur en structuren', het periodiek systeem en een set molecuulmodellen toegelaten.
- indien een opgave van de oefeningen dit vereist is een rekenmachine toegelaten.

Toelichting bij herkansen

Er is geen tweede examenkans voor het practicumgedeelte.

ECTS Statistiek & data-analyse (B-KUL-G0N11C)

3 studiepunten Nederlands 31 Eerste semesterEerste semester

Doelstellingen

De cursus heeft tot doel de basisbegrippen van statistiek bij te brengen zodat de student inzicht verwerft in de methodiek van data−analyse en het gebruik ervan in wetenschappelijke disciplines. Een concrete en correcte toepassing van deze technieken primeert. De cursus beoogt eveneens de studenten vertrouwd te maken met statistische software.

Na het volgen van dit onderdeel:
- heeft de student kennis van  statistische software zoals R om een dataset op een duidelijke manier voor te stellen en samen te vatten door gebruik te maken van gepaste grafische methoden en samenvattende numerieke getallen uit de beschrijvende statistiek, waaronder een staafdiagram, histogram, boxplot, kwantielplot, kruistabel, steekproefgemiddelde, steekproefstandaardafwijking en steekproefvariantie, steekproefcorrelatie. 
- kent de student de belangrijkste kansregels, onafhankelijkheid van gebeurtenissen, voorwaardelijke kans, de wet van de totale kans en de regel van Bayes, en kan deze toepassen in concrete situaties.
- kan de student de belangrijkste eigenschappen van univariate dichtheidsfuncties, verdelingsfuncties en kwantielfuncties hanteren om kansen en kenmerken van een toevalsvariabele te berekenen. In het bijzonder is de student erg vertrouwd met de normale verdeling en de binomiaalverdeling.
- kent de student het belang van de centrale limietstelling en kan deze in concrete situaties toepassen.
- kan de student bij een concreet onderzoeksprobleem en bijhorende data-verzameling de gepaste statistische methode uit de beschrijvende en de inductieve statistiek selecteren en toepassen. De student kan in concrete situaties (cfr. inhoud) puntschattingen berekenen, betrouwbaarheidsintervallen opstellen, hypothesetesten uitvoeren, de resultaten interpreteren en op basis daarvan een correct besluit op een wetenschappelijke manier formuleren. Hij kent ook de voorwaarden om de analyse te mogen uitvoeren en kan deze op een concrete dataset nagaan.  De student kan de gegeven R-output analyseren.
 

Begintermen

Elementaire calculus

Identieke opleidingsonderdelen

X0A17A: Statistiek & data-analyse

Onderwijsleeractiviteiten

Statistiek & data-analyse: hoorcollege (B-KUL-G0N11a)

2 studiepunten : College 16 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

• Inleidend gedeelte: hier wordt aan de hand van eenvoudige praktische voorbeelden het belang van de statistiek uitgelegd. Eveneens worden de basiselementen van beschrijvende statistiek uitgewerkt. Dit omvat numerisch en grafisch weergeven van zowel univariate als bivariate gegevens.
• De belangrijkste rekentechnieken en modellen van de kansrekenen worden ingevoerd. Het betreft hier alleen de basisbeginselen van de kansrekening die behoren tot de meest essentiële toolbox van de statisticus. Na de basisregels van de kansrekening wordt het begrip toevalsvariabele geïntroduceerd tesamen met de overeenkomstige rekentechnieken voor het berekenen van verwachtingswaarden en de kansverdeling van een getransformeerde toevalsvariabele. Met behulp van deze basis worden enkele belangrijke kansmodellen ontwikkeld (binomiaal, Poisson, normaal, exponentieel). Het concept onafhankelijke toevalsvariabelen en correlatie wordt besproken.
• Het deel Verklarende Statistiek behandelt de basisprincipes die worden toegepast bij het schatten van een model op basis van meetgegevens. Daarna wordt de notie van kansverdeling van een statistiek ingevoerd. Verder komen betrouwbaarheidsintervallen en testen van hypothesen aan bod, tesamen met validatieprincipes van een kansmodel. Het verschil tussen een parametrische en niet−parametrische aanpak komt hierbij aan bod. Deze basisprincipes worden toegepast op univariate en bivariate gegevensstructuren, inclusief regressieanalyse.

Studiemateriaal

Er worden slides en on-line lesmateriaal  ter beschikking gesteld.

Materiaal voor de oefeningen wordt ter beschikking gesteld, alsook een formularium en statistische tabellen.

Het boek 'Statistiek en Wetenschap (Acco Uitgeverij) wordt als handboek gebruikt.

Toelichting werkvorm

Er wordt naast de hoorcolleges in het auditorium ook online lesmateriaal ter beschikking gesteld.

Statistiek & data-analyse: oefeningen 3 (B-KUL-G0W79a)

1 studiepunten : Practicum 15 Eerste semesterEerste semester

Inhoud

Begeleide oefenzittingen worden aangeboden waardoor de student vertrouwd wordt gemaakt met de rekentechnieken en methoden uit de kansrekening en de statistiek die in de cursus aan bod komen.

Daarnaast maken de studenten kennis met statistische software en worden de resultaten besproken in de oefenzittingen.

Toelichting werkvorm

Oefensessie - PC-sessie

Evaluatieactiviteiten

Evaluatie: Statistiek & data-analyse (B-KUL-G2N11c)

Type : Examen tijdens de examenperiode
Evaluatievorm : Schriftelijk
Vraagvormen : Gesloten vragen
Leermateriaal : Formularium, Rekenmachine

Toelichting

 Het examen is volledig schriftelijk.

ECTS Genetica (B-KUL-G0N12B)

3 studiepunten Nederlands 28 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract

Doelstellingen

De student verwerft kennis en redeneervermogen in de Genetica via een inleidende cursus. De student kan verbanden leggen met moleculaire biologie en celbiologie, maar er wordt voornamelijk gewerkt op het organismaal niveau. De student ziet Genetica als onderzoeksdiscipline op zich en als ondersteunende discipline binnen de Biologie en de Biochemie & Biotechnologie.  

    Begintermen

    Achtergrond in algemene wetenschappen.

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0B24B: Genetica
    X0B24C: Genetica

    Onderwijsleeractiviteiten

    Genetica (B-KUL-G0N12a)

    2 studiepunten : College 20 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Inleiding tot de wetenschap van de Genetica

    Basis genetica

    • Meiose en seksuele levenscycli
    • Basisprincipes van overerving, overervingspatronen
    • Linkage, crossing-over en chromosoom mapping in eukaryoten

    Genen en genomen

    • De definitie van een gen, na Mendel
    • Genomen, chromosomen en epigenetica
    • Genetica van bacteriën en virussen
    • Eukaryote Model organismen
    • Basistechnieken van de moleculaire genetica

    Genen en populaties

    • Genen in populaties
    • Genoom wijde associaties
    • Genetische analyse van complexe kenmerken

    Mutanten en fenotypes

    • Identificeren en classificeren van mutanten
    • Fenotypes koppelen aan DNA sequenties
    • Mutante fenotypes en gen activiteit
    • Reverse genetics
    • Genoom editeren

    Interacties tussen genen en regulatiewegen

    • Suppressors en enhancers
    • Epistatische interacties

    Studiemateriaal

    - Cursus

    - Lesdia's
    - e-platform Toledo

     

    Toelichting werkvorm

    College gecombineerd met oefensessies

    Genetica: oefeningen (B-KUL-G0N59a)

    1 studiepunten : Opdracht 8 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Aan de hand van gevalstudies worden vraagstukken in de Genetica behandeld.

    Indien er voldoende tijd is, is er op het einde van de lessenreeks een discussieoefening over de maatschappelijke relevantie en impact van Genetica.

    Studiemateriaal

    Gevalstudies uitgewerkt met bijhorende multiple choice vragen.

    Toelichting werkvorm

    Casusgebaseerd college - Oefensessie

    • Voorbereiding van gevalstudies
    • Oplossen van vraagstukken over de gevalstudies in de les

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Genetica (B-KUL-G2N12b)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Take-home
    Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen, Gesloten vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    Puntenverdeling op 20:
       Toetsen en opdrachten: 3
       Theorie: 17

    De student slaagt indien de gewogen eindscore (85% theoretisch examen, 15% praktische oefeningen) minstens 10/20 bedraagt. De multiple choice vragen zijn zonder gis-correctie.

    Zonder deelname aan en permanente evaluatie voor de praktische oefeningen kan de student niet deelnemen aan het examen en dus ook niet slagen voor het OPO (NA).

     

    Toelichting bij herkansen

    Zonder deelname aan en evaluatie van de praktische oefeningen is ook geen herkansing mogelijk en is de student automatisch niet geslaagd voor dit OPO in het betrokken academiejaar. Het gedeelte permanente evaluatie kan niet herkanst worden. De punten voor de praktische oefeningen worden meegenomen naar de September-zittijd. 

    ECTS Algemene natuurkunde II (B-KUL-G0N13B)

    6 studiepunten Nederlands 54 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    Tijdens de opleiding moet de student leren om de natuurkundige ondergrond van dikwijls zeer uiteenlopende fenomenen te herkennen. In het opleidingsonderdeel Algemene Natuurkunde 2 wordt dat gerealiseerd voor het elektromagnetisme (inclusief golfoptica), op een inleidend niveau en dus zonder dat fundamentele opbouw echt nodig wordt. Na afloop moet de student in staat zijn hierover zelfstandig te redeneren en modellen op te stellen.

    Begintermen

    De materie sluit aan op intuïtieve ervaringen van de student met de elektrische, magnetische, en optische fenomenen. De student moet anderzijds over een meer gevorderde kennis van mechanische begrippen (incl. golven) beschikken, en deze kunnen toepassen op eenvoudige systemen. Deze begintermen kunnen verworven worden in het opleidingsonderdeel Algemene Natuurkunde 1.
    Wiskundevaardigheden mogen beperkt zijn (Inleiding tot de hogere wiskunde), maar de student moet bereid zijn indien nodig (in beperkte mate) bijkomende vaardigheden te verwerven.

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    SOEPEL( G0N03B ) OF SOEPEL( G0N03C ) OF SOEPEL( X0A09A ) OF SOEPEL( X0E38A )


    G0N03BG0N03B : Algemene natuurkunde I
    G0N03CG0N03C : Algemene natuurkunde I
    X0A09AX0A09A : Algemene natuurkunde: mechanica
    X0E38AX0E38A : Algemene natuurkunde: mechanica


    Onderwijsleeractiviteiten

    Algemene natuurkunde II: hoorcollege (B-KUL-G0N13a)

    3.5 studiepunten : College 30 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Hoofdstukken uit het boek van Giancoli:

    21. Elektrische lading en elektrische velden
    22. Wet van Gauss
    23. Elektrische potentiaal
    24. Condensatoren, diëlektrica en opslag van elektrische energie
    25. Elektrische stroom en weerstand
    26. DC-kringen
    27. Magnetisme
    28. Bronnen van magnetische velden
    29. Elektromagnetische inductie en wet van Faraday
    30. Inductie, elektromagnetische oscillaties en AC-kringen
    31. Vergelijkingen van Maxwell en elektromagnetische golven
    34. Golfkarakter van licht, interferentie
    35. Diffractie en polarisatie

    Studiemateriaal

    Giancoli, "Physics for Scientists and Engineers with Modern Physics +masteringphysics, Custom reprint KU Leuven, 2014, ISBN 9781783991662
    Cursustekst (Nederlands)
    Toledo (o.a. collegesheets)

    Algemene natuurkunde II: oefeningen + practicum (B-KUL-G0N60a)

    2.5 studiepunten : Practicum 24 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    cf. inhoud hoorcollege

    Studiemateriaal

    Handboek "Physics for Scientists and Engineers with Modern Physics" ISBN 9781783991662
    Cursustekst
    Toledo (o.a. collegesheets)

    Toelichting werkvorm

    Laboratoriumsessie - Oefensessie

    Oefensessies (11 sessies van 2 uren) + 2 practicumsessies van elk 3 uren

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Algemene natuurkunde II (B-KUL-G2N13b)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Verslag

    Toelichting

    10% van de punten worden aan de practica toegekend

    ECTS Microbiologie (B-KUL-G0N16C)

    6 studiepunten Nederlands 59 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De studenten verwerven een algemeen inzicht in de diversiteit van virussen, pro- en eukaryote micro-organismen waarbij ze de voornaamste onderlinge verschillen in bouw, biochemische en fysiologische eigenschappen kunnen relateren aan de veelzijdigheid van microbiële
    activiteiten en de adaptaties aan specifieke niches.  Zij kunnen de belangrijkste verschillen en overeenkomsten tussen eubacteria, archaea en eukarya samenvatten en dit kaderen in een evolutionaire context. Zij kunnen algemene en specifieke microbiële metabole processen voor energiewinning beschrijven en relateren aan de habitat van micro-organismen.  Gaandeweg worden de studenten zich bewust van het belang van microbiologie voor fundamenteel onderzoek in een evolutionaire en ecologische context, alsook van het potentieel voor toepassingsgericht technologisch onderzoek met applicaties in de voeding, landbouw en medische sector. Zij kunnen dit beschrijven aan de hand van type-voorbeelden uit de verschillende sectoren, zelf relevante informatie hieromtrent opzoeken en kunnen hierover op een correcte manier communiceren aan de hand van een presentatie. Tijdens het bijbehorend verplichte practicum leren de studenten basisprincipes en praktische vaardigheden m.b.t. manipulatie, isolatie en identificatie van micro-organismen alsook de correcte rapportering van gemaakte observaties, het distilleren van een hypothese en het formuleren van beargumenteerde conclusies.

    Begintermen

    Voorafgaande basiskennis van celbiologie en biochemie, zoals aangereikt in het opo Celbiologie en biochemie (G0N04A, G0N04B, G0N04C) is noodzakelijk. Voorafgaande kennis van genetica, zoals aangereikt in het opo Genetica (G0N12A/G0N12B) is wenselijk.”

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    ( SOEPEL(G0N04B) OF SOEPEL(G0N04C) ) OF ( SOEPEL( X9X08B ) OF SOEPEL( X0E40A ) ) EN
    ( SOEPEL( X0A97C ) OF SOEPEL( X0E45A ) )


    G0N04BG0N04B : Celbiologie en biochemie
    G0N04CG0N04C : Celbiologie en biochemie
    X9X08BX9X08B : Celbiologie
    X0E40AX0E40A : Celbiologie
    X0A97CX0A97C : Biochemie
    X0E45AX0E45A : Biochemie


    Identieke opleidingsonderdelen

    X0B41B: Microbiologie
    G0J06B: Microbiology

    Onderwijsleeractiviteiten

    Microbiologie (B-KUL-G0N16a)

    4.5 studiepunten : College 33 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    1)      Inleiding: Historiek, Microbiologie als fundamentele en toepassingsgerichte wetenschap
    2)      Structuur en opbouw van prokaryote en eukaryote cellen
    3)     Overzicht evolutie en classificatie micro-organismen: Eubacteria, Archaea,  ukarya. Kort overzicht van belangrijke bacteriële organismen, protisten, fungi en wieren, technieken voor fylogenetisch onderzoek
    4)      Virussen: Structuur, levenszcyclus DNA en RNA virussen, detectie- en kwantificatiemethoden
    5)     Microbiële groei: Meting microbiële groei, voor en nadelen batch cultuur versus continue cultuur, omgevingsparameters die groei beïnvloeden
    6)      Controle van microbiële groei: fysische sterilizatietechnieken, antibiotica,
    resistentiemechanismen, alternatieve behandelingsmethoden
    7)     Metabolische diversiteit: overzicht van de belangrijkste mechanismen
    voor energiewinning, koolstofassimilatie, stikstof- en CO2-fixatie
    8)      Microbiële  ecologie: Terrestische en aquatische habitatis, biogeochemische nutriëntcycli

     

    Studiemateriaal

    Toledo presentaties
    Handboek: Brock: Biology of microorganisms; eds Madigan, Martinko, Dunlap & Clark. Pearson Education Inc.

    Toelichting werkvorm

     

     

    Microbiologie: practica (B-KUL-G0N64a)

    1.5 studiepunten : Practicum 26 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Tijdens het practicum leren studenten hoe ze steriel moeten werken. Ze verwerven inzicht in de verschillende technieken en methodes nodig voor de isolatie, identificatie, kwantificatie en opgroeien van micro-organismen. Ze leren ook hoe ze wetenschappelijke data correct moeten rapporteren.

    De practicumsessies bestaan uit on-campus labowerk en on-line instructiemodules. Zowel het labowerk als de instructiemodules moeten verplicht afgewerkt worden.

    De practicumsessies omvatten ondermeer volgende items:

    - Isolatie van micro-organismen en het maken van reinculturen.
    - Kweken en tellen van micro-organismen.
    - Meten van groei en het bepalen van de invloed van externe factoren op groei van micro-organismen.
    - Identificatie, bacteriën, gisten en schimmels a.d.h. van microscopische kleurtechnieken en biochemische testen.
    - Het opstellen van resistentieprofielen.
     

    Studiemateriaal

    Presentaties en instructiemodules
    Practicum handleiding

    Toelichting werkvorm

    Permanente evaluatie: opstellen van verslagen, afleggen tussentijdse toets.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Microbiologie (B-KUL-G2N16c)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Praktijkexamen
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    De evaluatie van Microbiologie omvat:
    Een schriftelijk examen over het theoretisch gedeelte (14 pt), een zelfstudieproject (posterpresentatie) met peer-assessment (2 pt) en het practicum met doorlopende en eindevaluatie (4pt).
    Zowel het practicum, het zelfstudieproject en de assessment ervan, zijn verplicht en moeten afgewerkt zijn alvorens aan het schriftelijk examen kan worden deelgenomen.

    Voor het schriftelijk examen wordt van de studenten verwacht dat ze tonen inzicht te hebben in de leerstof. Antwoorden met enkel een reproductie van de betreffende leerstof is slechts goed voor maximaal de helft van de punten. Hogere scores worden verkregen door verbanden te leggen tussen de verschillende hoofdstukken van de cursus of met relevante leerstof van andere cursussen.

    Indien een student niet de helft van de punten behaald op het schriftelijk examen (score<7/14), dan wordt voor de eindscore (examen/practicum/zelfstudieproject) afgeweken van de normale afrondingsregel en geldt een afronding naar het eerst lagere gehele getal.

    Toelichting bij herkansen

    Tijdens de 2de examenkans kan enkel het schriftelijk examen worden hernomen. De punten van het practicum en het zelfstudieproject worden overgenomen van de eerste zittijd.

    ECTS Plant Physiology (B-KUL-G0N18D)

    6 ECTS English 30 First termFirst term Cannot be taken as part of an examination contract

    Aims

    After successfully following this course, the student is able to appreciate and understand the functioning of plants in a continuously changing environment - at the level of the molecular mechanisms that integrate and coordinate environmental factors, metabolic activity, and growth and development. The obtained knowledge enables the appreciation and evaluation of the most recent research and literature in the field. The use of an up-to-date English textbook, supported by slides and colleges, encourages and enables the successful student to independently identify and summarize key mechanisms, discriminate main and accessory findings, connect the different processes discussed, and explain and illustrate them with schematic figures and examples using adequate scientific English.

    Previous knowledge

    This Plant Physiology course builds on the basic knowledge of plant physiology, structure and development as obtained in the 'Bouw en Functie van Planten' course (G0N06B). In addition, good knowledge of cell biology and biochemistry as obtained in the 'Celbiologie en Biochemie' course (G0N04C), is required.

    Identical courses

    X0D84A: Plant Physiology

    Onderwijsleeractiviteiten

    Plant Physiology (B-KUL-G0N18a)

    6 ECTS : Lecture 30 First termFirst term

    Content

    TEXT BOOK: Plant Physiology and Development, 6th edition, Lincoln Taiz, Eduardo Zeiger, Ian Max MØller, Angus Murphy (Sinauer).

    Unit II. Biochemistry and Metabolism

    7. Photosynthesis: The Light Reactions

    8. Photosynthesis: The Carbon Reactions

    9. Photosynthesis: Physiological and Ecological Considerations

    10. Stomatal Biology

    11. Translocation in the Phloem

    Unit III. Growth and Development

    14. Cell Walls: Structure, Formation, and Expansion

    15. Signals and Signal Transduction

    16. Signals from Sunlight

    17. Embryogenesis

    18. Seed Dormancy, Germination, and Seedling Establishment

    19. Vegetative Growth and Organogenesis

    20. The Control of Flowering and Floral Development

    Several aspects of this course are illustrated with Arabidopsis thaliana mutants in: 'Geïntegreerd practicum: moleculaire technieken in functioneel onderzoek (B-KUL-G0L67A), module Fysiologie van Planten'.

    - Mechanisms of growth and development can be studied in more detail in: 'Plant Development and Metabolic regulation (B-KUL-G0G45A)' and 'Evolutionaire en functionele morfologie van planten (B-KUL-G0G28A)'.
    - Stress Physiology can be studied in more detail in: 'Adaptive and stress physiology (B-KUL-G0G47A)'.

    Course material

    - Book: Plant Physiology and Development, 6th edition, Lincoln Taiz, Eduardo Zeiger, Ian Max MØller, Angus Murphy (Sinauer).
    - Supporting ppt presentations available on Toledo

    Format: more information

    Using ppt presentations (with figures from the textbook) the most important aspects are explained during colleges. Additional sessions are used to go into more detail on more complex issues. Several aspects of the course are illustrated in the practical course 'Geïntegreerd practicum: moleculaire technieken in functioneel onderzoek (B-KUL-G0L67A)'.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluation: Plant Physiology (B-KUL-G2N18d)

    Type : Exam during the examination period
    Description of evaluation : Oral, Written
    Type of questions : Open questions

    Explanation

    The student passes when the weighted average of the different sub-scores is at least 10/20. The use of scientific English is also evaluated (2/20, 10% of the final score).

    De student slaagt indien het puur rekenkundig gemiddelde van alle deelscores minstens 10/20 bedraagt. Ook het gebruik van het wetenschappelijk Engels wordt geëvalueerd (2/20, 10% van de eindscore).

    ECTS Evolutiebiologie (B-KUL-G0N19C)

    6 studiepunten Nederlands 65 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    Bij het voltooien van dit opleidingsonderdeel is de student in staat om

    - belangrijke evolutionaire processen zoals genetische drift, genmigratie, natuurlijke selectie en meiotic drive te situeren, de onderliggende mechanismen te begrijpen en hun gevolgen voor de genetische structuur van populaties en genetische veranderingen doorheen tijd en ruimte in te schatten
    - de basisbegrippen en methodes in de populatiegenetica en kwantitatieve genetica te begrijpen en toe te passen
    - belangrijke patronen, eigenschappen en processen in de biologie in een evolutionair kader te interpreteren (bvb de evolutionair-ecologische context van seksuele reproductie, geïnduceerde verdedigingsmechanismen, levensloopkarakteristieken)
    - een basisanalyse in de populatiegenetica en de kwantitatieve genetica uit te voeren (bvb interpretatie populatiegenetische structuur aan de hand van standaard parameters van genetische diversiteit en differentiatie; inschatten overerfbaarheid)
    - een eenvoudig evolutionair-ecologisch onderzoek uit te werken met oog voor kritische elementen uit de design die moeten toelaten het verschil te maken tussen fysiologische acclimatisatie en genetische adaptatie
    - literatuurgegevens en de resultaten van evolutionair-biologische studies kritisch te analyseren en te bespreken
    - een evolutionaire benadering toe te passen op nieuwe themata en case studies, inclusief toepassingen in landbouw, natuurbehoud, industrie en gezondheidszorg
     

    Begintermen

    Een basiskennis biologie en ecologie is vereist. Zo mogelijk wordt deze OPO opgenomen na een inleidende cursus in de ecologie. Indien geen basiskennis ecologie en biologie is het mogelijk de cursus te volgen, mits de student bereid is zich tevens in te werken in deze materie.

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0D15A: Evolutiebiologie

    Onderwijsleeractiviteiten

    Evolutiebiologie (B-KUL-G0N19a)

    4.5 studiepunten : College 39 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Deel I: De Basis

    Hoofdstuk 1: Situering en case studies           
    - Definitie evolutie en het onderzoeksdomein van de evolutionaire biologie 
    - Darwin’s theorie van evolutie door natuurlijke selectie        
    - Case studies: Snavelkenmerken bij de Darwinvinken; lokale adaptatie bij guppies in Trinidad; genetische adaptatie herbivore insecten aan hun gastheerplant; genetische differentiatie en adaptatie bij bacteriën   
                
    Hoofdstuk 2: Inleiding tot de populatiegenetica
    - Genetische diversiteit: mutaties, segregatie en recombinatie    
    - Evolutiefactoren: mechanismen en gevolgen       
       - Mutatiedruk          
       - Meiotic drive     
       - Genmigratie
       - Natuurlijke selectie
             - Definitie van fitness    
             - Stabiliserende, disruptieve en gerichte selectie
             - Het bepalen van de relatieve fitness van genotypes   
             - Een formele benadering voor veranderingen in genfrequenties door  natuurlijke selectie
             - Natuurlijke versus seksuele selectie      
        - Genetische drift     
        - De gezamenlijke invloed van verschillende evolutiefactoren
    - Homozygositeit en heterozygositeit    
         - Veranderingen in het aandeel homozygoten     
         - Heterozygositeit 
    - Neutrale evolutie
          - De effectieve populatiegrootte Ne  
      - Genetische polymorfie 
              -  Neutrale mutaties     
              -  Heterosis    
              -  Frequentie-afhankelijke selectie   
              - Heterogeniteit van de omgeving       
    - Algemeen perspectief: selectionisme en neutralisme    

    Hoofdstuk 3: Het gebruik van moleculaire merkers in de ecologie 

    Hoofdstuk 4: Inleiding tot de kwantitatieve genetica 
    - Kwantitatieve en kwalitatieve kenmerken        
    - De overerfbaarheid van kenmerken   
    - Overerfbaarheidsschattingen: methodes      
        - Nakomeling-op-ouder regressie      
        - Sib-analyse  
        - Clonale repeteerbaarheidsanalyse   
        - Selectie-experimenten     
    - Overerfbaarheidsschattingen: patronen      
    - Fenotypische plasticiteit     
          - Modulatie en “developmental conversion”        
          - Reactienormen       
          - Genotype-omgevingsinteractie   
          - Evolutionair belang van genotype-omgevingsinteracties 
    - Genetische correlaties 
          - Tussen kenmerktoestanden       
          - Tussen kenmerken     
    - Genotype-omgevingscovariantie       
          - Cogradiënt- en tegengradiëntvariatie
    - Drempelkenmerken en genetische assimilatie


    Deel II: Topics

    Hoofdstuk 5: Evolutionair ontstaan en behoud van seksuele reproductie
    - Seksuele reproductie en recombinatie       
    - Seksuele reproductie en geslachtsdifferentiatie         
         - Partnerkeuze        
         - Geslachtsbepaling  
         - Sekse-verhouding (sekse-ratio)     
    - Een evolutionaire verklaring voor het behoud van seksuele reproductie   
    - De kosten van seksuele recombinatie    
          - Kosten die niet zijn afgeleid van anisogamie (de kost van recombinatie, de cellulair-mechanische kosten, kosten van bevruchting)
          - Kosten die zijn afgeleid van anisogamie (de kost van genoomdilutie; de kost van seksuele selectie)
          - Gerealiseerde kost 
    - De adaptieve voordelen van seksuele recombinatie     
          - “Müller’s ratchet”   
          - Mutatielast   
          - Evolutiesnelheid 
          - De Rode Koningin hypothese (“Red Queen Hypothesis”)
          - Fluctuerende selectie     
          - DNA repair      
          - Sib-competitie     
          - The Tangled-Bank hypothesis
    - Geografische parthenogenese

    Hoofdstuk 6: Evolutie van levensgeschiedeniskenmerken  
    - Levensgeschiedeniskenmerken    
        - Beperkingen       
        - Ruilfuncties; soorten ruilfuncties; hoe ontstaan ruilfuncties    
    - Leeftijd en grootte bij maturatie   
        - Een eenvoudig model     
    - Aantal nakomelingen    
    - Levensduur en overleving   

    Hoofdstuk 7: Ecologie en evolutie van induceerbare verdedigingsmechanismen
    - Voorwaarden voor de evolutie van induceerbare verdedigingsmechanismen   
    - Induceerbare verdedigingsmechanismen en coëvolutionaire wapenwedlopen  
    - Ecologische gevolgen van induceerbare verdedigingsmechanismen    
    - De effectiviteit van induceerbare verdedigingsmechanismen   
         - Gelokaliseerde versus systemische respons 
         - Predator- en kenmerk-afhankelijkheid van de respons 
         - Timing en reversibiliteit van de geïnduceerde verdediging
         - Transgenerationele inductie van verdedigingen bij planten en dieren
         - De densiteits- en context-afhankelijkheid van de respons   
    - De evolutie van indirecte geïnduceerde verdediging bij planten: Tritrofische interacties
    - De variatie in induceerbare verdedigingen   

    Hoofdstuk 8: Gastheer-parasiet co-evolutie
    - Het co-evolutionair proces in het algemeen
    - Het co-evolutionair proces in gastheer-parasiet systemen  
    - Modellen van gastheer-parasiet co-evolutie 
    - Evolutie van virulentie in gastheer-parasiet co-evolutie
         - Genetische correlaties kunnen virulentie onderhouden  
         - Het voorspellen van de evolutie van virulentie 
    - Verticale transmissie
    - Nieuwe gastheer-parasiet associaties
    - Manipulatie van het gastheergedrag door parasieten

    Hoofdstuk 9 Toepassingen van evolutionaire biologie (landbouw, natuurbehoud, industrie, gezondheid)

    Studiemateriaal

    • Cursus "Evolutiebiologie"
    • Handboek "Evolutionary analysis" (Freeman & Herron)
    • Powerpoint presentaties
    • Toledo

    Evolutiebiologie: practicum (B-KUL-G0S03a)

    1.5 studiepunten : Practicum 26 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Practicum:
    - KWANGEN: een kwantitatief genetisch experiment
        - opzet en uitvoering
        - data-analyse
        - bespreking en conceptuele inkadering; kritische discussie design
    - POPGEN Populatiegenetische analyse aan de hand van moleculaire merkers: berekening parameters genetische diversiteit en differentiatie, interpretatie en kritische discussie
     

    Studiemateriaal

    Handleiding

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Evolutiebiologie (B-KUL-G2N19c)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk
    Vraagvormen : Open vragen

    Toelichting

    De bijdragen tot de eindscore zijn 10% voor het practicum en 90% voor het theoretisch examen. Een student is geslaagd bij een eindscore hoger dan of gelijk aan 10. Deelname aan het practicum is verplicht; zonder evaluatie voor de praktische oefeningen kan de student niet deelnemen aan het examen en dus ook niet slagen voor het OPO (NA).

     

    Toelichting bij herkansen

    De wijze van examineren blijft dezelfde als in de eerste zittijd. De eerder behaalde score op het practicum wordt in de regel ongewijzigd overgenomen. Zonder evaluatie van het practicum is ook geen herkansing mogelijk en is de student automatisch niet geslaagd voor dit OPO in het betrokken academiejaar.

    ECTS Dynamische biochemie (B-KUL-G0N20E)

    6 studiepunten Nederlands 52 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De student kan:

    • de thermodynamische principes toelichten die bepalend zijn voor het verloop van biochemische reacties en de stabiliteit van biomoleculen; de structuur van een biomolecule zoals bekomen uit X-stralenstructuurbepaling uitleggen in termen van secundaire en tertiaire structuurelementen en het vouwproces bespreken
    • de verschillende dynamische processen analyseren die plaatsgrijpen in biologische membranen  en de technieken benoemen om deze te karakteriseren
    • de algemene principes van katalyse toelichten die de werking van enzymen beheersen; de betekenis uitleggen van de verschillende enzymatische parameters; enzymatische modellen in vergelijkingen omzetten en omgekeerd; de verschillende mogelijkheden opsommen die de natuur gebruikt voor de controle van enzymatische activiteit; het verband leggen tussen de verschillende motorproteïnen en de omzetting van chemische energie in beweging
    • de verschillende stappen in de biochemische reactiewegen van het cellulair metabolisme van suikers, vetten, aminozuren en nucleotiden beschrijven en becommentariëren (meer in het bijzonder de gluconeogenese, de synthese en afbraak van glycogeen, de pentosefosfaatweg, de synthese en afbraak van lipiden, aminozuren en nucleotiden); de structuurformules van de metabolische intermediairen en cofactoren in deze reactiewegen op een figuur herkennen en benoemen; de structuurformules van de sleutelintermediairen in deze reactiewegen tekenen
    • aangeven waar (in welk celcompartiment, cel- of weefseltype) de diverse metabolische reacties plaatsvinden; opname, transport en afgave van metabolische stoffen in het (menselijk) lichaam overzichtelijk schetsen
    • uitleggen hoe de verschillende metabolische reactiewegen op moleculair niveau geregeld worden
    • de onderling verbanden en wisselwerking tussen de metabolische reactiewegen verduidelijken en de dynamiek ervan beredeneren; onderscheid maken in stofwisseling en taakverdeling tussen de diverse weefsels tijdens wisselende fysiologische condities

    Begintermen

    Elementaire kennis van chemie en biologie, de principes van chemische evenwichten en reactiekinetiek, de structuur van suikers, lipiden, aminozuren en nucleotiden en de algemene opbouw van nucleïnezuren en eiwitten.

    Grondige kennis en inzicht in de biochemische reactiewegen die leiden tot cellulaire energieproductie (glycolyse, citroenzuurcyclus en oxidatieve fosforylering) zoals behandeld in het OPO Celbiologie en Biochemie

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0B44B: Dynamische biochemie
    X0B44D: Dynamische biochemie

    Onderwijsleeractiviteiten

    Dynamische Biochemie: oefeningen (B-KUL-G00A4a)

    1.5 studiepunten : Practicum 26 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Tijdens de werkzittingen pas je de concepten die tijdens het college of in de online materialen aan bod zijn gekomen toe en verwerk je ze a.d.h.v. oefeningen.

    Studiemateriaal

    De leermaterialen en de oefeningen worden ter beschikking gesteld via Toledo.

    Toelichting werkvorm

    Oefensessie

    Tijdens de sessie ga je in groepjes collaboratief aan de slag om de concepten die tijdens het college of op Toledo aan bod zijn gekomen toe te passen m.b.v. oefeningen en casussen. Op die manier zal je de concepten beter verwerken en scherp je ook je kritische en probleemoplossende denkvaardigheden aan.

    Dynamische biochemie: college (B-KUL-G0N20a)

    4.5 studiepunten : College 26 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    De inhoud van de cursus is gebaseerd op het boek "Biochemistry" van de auteurs Garrett en Grisham, en omvat volgende onderdelen (hoofdstukken):

    • Thermodynamica van biologische systemen (3)
    • Proteïnen: secundaire, tertiaire en quaternaire structuur (6)
    • Membranen en membraantransport (9)
    • Enzymkinetiek en -specificiteit (13)
    • Enzymmechanismen (14)
    • Enzymregulatie (15)
    • Moleculaire motoren (16)
    • Metabolisme – een overzicht (17)
    • Gluconeogenese, glycogeenmetabolism, en de pentosefosfaatweg (22)
    • Vetzuurafbraak (23)
    • Biosynthese van lipiden (24)
    • Stikstofopname en aminozuurmetabolisme (25)
    • Synthese en afbraak van nucleotiden (26)
    • Metabolische integratie en orgaanspecialisatie (27)

    Studiemateriaal

    Handboek: Garrett and Grisham "Biochemistry", 5de editie, ©2013 Brooks/Cole, Cengage Learning
    Slides colleges

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Dynamische biochemie (B-KUL-G2N20e)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    Verdere informatie over het examen is beschikbaar in Toledo.

    ECTS Fysiologie van dieren: van cel tot organisme (B-KUL-G0N21D)

    6 studiepunten Nederlands 48 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract
    De Groef Lies (coördinator) |  De Groef Lies |  Moons Lieve |  N. |  Farrow Karl (plaatsvervanger)

    Doelstellingen

    Deze cursus laat de student zich verdiepen in de organismale, cellulaire en moleculaire mechanismen waarmee essentiële levensfuncties zoals de circulatie, de ademhaling, de vertering en de excretie zich voltrekken in het dier. In eerste instantie verkrijgt de student inzicht in het werkingsmechanisme en de functie van processen ter hoogte van de cel. De kennis van de cellulaire fysiologische processen is een vereiste voor het begrijpen van het functioneren van organen en de stelsels waaroe deze behoren. Door een vergelijkende aanpak leert de student hoe deze systemen geëvolueerd zijn en hoe de fysiologie van een dier is aangepast aan het milieu waarin het leeft. De student verwerft inzicht in de neurale en hormonale controlesystemen die de werking van de verschillende stelsels op elkaar afstellen en het dier toelaten adequaat te reageren op stimuli vanuit de omgeving.

    Naast het bijbrengen van diepgaande kennis en inzicht in de cel- en dierfysiologie en mogelijke toepassingen in verwante vakgebieden, stelt het OPO zich tot algemeen doel de zelfwerkzaamheid en kritische geest van de student te stimuleren. Van de student wordt verwacht dat hij/zij onder begeleiding - zelfstandig of in groepsverband - de leerstof verwerkt en kan toepassen op actuele thema’s en probleemstellingen.

    Begintermen

    De cursus bouwt verder op de basiskennis van de dierlijke orgaanstelsels, zoals ondermeer aangereikt in het OPO 'Bouw en functie van dieren'. Tevens is een grondige kennis van celbiologie en biochemie vereist, zoals aangereikt in het OPO Celbiologie en biochemie. Kennis van een vakspecifiek vocabularium en algemene biologische basisbeginselen zijn dus noodzakelijk.

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0D17B: Fysiologie van dieren
    X0D17A: Fysiologie van dieren

    Onderwijsleeractiviteiten

    Fysiologie van dieren: van cel tot organisme (B-KUL-G0N21a)

    6 studiepunten : College 48 Eerste semesterEerste semester
    De Groef Lies |  Moons Lieve |  N. |  Farrow Karl (plaatsvervanger)

    Inhoud

    In een inleidend hoofdstuk wordt besproken hoe fysiologische controlesystemen werken en hoe ze ervoor zorgen dat het lichaam steeds in een soort van evenwichtstoestand verkeert (homeostase), bvb. Hoe zorgt het lichaam ervoor dat alle cellen steeds van voldoende zuurstof worden voorzien, zelfs al beweegt het dier zich in een zuurstofarm milieu?

    Een volgend hoofdstuk levert inzicht in celfysiologische processen als brug tussen moleculaire biologie en systeemfysiologie, en behandelt ondermeer fundamentele fysicochemische concepten in cellen, ionenkanalen en exciteerbare membranen, transport van water en opgeloste stoffen en de moleculaire motoren voor spiercontractie.

    In hoofdstuk 3 wordt de cruciale rol van het (autonoom) zenuwstelsel en het hormonaal stelsel benadrukt. De integratie van fysiologische processen door deze beide stelsels loopt als een rode draad doorheen de verdere cursus.

    In de volgende hoofdstukken wordt meer in detail gekeken naar de fysiologie van de circulatie, ademhaling, vertering en excretie. We gaan na hoe al deze belangrijke functies vervuld worden, van het organismaal niveau (bvb. Hoe is het spijsverteringsstelsel van een kameel uitgerust om plantenmateriaal te verteren?) tot op cellulair en moleculair niveau (bvb. Welke enzymatische reacties treden op in de kamelenmaag om cellulose af te breken?) en we bekijken hoe de werking van de stelsels aangepast wordt aan de noden van het dier (bvb. Hoe reageren het cardiovasculair stelsel en het ademhalingsstelsel wanneer een zeehond onder water duikt?). Regelmatig wordt verwezen naar pathologische situaties waarin de nomale werking van een stelsel verstoord is en welke gevolgen dit voor het dier kan hebben. Door de fysiologische processen te vergelijken bij verschillende diergroepen proberen we algemeen geldende principes af te leiden, evolutielijnen uit te tekenen en specifieke adaptaties aan het milieu te onderscheiden.

    Studiemateriaal

    Engelstalig boek: Medical physiology (eds W.F. Boron, E.L. Boulpaep)
    Nederlandstalige cursus: Fysiologie van Dieren (eds Lieve Moons, Lies De Groef, Sylvia Grommen)

    Pdf files van de powerpoint presentaties (via Toledo)

    Engelstalige wetenschappelijke artikels

     

    Toelichting onderwijstaal

    De cursus wordt in het Nederlands gegeven, maar Prof. Dr. Karl Farrow (verbonden aan het departement Biologie en NERF) komt als gastdocent enkele lessen over celfysiologie doceren in het Engels.

    Toelichting werkvorm

    Blended onderwijs - Casusgebaseerd college - Hoorcollege

    Tijdens de hoorcolleges worden de belangrijkste theoretische concepten uitgelegd en toegelicht welke leerstof de studenten zelf nog verder dienen te verwerken. Tijdens de werkzittingen worden er vervolgens wetenschappelijke casussen, oefeningen en praktijkvoorbeelden besproken om deze theorie toe te passen en verder uit te diepen. Studenten werken hiervoor in groepjes.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Fysiologie van dieren: van cel tot organisme (B-KUL-G2N21d)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Mondeling, Schriftelijk
    Vraagvormen : Open vragen, Gesloten vragen
    Leermateriaal : Rekenmachine

    Toelichting

    Het examen bestaat uit 4 onderdelen: (i) open vragen die naar kennis van de theorie en inzicht peilen; (ii) verklaring van biologische termen (definities); (iii) een oefening over celfysiologie; en (iv) een wetenschappelijke casus. De vragen bestrijken de hele cursus. De student slaagt indien de gewogen eindscore (optelling deelscores) minstens 10/20 bedraagt.

    ECTS Wiskunde II (B-KUL-G0O17D)

    6 studiepunten Nederlands 54 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De student leert de noodzakelijke wiskundige basis voor de natuurwetenschappelijke opleidingsonderdelen.

    Begintermen

    Wiskundige basiskennis uit het secundair onderwijs, onder andere afgeleiden en integralen. Calculus van functies van één en meerdere veranderlijken (voor meer info zie G0N02A Wiskunde I).

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0E13A: Wiskunde II
    X0F12A: Wiskunde II

    Onderwijsleeractiviteiten

    Wiskunde II, deel 1: hoorcollege 1 (B-KUL-G0O17a)

    1.5 studiepunten : College 12 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    1) Stelsels lineaire vergelijkingen, Gauss eliminatie
    2) Matrices en matrixbewerkingen, inverse matrix, getransponeerde matrix, symmetrische en orthogonale matrices.
    3) Determinanten, eigenschappen, regel van Cramer, vectorproduct, oppervlakte van parallellogram.
    4) Eigenwaarden en eigenvectoren, diagonaliseerbare matrices.
    5) Toepassing op stelsels differentiaalvergelijkingen, linearisatie rond evenwichtspunt, stabiliteit.
    6) Reeksen, convergentie en divergentie, machtreeksen en Taylorreeksen
    7) Fourierreeksen, orthogonaliteit van goniometrische functies

    Studiemateriaal

    Cursustekst

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    G0O17E : Wiskunde II, deel 1

    Wiskunde II, deel 2: hoorcollege 2 (B-KUL-G0O18a)

    1.5 studiepunten : College 12 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    1) Fouriertransformatie en Fourierintegralen  
    2) Meervoudige integralen, verandering van veranderlijken, Jacobiaan.
    3) Vectorvelden, divergentie en rotor  
    4) Lijnintegralen en stelling van Green  
    5) Oppervlakte-integralen, flux, stellingen van Gauss en Stokes 

    Studiemateriaal

    Course notes

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    G0O17F : Wiskunde II, deel 2

    Wiskunde II, deel 1: oefeningen 1 (B-KUL-G0O20a)

    1.5 studiepunten : Practicum 18 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    1) Stelsels lineaire vergelijkingen, Gauss eliminatie
    2) Matrices en matrixbewerkingen, inverse matrix, getransponeerde matrix, symmetrische en orthogonale matrices.
    3) Determinanten, eigenschappen, regel van Cramer, vectorproduct, oppervlakte van parallellogram.
    4) Eigenwaarden en eigenvectoren, diagonaliseerbare matrices.
    5) Toepassing op stelsels differentiaalvergelijkingen, linearisatie rond evenwichtspunt, stabiliteit.
    6) Reeksen, convergentie en divergentie, machtreeksen en Taylorreeksen
    7) Fourierreeksen, orthogonaliteit van goniometrische functies

    Studiemateriaal

    Cursustekst

    Toledo

    Toelichting werkvorm

    Oefensessie

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    G0O17E : Wiskunde II, deel 1

    Wiskunde II, deel 2: oefeningen 2 (B-KUL-G0O21a)

    1.5 studiepunten : Practicum 12 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    1) Fouriertransformatie en Fourierintegralen 
    2) Meervoudige integralen, verandering van veranderlijken, Jacobiaan.
    3) Vectorvelden, divergentie en rotor 
    4) Lijnintegralen en stelling van Green 
    5) Oppervlakte-integralen, flux, stellingen van Gauss en Stokes 
    6) Kennismaking met MATLAB.

    Studiemateriaal

    Cursustekst

     K. Meerbergen  et al, Leren werken met MATLAB, Acco Leuven, 2012

    Toledo

     

    Toelichting werkvorm

    Oefensessie

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    G0O17F : Wiskunde II, deel 2

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Wiskunde II (B-KUL-G2O17d)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Cursusmateriaal, Rekenmachine

    Toelichting

    Partiële evaluatie door middel van MATLAB opdracht met afrondend examen tijdens de examenperiode.

    Toelichting bij herkansen

    Indien reeds voldoende behaald is, is vrijstelling van Matlab opdracht mogelijk.

    ECTS Veiligheid en laboratoriumpraktijk (B-KUL-G0O26B)

    3 studiepunten Nederlands 52 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract
    Debroye Elke (coördinator) |  Debroye Elke |  Depotter Griet |  Smet Mario

    Doelstellingen

    Tijdens dit practicum wordt de zelfwerkzaamheid van de student stapsgewijs opgebouwd en worden een aantal belangrijke praktijk/beroepsgeoriënteerde vaardigheden aangeleerd. Hiertoe worden de studenten gestimuleerd om zich in drie vaardigheidsdomeinen verder te ontwikkelen:
    1. Het cognitieve vaardigheidsdomein
    − Het toepassen van de reeds gekende concepten om vertrouwde problemen op te lossen.
    − Het evalueren, interpreteren en synthetiseren van informatie en gegevens.
    − Het herkennen en implementeren van goede laboratoriumpraktijken.
    − Het beheersen van het begrippenkader van veiligheid, gezondheid en milieu (VGM) en duurzaamheid.

    - Het kunnen opsommen van een aantal maatregelen in het domein van technologie en wetenschap die geschikt zijn om duurzaamheid te vergroten en toelichten welke impact ze (kunnen) hebben.


    2. Het praktische vaardigheidsdomein
    − Het op verantwoorde wijze omgaan met veiligheid, gezondheid en milieu in de labosituatie.
    − Het opstarten, uitvoeren en interpreteren van basisexperimenten zoals extractie, destillatie en eenvoudige synthese.
    − Het plannen en afwerken binnen een bepaalde tijd van een opdracht of experiment.
    − Het uitvoeren van risicoanalyses.


    3. Het transfer vaardigheidsdomein
    − Het schriftelijk communiceren van resultaten.
    − Het nauwkeurig bijhouden van een laboschrift.
    − Het toepassen van opzoekstrategieën om essentiële informatie uit onder andere databanken te halen.
    − Het werken in teamverband met de daarbij horende sociale interacties.

    Begintermen

    - De studenten bezitten reeds een basiskennis van de taal en de concepten die aangewend worden in de chemie.   

    - De studenten zijn reeds vertrouwd met een laboratoriumomgeving en kunnen reeds een aantal basistechnieken uit de chemische praktijk toepassen.

     

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0A93B: Veiligheid & laboratoriumpraktijk

    Onderwijsleeractiviteiten

    Veiligheid en laboratoriumpraktijk (B-KUL-G0O26a)

    3 studiepunten : Practicum 52 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    • oplossen van concrete vragenset in verband met veiligheid, gezondheid en milieu via begeleide zelfstudie
    • opstellen risicoanalyse
    • scheiding van een neutrale stof en een base, een neutrale stof en een zuur, een base en een zuur via extractie
    • dunnelaagchromatografie
    • smeltpuntsbepaling
    • enkelvoudige en meervoudige gefractioneerde destillatie
    • synthese van HCl en NH3
    • synthese van superhydrofobe oppervlakken
    • synthese waterstof en zuurstof

    Studiemateriaal

    Brochure "Creatieve verantwoordelijkheid in de chemie", website veiligheid departement chemie en dienst VGM KU Leuven.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Veiligheid en laboratoriumpraktijk (B-KUL-G2O26b)

    Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Paper/Werkstuk, Ontwerp/Product, Verslag, Self assessment/Peer assessment, Medewerking tijdens contactmomenten, Vaardigheidstoets

    Toelichting

    Dit OPO komt niet in aanmerking voor tolerantiekrediet

     

    Evaluatie onderdeel veiligheid:
    −paper (als antwoord op vragenset)

    −risicoanalyse en ecoscore


    Evaluatie onderdeel laboratoriumpraktijk:
    −medewerking tijdens contactmomenten
    −verslag
    −laboschrift
    −prelabtesten
    −uitvoering en resultaten experimenten

    De evaluatieactiviteiten vinden plaats in de loop van het semester (permanente evaluatie).
    Voor het onderdeel laboratoriumpraktijk wordt geen herexamen aangeboden.
    Alle sessies (on-campus en online opdrachten hieraan verbonden) zijn verplicht. Indien ongewettigd afwezig of bij niet inleveren van opdrachten zal de toegang tot het examen geweigerd worden.
    Een student kan enkel slagen indien hij /zij geslaagd is voor beide onderdelen veiligheid en laboratoriumpraktijk.

    Toelichting bij herkansen

    Voor het luik laboratoriumpraktijk is geen herkansing mogelijk. 

    Er is uitsluitend herkansing mogelijk voor het luik veiligheid. Om van deze herkansingsmogelijkheid gebruik te maken brengt de student de coördinator hiervan op de hoogte tijdens de feedbackperiode van de junizittijd en levert de student een verbeterde/nieuwe versie in van volgende werkstukken:

    1) de paper in het kader van de bibliotheekopdracht

    2) de risicoanalyse en bepaling van de ecoscore

    Indiening gebeurt via e-mail aan de coördinator ten laatste op 20 augustus.

    ECTS Chemische thermodynamica (B-KUL-G0O31B)

    6 studiepunten Nederlands 44 Eerste semesterEerste semester

    Doelstellingen

    Dit opleidingsonderdeel beoogt een verdere uitdieping van de thermodynamische begrippen, zoals ingeleid voor gasfasereacties in de cursus "Grondslagen van de chemie".
    De nadruk hier ligt enerzijds op een meer uitvoerige en moleculaire beschrijving van thermodynamische functies en anderzijds op een beschrijving van de thermodynamische grootheden in multi-component systemen, multi-fase systemen en in oplossing.
    De specifieke doelstellingen zijn :

    • De studenten zijn in staat om de eerste hoofdwet van de thermodynamica te begrijpen en toe te passen op reversibele en irreversibele processen.
    • De studenten beheersen de principes van de thermochemie en kunnen deze gebruiken in oefeningen.
    • De studenten begrijpen de tweede en derde hoofdwet van de thermodynamica en kunnen deze toepassen op reversibele en irreversibele processen.
    • De studenten kunnen de thermodynamische functies gebruiken voor de beschrijving van toestandsveranderingen in zuivere stoffen.
    • De studenten kunnen de thermodynamische functies gebruiken voor de beschrijving van mengsels.
    • De studenten kunnen de thermodynamische functies gebruiken voor de beschrijving van chemische reacties en electro-chemische processen.
    • De studenten kunnen de thermodynamische functies gebruiken voor de beschrijving van oppervlakteverschijnselen.
    • De student kan een aantal fundamentele duurzaamheidsproblemen waarmee onze maatschappij op een begrensde planeet te kampen heeft kritisch relateren aan de fundamentele wetten van de thermodynamica en tevens thermodynamische inzichten aanwenden om oplossingen hiertoe te suggereren.

    Begintermen

    Basiskennis algebra (differentiaalrekening, integralen, Taylor en MacLaurin expansie).
    Basiskennis algemene chemie.

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0D03B: Thermodynamica
    X0D03A: Chemische thermodynamica
    X0D03C: Thermodynamica

    Onderwijsleeractiviteiten

    Chemische thermodynamica (B-KUL-G0O31a)

    3.3 studiepunten : College 24 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    A. Eerste hoofdwet van de thermodynamica, basisbegrippen : vrije-energie, warmtecapaciteit bij constante druk of constant volume, enthalpie 
    B. Eerste hoofdwet van de thermodynamica, toepassingen : expansie van gassen
    C. Thermochemie
    D. Tweede hoofdwet van de thermodynamica : entropie, Carnot cyclus, statistische behandeling van entropie, thermodynamische functies, chemische potentiaal, derde wet
    E. Toestandsveranderingen van zuivere stoffen
    F. Mengsels: partieel molaire grootheden, mengsels van gassen, vloeistofmengsels, colligatieve eigenschappen, activiteiten, faseregel van Gibbs, fasediagramma's 
    G. Chemische evenwicht: evenwichtsconstante, druk- en temperatuursafhankelijkheid van evenwichtsconstante.
    H. Oppervlakteverschijnselen: oppervlaktespanning, twee-dimensionale gaswet
    I. Electrochemie: ionische activiteit, electrochemische potentiaal, membraanpotentiaalverschillen, galvanische cellen, emf, standaard-electrodepotentialen.
    J. Kinetisch gasmodel

    Studiemateriaal

    cursus + slides + toledo

    Chemische thermodynamica: oefeningen (B-KUL-G0O32a)

    2.5 studiepunten : Practicum 18 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    A. Thermodynamische functies: Helmholtz-vrije-energie, warmtecapaciteit bij constante druk of constant volume, Carnot-cyclus, efficiëntie van omzetting van warmte in arbeid
    B. Moleculaire statistische interpretatie: kinetische-gastheorie, Boltzmann-energieverdeling, statistische behandeling van entropie (Boltzmann-formule)
    C. Multi-component systemen: partiële molaire grootheden, chemische potentiaal, colligatieve eigenschappen
    D. Fase-evenwichten: toestandsverandering: fase-evenwicht in één-component systeem (superkritische vloeistoffen, Clausius-Clapeyron), faseregel van Gibbs, fasediagramma voor multi-component systemen (sublimatie, destillatie), interfase-effecten (oppervlaktespanning en Langmuir-adsorptie)
    E. Thermodynamica van oplossingen: rol van het solvent, ionen in waterige oplossing, ionische sterkte, activititeit, activiteitscoëfficiënt, Debye-Hückel theorie, activiteitscoëfficiënten uit elektrochemie.

    Studiemateriaal

    nota's

    Toelichting werkvorm

    Oefensessie

    Chemische thermodynamica: opdracht (B-KUL-G0Y19a)

    0.2 studiepunten : Opdracht 2 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    wetenschappelijke literatuur rond thema's die in de les besproken worden, zoals bv gasexpansie, hydrofoob effect, chemische potentiaal, thermodynamische stabiliteit, fasendiagramma's

    Studiemateriaal

    artikels uit wetenschappelijke literatuur

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Chemische thermodynamica (B-KUL-G2O31b)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Mondeling
    Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen, Gesloten vragen
    Leermateriaal : Formularium, Rekenmachine

    ECTS Practicum: synthese & karakterisatie (B-KUL-G0O33B)

    6 studiepunten Nederlands 156 Beide semestersBeide semesters Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De studenten herkennen de basistechnieken in de (an)organische en analytische chemie.
    De studenten komen voorbereid naar het laboratorium en worden hierop gecontroleerd via prelabtesten.
    De studenten kunnen op basis van een uitgeschreven handleiding met kennis van zaken een eenvoudige synthese uitvoeren binnen een beperkt tijdsbestek.
    De studenten kunnen op een nauwkeurige en kritische manier hun werk uitvoeren en hebben een idee van de foutenmarge op hun resultaten.
    De studenten kunnen op een kwaliteitsvolle manier een product na synthese opzuiveren en karakteriseren.
    De studenten kunnen de bekomen resultaten interpreteren en rapporteren via een elektronisch laboschrift.
    De studenten kunnen op een veilige manier met chemicaliën omgaan, met aandacht voor milieu-aspecten.

    Begintermen

    Basiskennis en -vaardigheden opgedaan in het opleidingsonderdeel 'Veiligheid en Laboratoriumpraktijk' uit de bachelor chemie of gelijkwaardig.

    Studenten die zich onvoldoende voorbereid voor een practicumsessie aandienen, kan de toegang tot het practicum worden ontzegd.

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    ( GELIJKTIJDIG( G0O35A ) OF GELIJKTIJDIG( X0C22B ) )AND ( GELIJKTIJDIG( G0O29B ) OF GELIJKTIJDIG( G00D8A ) OF GELIJKTIJDIG( X0D07B ) )


    G0O35AG0O35A : Organische chemie
    X0C22BX0C22B : Organische chemie
    G0O29BG0O29B : Metalen en katalyse
    G00D8AG00D8A : Anorganische Chemie
    X0D07BX0D07B : Anorganische Chemie

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0C51B: Practicum: synthese en karakterisatie
    X0C51C: Practicum: synthese en karakterisatie

    Onderwijsleeractiviteiten

    Practicum: synthese & karakterisatie (B-KUL-G0O33a)

    3 studiepunten : Practicum 78 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Een korte inleidende sessie met bijkomende uitleg aangaande werkvorm (prelab, online laboschrift (ELN)), technieken, veiligheids- en milieuaspecten, evaluatie.

    Vervolgens 9 practicumsessies waar o.a. de volgende technieken aan bod komen:

    • Analytische chemie: gravimetrie, titratie, AAS/AES, fluorescentie- en absorptiespectroscopie, data verwerking..
    • Organische chemie: reflux, stoomdestillatie, (soxhlet)extractie, chromatografie (kolom,TLC), sublimatie, bepalen van de brekingsindex, gaschromatografie, …

     

    Studiemateriaal

    Toledo leermodule
    Labohandleidingen (via ELN)

    Toelichting werkvorm

    Practicum in sessies van 6 uur onder begeleiding van assistenten. (2x3u met middagpauze)
    Verplichte voorbereiding via online laboschrift.
    Prelabtoetsen

    Practicum: synthese & karakterisatie: vervolg (B-KUL-G0O34a)

    3 studiepunten : Practicum 78 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    7 practicumsessies waar o.a. de volgende technieken aan bod komen (toevoeging aan deze beschreven in G0O33a):

    • Anorganisch: testreacties,..
    • Organisch: testreacties, sublimatie, smeltpuntbepaling, gefractioneerde (vacuüm)destillatie, werken onder inerte atmosfeer, werken met naalden/spuiten, herkristallisatie, polarimetrie, IR spectroscopie, …

    2 practicumsessies van 3u waarin studenten in groep (per 2/3) een practicum begeleiden voor leerlingen uit het secundair onderwijs (3e graad).

    Studiemateriaal

    Zie onderwijsleeractiviteit G0O33a.

    Toelichting werkvorm

    Zie onderwijsleeractiviteit G0O33a. Sessies van 7u (2x3,5u met middagpauze)

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Practicum: synthese & karakterisatie (B-KUL-G2O33b)

    Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Verslag, Medewerking tijdens contactmomenten, Procesevaluatie
    Leermateriaal : Cursusmateriaal

    Toelichting

    Practica (on-campus en online opdrachten hieraan verbonden) zijn verplicht. Ongewettigde afwezigheid of het niet inleveren van opdrachten, zal resulteren in "niet afgelegd".

    Studenten die zich onvoldoende voorbereid voor een practicumsessie aandienen, kan de toegang tot het practicum worden ontzegd.

    Permanente evaluatie door assistenten/docenten: voorbereiding (prelab) (30% gewicht), resultaten (30% gewicht), werkhouding (10% gewicht).
    Online Laboratoriumschrift : inhoud, vorm, rapporteren van de resultaten (30 % gewicht).
    Voor dit OPO wordt geen herexamen aangeboden.

    Dit opleidingsonderdeel kan niet getolereerd worden.

    Toelichting bij herkansen

     

    ECTS Organische chemie (B-KUL-G0O35A)

    6 studiepunten Nederlands 50 Tweede semesterTweede semester

    Doelstellingen

    Door dit opleidingsonderdeel moeten de studenten een grondige kennis verwerven van de belangrijkste concepten in de organische chemie (reactiviteit van verschillende functionele groepen, eigenschappen en mechanismen van de verschillende types van reacties, conformationele analyse, stereochemie). 
    De studenten moeten
    - het reactiemechanisme kennen voor verschillende types van reacties (eliminatie, elektrofiele additie, nucleofiele substitutie, nucleofiele additie aan carbonylgroep van aldehyden en ketonen, nucleofiele acylsubstitutie, elektrofiele aromatische substitutie en nucleofiele aromatische substitutie)
    - kunnen de regio-en stereochemie van gevormde product(en) in een reactie voorspellen op basis van het reactiemechanisme
    - op basis van de bovengenoemde gekende reactiemechanismen een aanvaardbaar voorstel kunnen formuleren voor het reactiemechanisme van een ongeziene reactie
    - de structuur van verschillende functionele groepen (alkanen, alkenen, alkynen, allylsystemen, halogeenalkanen, alcoholen, thiolen, ethers, sulfiden, aldehyden, ketonen, zuren en zuurderivaten, aminen, aromaten) kennen en hun transformaties gebruiken om een voorstel tot synthese van een organisch molecule te formuleren (zie ook laatste doelstelling) 
    - een onderscheid kunnen maken op basis van 2D-voorstellingen tussen verschillende conformaties, constitutionele isomeren, stereo-isomeren. Op basis van 2D-voorstellingen moeten de studenten de conformatie (R,S) van stereo-isomeren kunnen bepalen, zonder gebruik te maken van molecuulmodellen. 
    - een reeks organische moleculen, ionen, of molecuulfragmenten kunnen ordenen volgens verschillende criteria (stabiliteit, zuurheid, basiciteit, aromaticiteit, reactiviteit in een bepaald reactietype)  
    - een aanvaardbaar voorstel kunnen geven voor de synthese van een gegeven product uitgaande van bepaalde startmaterialen.

    Begintermen

    De studenten moeten de fundamentele kennis beheersen van atoomstructuur (inclusief golffuncties, orbitalen, elektronenconfiguraties, sp3, sp2 en sp hybride orbitalen). Ze moeten kunnen Lewis-structuurformules schrijven en skeletstructuren tekenen voor (organische) moleculen. Daarbij moeten ze formele ladingen kunnen aangeven in die moleculen. Als er meerdere alternatieve Lewis-structuren mogelijk zijn, moeten ze die gedelokaliseerde structuren (ook resonantiehybriden genoemd) exact kunnen schrijven, waarbij het correct gebruik van het symbool van gebogen pijltjes essentieel is. Gebogen pijltjes moeten eveneens correct gebruikt kunnen worden om het verloop van chemische reacties te beschrijven. Een eenduidige naam voor eenvoudige organische moleculen moet kunnen gegeven worden. Tenslotte moeten de studenten de basisbegrippen over aromaticiteit (regel van Hückel), isomerie, chemisch evenwicht, zuur-base reacties (Brønsted-Lowry en Lewis-theoriën, pKa) en kinetica (inclusief Arrhenius-theorie) kennen en kunnen toepassen.

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    SOEPEL( G0N08A ) OF SOEPEL( X9X03B ) OF SOEPEL( X0E39B )


    G0N08AG0N08A : Bio-organische chemie
    X9X03BX9X03B : Bio-organische chemie
    X0E39BX0E39B : Bio-organische chemie


    Identieke opleidingsonderdelen

    X0C22B: Organische chemie
    X0C22C: Organische chemie

    Onderwijsleeractiviteiten

    Organische chemie (B-KUL-G0O35a)

    3.5 studiepunten : College 28 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    1. Herhaling en aanvulling: begintermen van dit OPO (zie hierboven), structuur van functionele groepen in organische chemie
    2. De belangrijkste reactietypes en hun mechanismen in organische chemie worden besproken aan de hand van concrete synthetisch belangrijke reacties: (i) eliminatie (E1 en E2) (ii) elektrofiele additie (iii) nucleofiele substitutie (SN1 en SN2) (iv) nucleofiele additie aan carbonyl van aldhyden en ketonen (v) nucleofiele acylsubstitutie (vi) elektrofiele aromatische substitutie (vii) nucleofiele aromatische substitutie
    3. Conformationele analyse en stereochemie van organische structuren worden uitgediept
    4. De retrosynthestische analysebenadering wordt reeds vroeg geïntroduccerd en wordt regelmatig herhaald
    5. De synthese en reactiviteit van de belangrijkste functionele groepen (alkanen, alkenen, alkynen, allylsystemen, halogeenalkanen, alcoholen, thiolen, ethers, sulfiden, aldehyden, ketonen, zuren en zuurderivaten, aminen, aromaten)
    6. Nucleofiele koolstof in organometaalverbindingen (Grignard en organolithium) en enolaten (aldolreacties en Claissen-condensatiereacties)
    7. Elektrofiele koolstof (carbokationen en hun omleggingen)

    Studiemateriaal

    Studiekost: 51-75 euro (De informatie over studiekosten zoals hier opgenomen is indicatief en geeft enkel de prijs weer bij aankoop van nieuw materiaal. Er zijn mogelijk ook e- en tweedehandskopijen beschikbaar. Op LIMO kan je nagaan of het handboek beschikbaar is in de bibliotheek. Eventuele printkosten en optioneel studiemateriaal zijn niet in deze prijs vervat.)

    • Organic Chemistry, 12th edition, Francis Carey and Robert Giuliano and Neil Allison and Susan Bane, ISBN 9781266159244

    • Cursusnotities op Toledo

    Toelichting onderwijstaal

    • De doceertaal is Nederlands, de notities op Toledo zijn in het Nederlands
    • Het handboek is Engelstalig

    Toelichting werkvorm

    • De inhoud van de cursus wordt mondeling in hoorcolleges via PowerPoint presentaties aangereikt. De pdf files van die PowerPoint voorstellingen zijn te raadplegen/downloaden op Toledo.
    • De studenten moeten enkele hoofdstukken via zelfstudie verwerken (ruim op voorhand aangekondigd via Toledo). Achteraf is er in het hoorcollege gelegenheid om meer uitleg te krijgen en vragen te stellen over die specifieke hoofdstukken.   

    Organische chemie: oefeningen (B-KUL-G0O36a)

    2.5 studiepunten : Practicum 22 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    1. Herhaling en aanvulling: begintermen van dit OPO (zie hierboven), structuur van functionele groepen in organische chemie
    2. De belangrijkste reactietypes en hun mechanismen in organische chemie worden besproken aan de hand van concrete synthetisch belangrijke reacties: (i) eliminatie (E1 en E2) (ii) elektrofiele additie (iii) nucleofiele substitutie (SN1 en SN2) (iv) nucleofiele additie aan carbonyl van aldhyden en ketonen (v) nucleofiele acylsubstitutie (vi) elektrofiele aromatische substitutie (vii) nucleofiele aromatische substitutie
    3. Conformationele analyse en stereochemie van organische structuren worden uitgediept
    4. De retrosynthestische analysebenadering wordt reeds vroeg geïntroduccerd en wordt regelmatig herhaald
    5. De synthese en reactiviteit van de belangrijkste functionele groepen (alkanen, alkenen, alkynen, allylsystemen, halogeenalkanen, alcoholen, thiolen, ethers, sulfiden, aldehyden, ketonen, zuren en zuurderivaten, aminen, aromaten)
    6. Nucleofiele koolstof in organometaalverbindingen (Grignard en organolithium) en enolaten (aldolreacties en Claissen-condensatiereacties)
    7. Elektrofiele koolstof (carbokationen en hun omleggingen)

    Studiemateriaal

    Studiekost: niet van toepassing (De informatie over studiekosten zoals hier opgenomen is indicatief en geeft enkel de prijs weer bij aankoop van nieuw materiaal. Er zijn mogelijk ook e- en tweedehandskopijen beschikbaar. Op LIMO kan je nagaan of het handboek beschikbaar is in de bibliotheek. Eventuele printkosten en optioneel studiemateriaal zijn niet in deze prijs vervat.)

    • Organic Chemistry, 12th edition, Francis Carey and Robert Giuliano and Neil Allison and Susan Bane, ISBN 9781266159244

    Toelichting werkvorm

    Oefensessie

    Tijdens de oefenzittingen wordt in kleine groepen gewerkt. Hierbij worden opgaven (Problems) uit het handboek opgelost. Het is de bedoeling om in groep tot een oplossing van de opgaven te komen zodat men via discussie een beter inzicht krijgt in de Organische Chemie. Basisoefeningen worden hierbij zoveel mogelijk vermeden. Alleen oefeningen met een hogere moeilijkheidsgraad komen aan bod.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Organische chemie (B-KUL-G2O35a)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk
    Vraagvormen : Open vragen, Gesloten vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    Praktische informatie over het examen Organische Chemie is te vinden op Toledo. Tevens is er een pdf file met de mogelijke theorievragen Organische Chemie beschikbaar op Toledo. Voorbeelden van examens Organische Chemie die in het verleden werden gegeven kunnen eveneens via Toledo worden bekeken/gedownload.

    ECTS Moleculaire architectuur (B-KUL-G0O37B)

    6 studiepunten Nederlands 55 Eerste semesterEerste semester

    Doelstellingen

    De cursus 'Moleculaire Architectuur' heeft tot doel het belang van symmetrie en de kennis van de (driedimensionale) structuur van de materie voor het begrijpen van haar eigenschappen aan te tonen, en
    draagt bij tot het verder ontwikkelen van het ruimtelijk denken op atomair en moleculair niveau.
    Twee belangrijke complementaire struktuurbepalingsmethoden, röntgendiffractie en nucleaire magnetische resonantie, worden hierbij toegelicht, evenals de fundamenten van infraroodspectroscopie
    en massaspectrometrie.
    De studenten kunnen de puntgroep van een voorwerp of molecule bepalen, de symmetrie van een tweedimensionaal patroon via een vlakgroep beschrijven en een eenvoudige ruimtegroep tekenen volgens de richtlijnen van de International Tables for Crystallography.
    De student kan de verschillende stappen van een kristalstructuurbepaling uitleggen (meer bepaald het opwekken van röntgenstraling, intensiteitmetingen, oplossen fasenprobleem, fouriersynthese, verfijning en interpretatie model) en kan het verband leggen met het gedeelte over symmetrie. Hij/zij kan de betekenis van de begrippen reciprook rooster, bol van Ewald, Pattersonfunctie en resolutie uitleggen en de intensiteit en richting van een reflectie berekenen.
    De student kan de werking van een IR-toestel en massaspectrometer uitleggen, hij/zij kent de karakteristieke vibraties van de belangrijkste functionele groepen in een IR-spectrum en de belangrijkste
    fragmentaties in massaspectroscopie.

    Begintermen

    Basiskennis natuurkunde (diffractie), wiskunde (Fourierreeksen, Fouriertransformatie, complexe getallen)
    en chemie (atoombouw, chemische binding, belangrijkste functionele groepen in organische chemie).

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0C66C: Moleculaire architectuur

    Onderwijsleeractiviteiten

    Moleculaire architectuur (B-KUL-G0O37a)

    5 studiepunten : College 39 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Deel 1. Symmetrie
    - Moleculaire symmetrie: puntgroepen (Schoenflies, Hermann-Mauguin)
    - Translatiesymmetrie: vlakgroepen en Bravaisroosters
    - Ruimtegroepen: notatie, International Tables for Crystallography, verband puntgroep-ruimtegroepfysische
    eigenschappen
    Deel 2. Structuurbepaling van een vaste stof - röntgendiffractie
    - Opwekken en eigenschappen van röntgenstraling
    - Wet van Bragg en de reciproke ruimte (Ewaldsfeer)
    - Intensiteit van afgebogen bundels: verstrooiing door elektron, atoom, eenheidscel, kristal
    - Fouriersynthese van de elektronendichtheid
    - Pattersonfunctie
    - Kristalstructuurbepaling: faseprobleem, zwaar-atoomtechniek, kleinste- kwadratenverfijning
    - Interpretatie van een kristalstructuurbepaling
    - Kristallografische databanken
    - Overzicht van belangrijke kristalstructuren: metalen (bolstapelingen), anorganische en organische
    verbindingen, biologische macromoleculen
    Deel 3. Structuurbepaling in oplossing - 1H en 13C Nucleaire Magnetische Resonantie
    - Principe en schema NMR spectrometer
    - Chemische shift, spin-spinkoppeling
    - Dynamische processen
    - Analyse van spectra van eenvoudige (bio)organische verbindingen
    - Relaxatie, Nuclear Overhauser Effect
    - Enkele speciale technieken en toepassingen (o.a. ontkoppeling, COSY, M RI)
    Deel 4. Infraroodspectroscopie
    - IR-spectrometer
    - Karakteristieke vibraties
    - Absorptiegebieden
    - Toepassingen
    Deel 5. Massaspectroscopie
    - Ionisatiemethodes
    - Detectiemethodes
    - Belangrijkste fragmentatiemethodes

    Studiemateriaal

    Cursustekst, Toledo

    Moleculaire architectuur: oefeningen (B-KUL-G0O39a)

    1 studiepunten : Practicum 16 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    - Puntgroepen
    - Vlakgroepen
    - Ruimtegroepen
    - Reciprook rooster - Bol van Ewald
    - Structuurfactoren
    - Pattersonfunctie
    - Demo kristalstructuurbepaling
    - 1H-NMR spectra van enkele eenvoudige organische verbindingen

    Studiemateriaal

    Cursustekst, Toledo

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Moleculaire architectuur (B-KUL-G2O37b)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Formularium, Rekenmachine

    ECTS Polymer Materials (B-KUL-G0O42B)

    6 ECTS English 48 First termFirst term Cannot be taken as part of an examination contract
    Goderis Bart (coordinator) |  Goderis Bart |  Koeckelberghs Guy

    Aims

    - Students can clarify the concept of chain of knowledge (i.e. the knowledge chain of polymer science) and the importance of polymeric materials;
    - Students can define and explain the individual links in the chain of knowledge and clarify the connections between the individual links;
    - Students have actual knowledge of theoretical and practical concepts, definitions and results (chemical, physicochemical, physical, mechanical, rheological, processing, product features) treated in the course and can relate them to the chain of knowledge;
    - Students can apply theoretical concepts and results in simple exercises and give, understand and interpret concrete solutions;
    - Students can relevant (scientific factual) information that is required to complete the exercises in the study, or if necessary, search for available information search and retrieval methods successfully;
    - For the theoretical concepts and results listed in the "Theoretical concepts and results" available at Toledo the student can give a correct derivation, identify the approximations used in the derivation and indicate the implications and limitations of the approximations;
    - For polymer products and materials treated in the course and for new examples of polymer materials provided by the lecturer students can 1) demonstrate and document the chain of knowledge, 2) argue how a change in one or more links in the chain of knowledge influence the product properties and 3) make quantitative predictions where possible (at the level of simple exercises mentioned above);
    - Students can describe and explain the following aspects: the place of polymers in the field of materials, the various polymer classifications used, the use of feed stocks and energy resources in synthesis, processing and design of polymers, the life cycle of polymers and polymeric materials, the advantages and disadvantages of polymers, the place in the (chemical) industry and in science and the importance of polymers for society.

    Previous knowledge

    The student has knowledge about:
    - The following mathematics and physics concepts: vectors, functions, integrals, differentials, complex numbers, series, energy, forces, viscosity, elasticity, electromagnetic radiation (visible light, X-ray, IR), index of refraction, birefringence, polarized light.
    - Basic knowledge on atoms, molecules, bonds, molecular interactions, basic organic reactions, thermodynamics state functions or can acquire these autonomously.

    The abovementioned concepts are provided in the bachelor of chemistry at KU Leuven in the courses (dealing with) Physics 1 and 2, Foundations of chemistry, Spectroscopic measuring principles, Molecular architecture, Metals and catalysis, Analytical basic techniques, (Bio)organic chemistry, Molecular architecture, Chemical thermodynamics, Chemistry of industrial processes.

    Identical courses

    X0D28B: Polymer Technology and Materials

    Onderwijsleeractiviteiten

    Polymer Materials: Lectures (B-KUL-G0O42a)

    4.5 ECTS : Lecture 36 First termFirst term

    Content

    Introduction

    - Positioning of course
    - Polymer Materials, Plastic Materials or Plastics?
    - Introducing Polymers…applications of polymer materials
    - Making and shaping plastics
    - Where do ‘they’ come from?
    - End of life & life cycle
    - The use of polymers because…
    - Polymer Catalogues
    - The Chain of Knowledge
    - The Future of plastics

    Case I. A Polymer Story of Carbon and Hydrogen.
    - Products and applications, property versus performance
    - Introduction to processing techniques for polymers
    - The extruder
    - Melt flow instabilities
    - Polymer melt: viscosity, elasticity and viscoelasticity
    - Deformation of liquid & solid polymers
    - Polymer melt viscosity vs. polymer melt elasticity and viscoelasticity
    - Essential polymer properties in a nut shell
    - Single polymer chain behavior
    - More polymer chains: solutions, mixtures and pure melts
    - Pure polymer melt
    - (Semi) crystalline polymers
    - The glass-transition & glassy state
    - Mobility in polymers
    - Some consequences of basic properties  for products & materials
    - Properties of solid polymers glassy versus crystalline
    - (HD-,LD-,LLD-, VLD-) PE’s
    - Properties of liquids polymers melt versus rubber like behavior
    - Consequences for processing
    - Polyolefine (polymer) synthesis:
    - Historical perspectives
    - The first commercial polyethylene grade: low density polyethylene (LDPE)
    - Free radical polymerization (FRP) of LDPE and other vinyl monomers
    - Principles of  chain growth polymerization
    - Molar mass and molar mass distributions
    - Stereoregularity and tacticity
    - Tacticity and crystallinity
    - Ziegler-Natta polymerization & HDPE
    - Limitations of Ziegler-natta polymerization
    - Achieving more control …..metallocene polymerization
    - State of the art: stereo-tactic block copolymers
    - Classification of polyethylenes
    - Polymerization and consequences for molecular structure of ethylene based polyolefins

    Case II. The story of rubber: stretchy and bouncing carbon and hydrogen
    - The history of rubber: an ancient story
    - Natural rubber: All cis-polyisoprene
    - The macromolecular hypothesis
    - Vulcanization: Charles Goodyear ‘s recipe.
    - Synthetic polyisoprene rubber
    - Anionic polymerization  of isoprene rubber
    - Ziegler-natta catalysts
    - More synthetic rubbers
    - Butyl rubber by cationic polymerization
    - Overview of chain growth polymerizations.
    - The drawbacks of cross linking & whole new rubbers: thermoplastic elastomer
    - Ionomers and block copolymers.
    - Living (anionic) polymerisation: a route to block copolymers the SBS case
    - What makes rubber a rubber and stretchy?
    - The secrets of rubber revealed: thermodynamic and molecular aspects of elasticity
    - The rich world block copolymers: Micro phase separated structures

    Case III. Proving the Macromolecular Hypothesis, Inventing Nylon and Kevlar
    - Polyesters and Polyamides
    - Carothers, polyamides and the proof of the Staudinger hypothesis
    - Polyamides …. Fibre 66
    - Producing Nylon… Scaling Up
    - The making of Nylon and Spinning Fibers
    - The Impact of Nylon
    - Stephanie Kwolek and Aramids
    - Naming Nylon and so….
    - Step-growth polymerization
    - Some theoretical results on step-growth polymerization
    - Controlling molar mass
    - Molar mass distributions
    - How fast can reactions go?
    - Kinetics of step-growth polymerization reactions
    - Un-catalysed Reaction Kinetics
    - Catalysed Reaction Kinetics
    - Polyamide Products

    Case IV. Advanced applications and products
    - In this part of the course guest lecturers present present-day applications of polymer materials, and how they have come to existence (using the chain of knowledge)

    Course material

    Lecture Notes, Powerpoint presentations and other lecture materials, available on Toledo.

    Language of instruction: more information

    This course is a 3rd stage course that fits into the English learning line of the Bachelor program. Students are immersed in English. The lecture notes and lectures are  in English.

    Format: more information

    • Lectures with demonstrations on the chain of knowledge,
    • Lecture(s) by guest(s).

    Polymer Materials: Exercises (B-KUL-G0S21a)

    1.5 ECTS : Practical 12 First termFirst term

    Content

    • Conformational properties,
    • Molar mass distributions and molar mass averages,
    • Characteristic times in polymers,
    • Rubberelasticity
    • Linear viscoelasticity
    • Step growth polymerizations,
    • Chain growth polymerizations

    Course material

    Notes available on Toledo.

    Language of instruction: more information

    This course is a 3rd stage course that fits into the English learning line of the Bachelor program. Students are immersed in English. The exercises are given in English, also by the use of English speaking assistants.

    Format: more information

    Theoretical concepts discussed in the lectures are applied in the excercises.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluation: Polymer Materials (B-KUL-G2O42b)

    Type : Exam during the examination period
    Description of evaluation : Written, Oral
    Type of questions : Open questions
    Learning material : Calculator

    Explanation

    Details on the exam are available on Toledo.

    ECTS Analytische biochemie (B-KUL-G0O51C)

    6 studiepunten Nederlands 50 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De studenten
    • hebben kennis en begrijpen de principes van de verschillende scheidings-, detectie- en analysetechnieken van biologische (macro)moleculen in oplossing; ze kunnen de sterktes en zwaktes ervan benoemen, en hun toepasbaarheid toelichten;
    • kunnen de werking van deze technieken alsook de ervoor gebruikte toestellen uitleggen vertrekkende van fundamentele fysische en chemische wetten;
    • kunnen deze verschillende technieken toepassen en een scheidingsstrategie met kwaliteitscontrole opstellen;
    • beheersen de principes van opschaling.

    Begintermen

    Basiskennis wiskunde, statistiek en fysica (niveau eerste bachelorfase); kennis van globale structuur en eigenschappen van de verschillende klassen van biomoleculen zoals behandeld in G0N04C Celbiologie en Biochemie.

    Identieke opleidingsonderdelen

    G0O51D: Analytische biochemie
    X0B37B: Analytical Biochemistry

    Onderwijsleeractiviteiten

    Analytische biochemie: hoorcollege 1 (B-KUL-G0O51a)

    3 studiepunten : College 26 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    - Inleiding tot de vraagstelling in Analytische Biochemie

    - Waterzuivering en buffers, principes van analyses en opzuiveringsmethoden

    - Spectrofotometrische en colorimetrische detectie van biomoleculen

    - Chromatografische scheidingstechnieken en scheidingsstrategieën

    - Elektroforese: scheiding van biomoleculen door gel- en capillaire elektroforese, 2D-gelelektroforese

    - Beginselen van massaspectrometrie

    - Radiochemie

    - Diagnostische methoden

    - Meten van biomoleculaire interacties

    De verschillende methoden worden geïllustreerd via toepassingen.

    Studiemateriaal

    Aanvullende informatie wordt via Toledo aangeboden. Deze verduidelijkende documentatie behoort niet tot de leerstof tenzij uitdrukkelijk anders vermeld. Er dient geen handboek aangekocht te worden.

    Toelichting werkvorm

    Hoorcollege

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    G0O51D : Analytische biochemie

    Analytische biochemie: oefeningen (B-KUL-G0V91a)

    1.5 studiepunten : Practicum 12 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    De technieken behandeld in het hoorcollege (G0O51A) worden verder toegelicht aan de hand van oefeningen.

    Studiemateriaal

    Lesmateriaal ter beschikking gesteld op Toledo

    Toelichting werkvorm

    Oefenzittingen: studenten voeren onder begeleiding theoretisch georiënteerde opdrachten uit en bespreken de resultaten van deze opdrachten. De opdrachten zijn erop gericht het probleemoplossend vermogen van studenten te verhogen. De volledige groep kan opgedeeld worden in reeksen.

    Analytische biochemie: bedrijfsbezoek (B-KUL-G0Y18a)

    0.5 studiepunten : Excursie 4 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Er wordt online overleg ingepland met een bedrijf uit de (bio-)chemische of farmaceutische sector waar analytisch-biochemische technieken, besproken in het hoorcollege (G0O51A), worden toegepast.

    Studiemateriaal

    De studenten verzamelen en verwerken zelf de nodige informatie.

    Toelichting werkvorm

    De studenten, onderverdeeld in projectgroepen, kiezen uit een lijst van bedrijven elk een bedrijf en organiseren zelf een online overleg met dit bedrijf. Via de projectgroep worden vragen voorbereid die aansluiten bij een techniek gebruikt in dit bedrijf waarover men toelichting krijgt tijdens dit online overleg en waar vragen kunnen gesteld worden. Na dit overleg wordt de verzamelde informatie verwerkt in een verslag (projectsgroepswerk).

    Analytische biochemie: hoorcollege 2 (B-KUL-G0Z37a)

    1 studiepunten : College 8 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    - Kwaliteitscontrole
    - Elektrochemische methoden
    - Sedimentatietechnieken

    De verschillende methoden worden geïllustreerd via toepassingen.

    Studiemateriaal

    Aanvullende informatie wordt via Toledo aangeboden. Deze verduidelijkende documentatie behoort niet tot de leerstof tenzij uitdrukkelijk anders vermeld. Er dient geen handboek aangekocht te worden.

    Toelichting werkvorm

    Hoorcollege

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Analytische biochemie (B-KUL-G2O51c)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Mondeling
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Rekenmachine

    Toelichting

    Het eindexamen bestaat uit een open theorievraag. Indien de student ook het oefeningengedeelte gevolgd heeft, bevat het examen ook een oefeningenvraag die meetelt voor 25% van het examenresultaat. Een student die voor de theorie onvoldoende scoort (minder dan 50%) kan maximaal een score van 9 krijgen.
    Voor studenten die deelnemen aan het online bedrijfsbezoek wordt dit geëvalueerd tijdens het semester en telt dit voor 10% van het puntentotaal. Bij ongewettigde afwezigheid wordt de toegang tot het examen geweigerd. Er is geen herkansing voor het bedrijfsbezoek.

    Toelichting bij herkansen

    Het examen is opgebouwd zoals bij de eerste examenkans. Voor het bedrijfsbezoek wordt geen herexamen aangeboden: de scores voor het bedrijsbezoek (10%) uit de eerste examenkans worden overgenomen in de berekening van de eindscore van de tweede examenkans.

    ECTS Moleculaire biologie (B-KUL-G0O53C)

    6 studiepunten Nederlands 26 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De student kan:

    • de structuur en werking van prokaryoot RNA-polymerase toelichten, in het bijzonder zijn interactie met het promoter-DNA, en de moleculaire details van transcriptie-initiatie, -elongatie en -terminatie
    • aan de hand van concrete voorbeelden de fijnregeling van transcriptie beschrijven van individuele genen en operons bij prokaryoten
    • uitleggen welke en hoe globale regulatiemechanismen leiden tot belangrijke verschuivingen in genexpressiepatronen bij prokaryoten
    • onderscheid maken tussen structuur en functie van de verschillende eukaryote RNA-polymerasen
    • de rol toelichten van enhancers, silencers en transcriptiefactoren in de recrutering van eukaroyte RNA-polymerase
    • een overzicht geven van de samenstelling en dynamiek van het eukaryote RNApolymerasecomplex en van de algemene transcriptiefactoren
    • een inzichtelijk omschrijving geven van werking, specificiteit en controle van transcriptieactivatoren in het proces van genactivatie
    • de voornaamste verschillen aangeven in het transcriptieproces bij pro- en eukaryoten
    • de moleculaire structuur van chromatine en zijn effecten op genexpressie toelichten
    • de rijping van precursor-mRNA tot matuur mRNA belichten in moleculair detail: splicing, capping en polyadenylering, en uitleggen hoe deze verschillende modificaties onderling gecoördineerd worden in de nucleus
    • de verschillende stappen (initiatie, elongatie, terminatie) in het proces van translatie van mRNA naar eiwit belichten in moleculair-structureel detail, en de overeenkomsten/verschillen aangeven bij proen eukaryoten
    • de algemene mechanismen van DNA-replicatie omschrijven alsook de herstelmechanismen bij DNA-schade
    • de verschillende stappen (initiatie, elongatie, terminatie) in het proces van DNA-replicatie belichten in moleculair-structureel detail
    • de principes van homologe recombinatie uitleggen aan de hand van de RecBCD-weg bij bacteriën; het proces van homologe recombinatie tijdens de meiose bij eukaryoten verduidelijken
    • het proces van genconversie moleculair uitleggen
    • uitleggen wat transposons zijn en hun werking gedetailleerd toelichten, zowel bij pro- als bij eukaryoten
    • de basistechnieken aangeven die gebruikt werden bij de opheldering van moleculair-biologische processen, en hun werkingsprincipes toelichten
    • gepaste basistechnieken en strategieën aanduiden voor het oplossen van courant voorkomende vragen in het moleculair-biologisch onderzoek

    Begintermen

    Basiskennis celbiologie en organische chemie

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0B26B: Moleculaire biologie

    Onderwijsleeractiviteiten

    Moleculaire biologie (B-KUL-G0O53a)

    6 studiepunten : College 26 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    De inhoud van de cursus is gebaseerd op het handboek "Molecular Biology" van de auteur R. Weaver,
    en behandelt volgende onderdelen (hoofdstukken in het handboek):
    Inleiding (2)
    Moleculair−biologische methoden
         • Moleculaire kloning (4)
         • Tools voor studie van genen en genactiviteit (5)
    Transcriptie bij prokaryoten
         • Mechanisme van transcriptie (6)
         • Transcriptieregulatie (7)
         • Grote transcriptieverschuivingen (8)
    Transcriptie bij eukaryoten
         • RNA-polymerasen en promoters (10)
         • Algemene transcriptiefactoren (11)
         • Transcriptieactivatoren (12)
         • Chromatine en transcriptie (13)
    Post-transcriptionele verwerking
         • mRNA-splicing (15)
         • mRNA-capping en -polyadenylering (16)
    Translatie
         • Translatie-initiatie (17)
         • Translatie-elongatie en -terminatie (18)
    DNA-replicatie, recombinatie en transpositie
         • Basismechanisme en enzymologie (20)
         • Gedetailleerd mechanisme (21)
         • Homologe recombinatie (22)
         • Transpositie (Hoofdstuk 23)

    Studiemateriaal

    Handboek: Robert F. Weaver "Molecular Biology" 5de editie, McGraw-Hill, New York, ©2012
    Handouts presentaties
    Multimedia

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Moleculaire biologie (B-KUL-G2O53c)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    ECTS Chemie van natuurproducten (B-KUL-G0O55A)

    6 studiepunten Nederlands 70 Niet ingerichtNiet ingericht Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De student

    • beheerst de basismechanismen van de organische chemie (zoals die gezien werden in de cursus "Bio-organische chemie" (G0N08A)) die nodig zijn om de cursus "Chemie van natuurproducten" te begrijpen.
    • kent de algemene concepten van de organische chemie en kunnen die toepassen in biochemische reactiewegen en de biosynthese van natuurproducten. Deze concepten bieden een basisinzicht in het fundamenteel organisch-chemisch verloop van biochemische reacties met nadruk op de reactiemechanismen.
    • kan eenvoudige (enzymatische) synthesen en isolatie van verschillende (natuur)producten uitvoeren.

    Begintermen

    De student kent de basisreacties van de organische chemie. Hij kan deze reacties aanvullen met de reactieproducten en het reactiemechanisme stapsgewijs opschrijven en uitleggen. Hij kent de eigenschappen en de reactiviteit van de verschillende organische functionele groepen. De student heeft reeds de basisvaardigheid om een aantal eenvoudige organische synthesen in het laboratorium uit te voeren.

    Onderwijsleeractiviteiten

    Chemie van natuurproducten (B-KUL-G0O55a)

    3.4 studiepunten : College 26 Niet ingerichtNiet ingericht

    Inhoud

    - Chemie van het primair metabolisme

    • Biosynthese van nucleïnezuren
    • Eiwitten en proteïnen; glutathione
    • Suikers, glycosides, vitamine C, inositolen, glycoproteïnen
    • Lipiden, fosfatidylcholine

    - Belangrijke bioreagentia en biomechanismen

    • NADH, NADPH
    • Pyridoxaalfosfaat
    • Gebruik van enamines en coënzyme A
    • Thiaminepyrofosfaat, Stetter reagens
    • De “Shikimic acid pathway”
    • Eliminatie van ammoniak: synthese van alkenen
    • Porfyrines
    • FAD, FADH2
    • NIH-shift

    - Biologische reactiewegen

    • chemie van NADH 
    • reductieve aminering in de natuur: rol van pyridoxal in de biochemie van aminozuren 
    • natuurlijke enolen: lysine enamines en coënzyme A 
    • natuurlijke acylanion-equivalenten: thiamine pyrofosfaat 
    • hemoglobine: zuurstoftransfer via ijzer(II)complex 
    • redoxreacties met FAD 

    - Secundair metabolisme

    • alkaloïden: biosynthese uit aminozuren 
    • vetzuren: biosynthese uit acetyl-CoA en omzetting tot prostaglandines 
    • aromatische polyketiden 
    • terpenen, steroïden

    Studiemateriaal

    Handboek

    Chemie van natuurproducten: practica 1 (B-KUL-G0O56a)

    2.4 studiepunten : Practicum 40 Niet ingerichtNiet ingericht

    Inhoud

    - Isolatie van R-(+)-limoneen uit appelsienschil door stoomdestillatie
    - Extractie van cafeïne uit thee
    - Synthese van het kopercomplex van tetrafenylporfyrine
    - Synthese van 2-propionylcyclohexanon: toepassing op enamines
    - Enzymatische resolutie van 1-fenylethanol

    Studiemateriaal

    Practicumnota's

    Chemie van natuurproducten: practica 2 (B-KUL-G0W22a)

    0.2 studiepunten : Practicum 4 Niet ingerichtNiet ingericht

    Inhoud

    Oefeningen op basismechanismen gezien in de cursus "Bio-organische chemie" die essentieel zijn om de cursus "Chemie van natuurproducten" te begrijpen: e.g. vorming van acetalen, enamines, mechanisme van de aldolcondensatie, Claisencondensatie, …

    Studiemateriaal

    Schriftelijke oefeningen opgegeven door de docent

    Toelichting werkvorm

    Onder begeleiding van de docent worden een reeks oefeningen opgelost

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Chemie van natuurproducten (B-KUL-G2O55a)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Medewerking tijdens contactmomenten
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    De permanente evaluatie (oefeningen/practica) telt voor 20% van de eindscore, het eindexamen voor 80%. Practica (on-campus en online opdrachten hieraan verbonden) zijn verplicht. Indien ongewettigd afwezig of bij het niet inleveren van opdrachten, zal de toegang tot het examen geweigerd worden. Om te slagen is een totale eindscore (practicum + eindexamen) vereist van ten minste 10 op 20. Hij/zij heeft hiermee aangetoond inzicht verworven te hebben in de toepassing van de algemene concepten van de organische chemie in de biochemie, en de biosynthese van natuurproducten. Hij/zij kan de mechanismen zelf beredeneren en uitwerken. Dit houdt niet noodzakelijk in dat het gehele vraagstuk foutloos opgelost werd, alhoewel hogere scores uiteraard behaald worden door studenten die de vraag volledig hebben kunnen beantwoorden.

    De oefeningen/practica worden geëvalueerd op basis van:

    • Permanente evaluatie
    • Laboschrift
    • Resultaten experimenten
    • Prelab testen die voorbereiding en inzicht in de materie aftoetsen

    Het eindexamen is schriftelijk. De examenvragen staan elk op een op voorhand vastgesteld aantal punten. Afhankelijk van het schriftelijk antwoord op de vraag, wordt per vraag een score vastgesteld. Niet zozeer het bekomen van de juiste oplossing is van belang, maar wel het feit dat de student aangetoond heeft inzicht verworven te hebben in de toepassing van de algemene concepten van de organische chemie in de biochemie en de biosynthese van natuurproducten.

    Toelichting bij herkansen

    Er wordt voor het OLA practicum GEEN tweede examenkans aangeboden. Het deelcijfer voor dit onderdeel (uit permanente evaluatie) wordt overgenomen van de eerste examenkans.

    ECTS Chemie van natuurproducten (B-KUL-G0O55B)

    3 studiepunten Nederlands 26 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De student

    • beheerst de basismechanismen van de organische chemie (zoals die gezien werden in de cursus "Bio-organische chemie" (G0N08A)) die nodig zijn om de cursus "Chemie van natuurproducten" te begrijpen.
    • kent de algemene concepten van de organische chemie en kunnen die toepassen in biochemische reactiewegen en de biosynthese van natuurproducten. Deze concepten bieden een basisinzicht in het fundamenteel organisch-chemisch verloop van biochemische reacties met nadruk op de reactiemechanismen.
    • kan eenvoudige (enzymatische) synthesen en isolatie van verschillende (natuur)producten uitvoeren.

    Begintermen

    De student kent de basisreacties van de organische chemie. Hij kan deze reacties aanvullen met de reactieproducten en het reactiemechanisme stapsgewijs opschrijven en uitleggen. Hij kent de eigenschappen en de reactiviteit van de verschillende organische functionele groepen. De student heeft reeds de basisvaardigheid om een aantal eenvoudige organische synthesen in het laboratorium uit te voeren.

    Onderwijsleeractiviteiten

    Chemie van natuurproducten (B-KUL-G00F8a)

    3 studiepunten : College 26 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    - Chemie van het primair metabolisme

    • Biosynthese van nucleïnezuren
    • Eiwitten en proteïnen; glutathione
    • Suikers, glycosides, vitamine C, inositolen, glycoproteïnen
    • Lipiden, fosfatidylcholine

    - Belangrijke bioreagentia en biomechanismen

    • NADH, NADPH
    • Pyridoxaalfosfaat
    • Gebruik van enamines en coënzyme A
    • Thiaminepyrofosfaat, Stetter reagens
    • De “Shikimic acid pathway”
    • Eliminatie van ammoniak: synthese van alkenen
    • Porfyrines
    • FAD, FADH2
    • NIH-shift

    - Biologische reactiewegen

    • chemie van NADH 
    • reductieve aminering in de natuur: rol van pyridoxal in de biochemie van aminozuren 
    • natuurlijke enolen: lysine enamines en coënzyme A 
    • natuurlijke acylanion-equivalenten: thiamine pyrofosfaat 
    • hemoglobine: zuurstoftransfer via ijzer(II)complex 
    • redoxreacties met FAD 

    - Secundair metabolisme

    • alkaloïden: biosynthese uit aminozuren 
    • vetzuren: biosynthese uit acetyl-CoA en omzetting tot prostaglandines 
    • aromatische polyketiden 
    • terpenen, steroïden

    Studiemateriaal

    Handboek

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Chemie van natuurproducten (B-KUL-G2O55b)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Medewerking tijdens contactmomenten
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    De permanente evaluatie (oefeningen/practica) telt voor 20% van de eindscore, het eindexamen voor 80%. Practica (on-campus en online opdrachten hieraan verbonden) zijn verplicht. Indien ongewettigd afwezig of bij het niet inleveren van opdrachten, zal de toegang tot het examen geweigerd worden. Om te slagen is een totale eindscore (practicum + eindexamen) vereist van ten minste 10 op 20. Hij/zij heeft hiermee aangetoond inzicht verworven te hebben in de toepassing van de algemene concepten van de organische chemie in de biochemie, en de biosynthese van natuurproducten. Hij/zij kan de mechanismen zelf beredeneren en uitwerken. Dit houdt niet noodzakelijk in dat het gehele vraagstuk foutloos opgelost werd, alhoewel hogere scores uiteraard behaald worden door studenten die de vraag volledig hebben kunnen beantwoorden.

    De oefeningen/practica worden geëvalueerd op basis van:

    • Permanente evaluatie
    • Laboschrift
    • Resultaten experimenten
    • Prelab testen die voorbereiding en inzicht in de materie aftoetsen

    Het eindexamen is schriftelijk. De examenvragen staan elk op een op voorhand vastgesteld aantal punten. Afhankelijk van het schriftelijk antwoord op de vraag, wordt per vraag een score vastgesteld. Niet zozeer het bekomen van de juiste oplossing is van belang, maar wel het feit dat de student aangetoond heeft inzicht verworven te hebben in de toepassing van de algemene concepten van de organische chemie in de biochemie en de biosynthese van natuurproducten.

    Toelichting bij herkansen

    Er wordt voor het OLA practicum GEEN tweede examenkans aangeboden. Het deelcijfer voor dit onderdeel (uit permanente evaluatie) wordt overgenomen van de eerste examenkans.

    ECTS Geïntegreerd practicum in de biochemie en biotechnologie I (B-KUL-G0O57C)

    6 studiepunten Nederlands 104 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract
    Dedecker Peter (coördinator) |  De Groote Valerie |  Dedecker Peter |  Ramaekers Riet |  Voet Arnout |  N.  |  Minder Meer

    Doelstellingen

    Dit practicum ondersteunt theoretische elementen die aangeboden werden in G0O53A Moleculaire biologie, G0O51B Analytische biochemie en G0N20A Dynamische biochemie. De studenten kunnen:
    - experimentele procedures volgen (i.e. handvaardigheid en praktische ervaring opdoen) en hierbij gelijktijdig alle veiligheidsregels in acht nemen.
    - de verschillende methoden en (basis)technieken in de analytische biochemie, de moleculaire biologie en de enzymologie toepassen en hun werkingsmechanismen alsook die van de de gebruikte toestellen verduidelijken.
    - het verband leggen tussen structuur en functie van biomoleculen, o.a. door visualisatie van de bestudeerde biomoleculen op de computer.
    - nauwkeurig data verzamelen, verwerken, weergeven en interpreteren; hierbij gebruik maken van geschikte software (bio-informatische analyse, spreadsheets, beeldverwerking en statistiek)
    - werken met interne en externe standaarden.
    - verbanden leggen tussen verschillende onderdelen van het practicum om het interdisciplinaire karakter van de analytische biochemie, de moleculaire biologie en de enzymologie te begrijpen.
    - experimentele procedures, resultaten en besluiten toelichten in geschreven vorm (door het schrijven van een verslag over een bepaald deel van het practicum) en mondelinge vorm (door het geven van een presentatie over een bepaald onderdeel van het practicum).
    - experimentele procedures, resultaten en besluiten van collega-studenten begrijpen en kritisch evalueren (peer assessment), evenals die uit de wetenschappelijke literatuur.
    - werken in een laboratoriumomgeving, zowel individueel als in teamverband.
    - practicumsessies voorbereiden door een eigen werkplan op te stellen en uit te voeren binnen de gestelde tijd.

    Begintermen

    Elementaire laboratoriumvaardigheden en kennis van laboratoriumveiligheid zoals aangeleerd in de practica van de eerste fase.
    Basiskennis van de klassen van (bio)moleculen en hun chemische en/of biologische eigenschappen zoals onderwezen in G0N01C Grondslagen van de chemie, G0N08A Bio-organische chemie, G0O51B Analytische biochemie’, G0N20A Dynamische biochemie en G0O53A Moleculaire biologie.

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    ( GELIJKTIJDIG( G0O53C ) OF GELIJKTIJDIG( X0B26B ) ) EN
    ( GELIJKTIJDIG( G0N20E ) OF GELIJKTIJDIG( X0B44D ) ) EN
    ( GELIJKTIJDIG( G0O51C ) OF GELIJKTIJDIG( X0B37C ) OF GELIJKTIJDIG( G0O27A ) )


    G0O53CG0O53C : Moleculaire biologie
    X0B26BX0B26B : Moleculaire biologie
    G0N20EG0N20E : Dynamische biochemie
    X0B44DX0B44D : Dynamische biochemie
    G0O51CG0O51C : Analytische biochemie
    X0B37CX0B37C : Analytical Biochemistry
    G0O27AG0O27A : Analytische basistechnieken


    Identieke opleidingsonderdelen

    X0B43B: Geïntegreerd practicum
    X0B43D: Geïntegreerd practicum

    Onderwijsleeractiviteiten

    Geïntegreerd practicum in de biochemie en biotechnologie I (B-KUL-G0O57a)

    6 studiepunten : Practicum 104 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Algemeen

    - Bereiding en gebruik van buffers
    - Het ijken van micropipetten
    - Exploratie en visualisatie van biomoleculen via software

    Analytische biochemie

    - Expressie en opzuivering van GFP

    • Regulatie van genexpressie in bacteriën
    • Cel lysis
    • Zoutfractionatie om eiwitten af te zonderen
    • Centrifugatie
    • Ionenwisselaarschromatografie

    - Analyse van opgezuiverd GFP

    • SDS-PAGE
    • Western blotting en immunokleuring
    • Analytische gelfiltratiechromatografie
    • Absorbantie en fluorescentiespectroscopie

    - Koolhydraten:

    • Reducerende eigenschappen van koolhydraten
    • Inversie van sucrose

    - Lipiden:

    • Bepalen van de kritische micelconcentratie

    - Eiwitopzuivering: het opstellen van een scheidingsstrategie (theoretische oefening)
    - Aminozuuranalyse (theoretische oefening)
    - Lipiden (theoretische oefening)

    Dynamische biochemie: enzymologie

    - Lactaatdehydrogenase: Km en vmax bepalen in aan- en afwezigheid van een inhibitor
    - Trypsine: specifieke activiteit bepalen bij verschillende pH
    - Prostaglandine-endoperoxidesynthase (theoretische oefening)
    - Carbonzuuranhydrase (theoretische oefening)

    Moleculaire biologie

    - Genotypering van wild-type en obese muizen

    • Polymerase-kettingreactie om DNA-fragmenten te vermenigvuldigen
    • DNA-analyse via restrictie-enzymen en agarose-gelelektroforese
    • DNA-analyse via sequentiebepaling

    - GFP, van groen naar … 

    • Plaatsgerichte mutagenese versus willekeurige mutagenese
    • Transformatie van bacteriën
    • Regulatie van genexpressie in bacteriën
    • Isolatie van plasmide DNA
    • DNA analyse via restrictie-enzymen en agarose-gelelektroforese

    - Isolatie en spectroscopische analyse van genomisch DNA uit bacteriën
    - DNA-sequenties (theoretische oefening)
    - Restrictie-enzymen (theoretische oefening)

    Studiemateriaal

    Handleiding en extra informatie, beschikbaar via Toledo

    Toelichting werkvorm

    - Deelnemen onder toezicht aan laboratoriumsessies ondersteund door bio-informatische werkzaamheden in de PC-klas
    - Theoretische oefeningen oplossen
    - Uitvoeren van opdrachten

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Geïntegreerd practicum in de biochemie en biotechnologie I (B-KUL-G2O57c)

    Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Presentatie, Medewerking tijdens contactmomenten, Vaardigheidstoets
    Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen, Gesloten vragen
    Leermateriaal : Formularium, Rekenmachine

    Toelichting

    De evaluatie gebeurt tijdens het semester en is gebaseerd op

    • Permanente evaluatie (50%)
      • Attitude: de voorbereiding van de proeven via gerichte individuele bevraging bij aanvang van het practicum (prelab test), de inzet tijdens de uitvoering van de proeven, het volgen van Goede-Laboratorium-Praktijken (GLP) en naleven van de veiligheidsvoorschriften tijdens de uitvoering van de proeven
      • Het bijhouden van een laboschrift
    • Opdrachten met beoordeling
      • Presentatie over een bepaald onderdeel van het practicum (20%)
    • Schriftelijke vaardigheidstoets (gesloten boek) in de laatste week van het semester over het geheel van de uitgevoerde experimenten (30%). Er mag gebruik gemaakt worden van een formularium en een niet-grafisch rekentoestel. Alle andere elektronische hulpmiddelen zijn niet toegestaan.

    De deelname aan de practica en de vervulling van de bijhorende taken zijn verplicht. Afwezigheid is enkel gewettigd in geval van medische redenen of bijzonder aantoonbare familiale omstandigheden (te staven via een officieel document). Bij afwezigheid dient de docent of assistent zo snel mogelijk geïnformeerd te worden, bij voorkeur voor de aanvang van het practicum. Het gemiste practicum moet ingehaald worden volgens afspraak met de practicumcoördinator. Een student die ongewettigd afwezig is op één van de practica, krijgt automatisch een onvoldoende. Het opleidingsonderdeel wordt dan beschouwd als niet afgelegd (NA). Systematisch verwaarlozen van één of meerdere geëvalueerde onderdelen leidt tot strafpunten.

    Dit opleidingsonderdeel kan niet getolereerd worden.

     

    Toelichting bij herkansen

     

    ECTS Spectroscopy of Biomolecules (B-KUL-G0O58C)

    6 ECTS English 39 Second termSecond term Cannot be taken as part of an examination contract
    Vogt Tatjana (coordinator) |  Hofkens Johan |  Vogt Tatjana

    Aims

    The student is capable of
    - analysing, interpreting and applying complex 1-D, multidimensional NMR and IR spectra, for elucidation of biomolecular structures;
    - explaining the principles of the discussed techniques and, by means of examples, how these techniques are used for the structure elucidation;
    - mastering the proper terminology used in these techniques;
    - showing insight in the electronic transitions in hydrogen and in molecules with conjugated double bonds;
    - estimating wave length and maximal absorption based on the structure;
    - describing phenomena of steady state and time-resolved fluorescence and fluorescence anisotropy, and apply these for the study of molecular interactions;
    - explaining the principles of circular dichroism, and applying this technique for the analysis of secondary structures in biomolecules;
    - analysing Raman scattering and applying the technique for the study of molecules in solution.

    Previous knowledge

    Basic knowledge of physics (electromagnetic radiation), mathematics (Fourier transformation, complex numbers) and chemistry (atom structure, chemical bond, functional groups).

    Identical courses

    X0D21A: Spectroscopische technieken

    Onderwijsleeractiviteiten

    Spectroscopy of Biomolecules (B-KUL-G0O58a)

    3 ECTS : Lecture 26 Second termSecond term

    Content

    (1) Introduction: electromagnetic spectrum, spectroscopy types
    (2) 1H-NMR spectroscopy
    - principle
    - NMR spectrometer
    - chemical shift, spin-spin coupling
    - dynamic processes
    - analysis of simple (bio)organic compounds
    - analytical tools
    - some special techniques, e.g. COSY
    (3) 13C-NMR spectroscopy Fourier transform method
    - decoupling
    - relaxation
    - Nuclear Overhauser Effect
    - medical applications: MRI
    (4) Infrared spectroscopy
    - spectrometer
    - characteristic vibrations
    - absorption areas
    - Lambert-Beer law of absorption
    - some biochemical applications
    (5) UV and visible-light spectroscopy
    - quantitative analysis of the hydrogen spectrum, conjugated systems - dyes
    (6) Fluorescence
    - steady-state analysis of fluorescence
    - time-resolved fluorescence and reactions in the excited state
    - Forster resonance energy transfer
    (7) Fluorescence anisotropy and application in molecular interaction studies
    (8) Circular dichroism
    - principles of CD spectrometry
    - instrumentation

    Course material

    Course notes

    Spectroscopy of Biomolecules: Exercises (B-KUL-G0P52a)

    3 ECTS : Practical 13 Second termSecond term

    Content

    The content of the exercises correspond to that of the course lectures.

    Course material

    Exercises are available on Toledo.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluation: Spectroscopy of Biomolecules (B-KUL-G2O58c)

    Type : Exam during the examination period
    Description of evaluation : Written
    Type of questions : Open questions, Closed questions
    Learning material : List of formulas, Calculator

    Explanation

    Theory and exercises are examined simultaneously in the regular exam period. The exam parts of the two lecturers have equal weight. A student who achieves 7/20 or less on one of the two parts can get a maximum score of 9/20. Thorough written preparation is expected. 

    ECTS Bioinformatica en structurele biologie (B-KUL-G0O59B)

    6 studiepunten Nederlands 36 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De student is vertrouwd met volgende termen en kan zelfstandig basis bioinformatische oefeningen maken en resultaten interpreteren inzake volgende elementen:

    • Genoom-, sequentie- en structuurdatabanken
    • Experimentele structurele biologie methodes: proteïne-kristallografie, single particle cryoEM en bio-NMR
    • Structurele bio-informatica
    • Visualisatie en analyse van de structuur en interacties van biomacromoleculen
    • Analyse van nucleotide- en aminozuursequenties
    • Sequentiealignering
    • Paargewijze en multipele sequentie-alignering
    • Locale en globale aligneringsmethoden
    • BLAST
    • Fylogenetische bomen op basis van sequentie
    • Krachtvelden en inleiding tot biomoleculaire modellering

    Begintermen

    Basis biochemie van aminozuren, nucleotiden, proteines, basisconcepten van statistiek, basisconcepten van evolutie en moleculaire biologie

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0D23A: Bioinformatics
    G00C0A: Bioinformatica

    Onderwijsleeractiviteiten

    Bioinformatica (B-KUL-G0O59a)

    4 studiepunten : College 24 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    De student is vertrouwd met volgende termen en kan zelfstandig basis bioinformatische oefeningen maken en resultaten interpreteren inzake volgende elementen.

    Genoom-, sequentie- en structuurdatabanken

    Analyse van nucleotide- en aminozuursequenties

    Sequentie-alignering

    Paargewijze en multipele sequentie-alignering

    Locale en globale aligneringsmethoden

    BLAST

    Fylogenetische bomen op basis van sequentie

    Studiemateriaal

    Zelfgemaakte slides en oefeningenbundel, inhoud gebaseerd op hoofdstukken uit commercieel handboek

    Toelichting werkvorm

    Blended onderwijs - Oefensessie

    hoorcolleges en computeroefenzittingen

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    G00C0A : Bioinformatica

    Structurele biologie (B-KUL-G0O60a)

    2 studiepunten : College 12 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    De student is vertrouwd met volgende termen en kan zelfstandig basis bioinformatische oefeningen maken en resultaten interpreteren inzake volgende elementen.

    Experimentele structurele biologie methodes: proteïne-kristallografie, single particle cryoEM en bio-NMR

    Structurele bio-informatica

    Krachtvelden en inleiding tot biomoleculaire modellering

    Visualisatie en analyse van de structuur en interacties van biomacromoleculen

    Studiemateriaal

    Oefeningenopgaven in Toledo

    Toelichting onderwijstaal

    Onderdeel van een Nederlandstalige bachelor-opleiding, maar kan in Engels gegeven worden (cursus en oefeningen zijn al in het Engels)

    Toelichting werkvorm

    Blended onderwijs - Gastcollege - Oefensessie

    Oefenzittingen in de computerklas waar topics uit de hoorcolleges in de praktijk omgezet. Hierbij worden hoofdzakelijk publiek toegankelijke gereedschappen gebruikt.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Bioinformatica en structurele biologie (B-KUL-G2O59b)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Praktijkexamen
    Vraagvormen : Meerkeuzevragen
    Leermateriaal : Cursusmateriaal, Computer

    Toelichting

    Het oefeningenexamen gaat door op de pc en is open boek.

    het schriftelijke gedeelte is gesloten boek en zal enkel bestaan uit meerkeuzevragen. Studenten dienen voor beide onderdelen te slagen. Een onvoldoende voor één van deze onderdelen resulteert in een maximale score van 9/20.

    Toelichting bij herkansen

    Identiek als eerste zittijd

    ECTS Eindproject (B-KUL-G0O61B)

    6 studiepunten Nederlands 0 Beide semestersBeide semesters Uitgesloten voor examencontract Uitgesloten voor creditcontract
    Beets Isabel (coördinator) |  N.

    Doelstellingen

    De student is in staat :
    • inzicht te verwerven in de stand van zaken van een bepaald onderzoeksthema aan de hand van de studie van recente literatuur en discussie met onderzoekers in het domein;
    • onder begeleiding een individueel onderzoeksproject op te stellen:
      -) onderzoeksdoelstellingen te formuleren,

      -) het project te situeren in de ruimere context van het onderzoeksdomein en van de toepassingsmogelijkheden,

      -) een onderzoeksplan op te stellen (aard van de experimenten en timing),
      -) de chemische en biologische risico's verbonden aan de geplande onderzoeksactiviteit te analyseren en te formuleren.
    • het geplande onderzoeksproject te presenteren en verdedigen;
    • de geplande experimenten kritisch en kwaliteitsvol uit te voeren, rekening houdend met de veiligheidsvoorschriften, en/of data bekomen binnen de onderzoeksgroep te analyseren;
    • een schriftelijk onderzoeksverslag op te stellen;
    • de resultaten van zijn eigen onderzoeksproject te presenteren aan een publiek van medestudenten en wetenschappers in de vorm van een poster;
    • projecten van medestudenten kritisch te beoordelen.

    Begintermen

    Het maken van een eindproject vereist voldoende inzicht in organisatie, functionaliteit en diversiteit van levende organismen, en in moleculaire structuren en structuur-funktie relaties en vaardigheid in het omgaan met courante biochemische technieken.

    Bachelor biochemie & biotechnologie fase 1 en 2.

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden

    80



    SOEPEL( G0O57C ) OF SOEPEL( X0B43D )


    G0O57CG0O57C : Geïntegreerd practicum in de biochemie en biotechnologie I
    X0B43DX0B43D : Geïntegreerd practicum

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0D20A: Eindproject

    Onderwijsleeractiviteiten

    Eindproject (B-KUL-G0O61a)

    6 studiepunten : Bachelorproef 0 Beide semestersBeide semesters
    N.

    Inhoud

    De bachelorproef bestaat uit één onderzoeksproject in het domein van de biochemie/biologie/biotechnologie en loopt over het volledige academiejaar. De voorbereiding gebeurt in het eerste semester, de uitvoering van het experimenteel werk en data-analyse in het tweede semester (behalve uitzonderingen gelinkt aan de aard van het onderzoek en veiligheidsvoorschriften). Elk project heeft een promotor en een begeleider uit één van de onderzoeksgroepen die betrokken zijn bij de opleiding, waar ook het project wordt uitgevoerd.
    • De ontvangende onderzoeksgroepen bieden één of meerdere onderzoeksthema’s aan overeenkomstig de actieve onderzoekslijnen van het lab. Elke student krijgt na een keuzeronde een studententeam en een onderzoeksthema toegewezen en werkt op basis hiervan in het eerste semester in groep een concreet projectvoorstel/literatuurstudie uit in nauw overleg met de promotor/begeleider. Het project is op bachelor niveau en moet uitvoerbaar zijn binnen de opgegeven tijdslimieten. Regelmatige contactmomenten worden onderling afgesproken. Het projectvoorstel wordt uitgeschreven volgens de voorgeschreven richtlijnen.
    • De student voert in groep het geplande onderzoek uit in het tweede semester.
    • De student analyseert de bekomen resultaten en stelt een individueel schriftelijk eindrapport op van het werk.
    • De student schrijft individueel een vulgariserende samenvatting van het project en presenteert in groep de resultaten van het project in de vorm van een poster tijdens een gemeenschappelijke postersessie.
    Meer gedetailleerde richtlijnen worden aangeboden via Toledo.

    Studiemateriaal

    Wetenschappelijke vakliteratuur ter beschikking gesteld door de onderzoeksgroepen en door de student zelf opgezocht in literatuurdatabanken.

    Toelichting onderwijstaal

    De formele voertaal is het Nederlands. Begeleiding kan eventueel in het Engels gebeuren indien de moedertaal van de begeleider niet het Nederlands is. Gebruik van het engels voor het projectvoorstel en het eindrapport wordt aanbevolen, maar is niet verplicht. De finale poster dient verplicht in het Engels te worden opgesteld. De vulgariserende samenvatting dient verplicht in het Nederlands te worden opgesteld.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Eindproject (B-KUL-G2O61b)

    Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Paper/Werkstuk, Verslag, Presentatie, Self assessment/Peer assessment, Medewerking tijdens contactmomenten

    Toelichting

    De evaluatie is permanent en gebeurt op basis van volgende onderdelen met weging:
    1) het uitgeschreven projectvoorstel (groepswerk)
    2) het experimenteel werk (groepswerk)
    3) het schriftelijk eindrapport (individueel)
    4) de vulgariserende samenvatting (individueel)
    5) de presentatie/verdediging van de poster (groepswerk)

    Elk onderdeel is verplicht. Bij niet afleggen van een onderdeel wordt de bachelorproef beschouwd als "niet geslaagd" (NA).
    De evaluatie gebeurt door de promotor/begeleider (voor het projectvoorstel, experimenteel werk en eindrapport), collega-studenten (peer-evaluatie voor de vulgariserende samenvatting en de posterpresentatie) en praktijkassistenten (voor de posterpresentatie). De evaluatie gebeurt met behulp van een scoreformulier.
    Gedetailleerde informatie wordt ter beschikking gesteld via Toledo.

    Een noodzakelijke voorwaarde om te slagen voor dit opleidingsonderdeel is het opladen in Toledo van een certificaat informatievaardigheden. Dit certificaat kan behaald worden via de facultaire Toledo-community “Wetenschappelijke integriteit aan de Faculteit Wetenschappen”.  Het behalen en opladen van het certificaat informatievaardigheden wordt via ‘pass/fail’ beoordeeld. Een student die een ‘fail’ krijgt voor het certificaat, krijgt een ‘fail’ voor het volledige opleidingsonderdeel, die wordt omgezet in een niet-tolereerbaar cijfer. Concreet betekent dit dat wie het certificaat niet behaalt en oplaadt, niet kan slagen voor het opleidingsonderdeel en het opleidingsonderdeel ook niet kan tolereren.

    Dit opo komt niet in aanmerking voor het tolerantiekrediet.

    Toelichting bij herkansen

     

    ECTS Immunological Biotechnology (B-KUL-G0P77B)

    6 ECTS English 52 First termFirst term Cannot be taken as part of an examination contract

    Aims

    The student has the ability
    - to show insight in the production and differentiation of immune competent cells, the mechanisms of innate verus acquired immunity, the specific immune response to viral, bacterial and worm infections;
    - to explain the typical cellular and molecular aspects of the immune system; to show insight into the production and the role of pathogen-specific and -aspecific immune cell receptors is essential;
    - to explain how original scientific experiments have led to important breakthroughs in immunology;
    - to gather knowledge about how the absence or malfunctioning of one or more components of the immune system leads to an abnormal host-pathogen interaction.
    - to show insight in the theoretical background of a set of immunological methods applicable in a broad range of biosciences, examples are ELISA, immunocytochemistry, western blotting, affinity chromatography, agglutination and precipitation etc.

    Previous knowledge

    Basic knowledge about viruses, bacteria and the way they infect host cells is an advantage. General biological knowledge on the Bachelor-level in Exact Sciences, Biomedical Sciences or Agriculture and Applied Biological Sciences is required to successfully complete this course. To perform well in the practical course, knowledge of the content of the theoretical course ‘Immunological Biotechnology’ is compulsory.

    Identical courses

    X0D25B: Immunologische biotechnologie
    X0D25A: Immunologische biotechnologie

    Onderwijsleeractiviteiten

    Immunological Biotechnology (B-KUL-G0P77a)

    4 ECTS : Lecture 26 First termFirst term

    Content

    In this course a general overview is given of the immune system. The following aspects are discussed in detail: antigens, structure of antibodies and B-cell receptors, antigen-antibody interactions, organisation and expression of the immunoglobulin genes, the major histocompatibility complex, the T-cell receptor, cytokines, the generation of a humoral immune response and the cell-mediated immune response, immunological memory.

    Overview of the topics :
    1. Basic concepts in Immunology
    2. Innate immunity
    3. Antigen recognition by B-cell and T-cell receptors
    4. The generation of lympocyte antigen receptors
    5. Antigen presentation to T lymphocytes
    6. The development and survival of lymphocytes
    7. T-cell mediated immunity
    8. The humoral immune response
    9. Dynamics of the adaptive immune response
    10. The Immunological toolbox

    Course material

    Handbook: Janeway’s Immunobiology
    Powerpoint presentations

    Format: more information

    Active interactions during the course: make notes, ask questions, take part in discussions

    Immunological Biotechnology: Practical Session (B-KUL-G0P78a)

    2 ECTS : Practical 26 First termFirst term

    Content

    The students are acquainted with a number of basic skills of modern laboratory practice in general and with the use of immunological techniques in particular. The contents of the practical workshops can be divided in two parts.
A first set of experiments is offered in which the student can personally test a number of experiments about the dynamics of the interaction between antibody and antigen (which have been introduced in the theoretical class). These are a number of elementary demonstrations that are however no longer used on a routine-basis in modern laboratories. Next, there is a second category of experiments that do belong to the repertoire of many biochemical-physiological labs, i.e. immunological dosage-systems, purifying protocols and localisation techniques. The student receives the necessary material to independently conduct a hormonal dosage, localise a hormone in a tissue or to purify an antibody from a rough antiserum.
In practice, the student is assigned to successfully conduct a number of personally chosen experiments (five out of 12) in the course of one week. In addition, the student is asked to write a biochemical safety report for one of the experiments he/she performed in the lab to get acquainted with best practices in a laboratory environment. To achieve this, the students will work in groups of two, maximum three persons. The students themselves plan all the necessary practical work and discussions with the lab assistants within the time frame of one week and within the opening hours of the institute.

    Course material

    A manual explaining the principles and the set-up of the different experiments and containing instructions for the interpretation of the data that are generated during the practical course.

    Format: more information

    Students independently perform a subset of experiments using the manual and the background information from the theoretical course as a guide. They learn to perform well in a small team (2 tot 3 students) and to manage and execute a set of experiments within a predefined time frame.  
The students show and discuss the results of each experiment with the teacher in order to learn how to interpret the results of a given experiment.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluation: Immunological Biotechnology (B-KUL-G2P77b)

    Type : Exam during the examination period
    Description of evaluation : Written
    Type of questions : Open questions
    Learning material : None

    Explanation

    Theoretical course: Written. The student should make drawings and schemes whenever possible.
    Active involvement in the practical course is a prerequisite for participation to the exam.

    Practical course: At the end of the practical course, a written exam (or written reports) probes the knowledge about the set of experiments.

    Information about retaking exams

    Only the theoretical exam can be retaken, not the practical exam. The score for the latter part remains unchanged in a second examination attempt.

    ECTS Wijsbegeerte (B-KUL-G0Q80A)

    3 studiepunten Nederlands 26 Tweede semesterTweede semester

    Doelstellingen

    Na het succesvol afronden van dit opleidingsonderdeel kan de student:

    • Belangrijke fases in de historische ontwikkeling van Westerse wijsbegeerte en de wetenschappen opnoemen en relateren aan de huidige situatie.
    • De rol van empirie en rationaliteit bij het verwerven van hedendaagse wetenschappelijke kennis analyseren.
    • Drie types van wetenschappelijke denken (deductie, inductie en abductie) benoemen, toelichten en herkennen.
    • Grondbegrippen van de zinslogica toepassen.
    • Verschillende interpretaties van waarschijnlijkheid en hoe deze toegepast worden in de wetenschappen toelichten.
    • De rol van deductie en waarschijnlijkheid bij falsificatie en (dis-)confirmatie uitleggen.
    • De rol van natuurwetten, deductie, waarschijnlijkheid en causaliteit bij wetenschappelijke verklaringen uitleggen.
    • Verschillende strategieën en valkuilen bij het demarcatievraagstuk benoemen.
    • De eigen (impliciete) opvattingen over wetenschap expliciteren en kritisch evalueren.
    • De verbanden en de verschillen tussen wetenschap en wijsbegeerte uitleggen.
    • Kritisch reflecteren over de eigen discipline.

    Begintermen

    Er is geen specifieke voorkennis vereist, enkel de algemene vorming uit de middelbare school.

    Identieke opleidingsonderdelen

    G0U44A: Wijsbegeerte
    X0A13A: Wijsbegeerte

    Onderwijsleeractiviteiten

    Wijsbegeerte (B-KUL-G0Q80a)

    3 studiepunten : College 26 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Onder meer de volgende onderwerpen uit de logica en de algemene wetenschapsfilosofie komen aan bod:

    • Zinslogica
    • Inferenties, theorieën en observaties
    • Verificatie en falsificatie
    • Waarschijnlijkheid
    • Inductie en confirmatie
    • Abductie en verklaringen
    • Wat is wetenschap?

    Ook thema's uit de bijzondere wetenschapsfilosofie zullen aan bod komen.

     

    Studiemateriaal

    Heylen, Jan. Over denken. Inleiding tot logica en wetenschapsfilosofie.Owl Press, 2024. ISBN voor studenten: 9789464778861.

     

     

    Toelichting werkvorm

    • Hoorcolleges met activering
    • Leermodules op Toledo

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Wijsbegeerte (B-KUL-G2Q80a)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    De evaluatie bestaat uit een examen tijdens de examenperiode, dat bestaat uit:

    • meerkeuzevragen met correctie voor raden (gewicht in het eindresultaat: 17/20)
    • open vragen (gewicht in het eindresultaat: 3/20).

    De gewogen resultaten behaald op de verschillende componenten worden bij elkaar opgeteld en vervolgens afgerond.

     

    Toelichting bij herkansen

    De 2de examenkans bestaat uit een examen tijdens de examenperiode, dat bestaat uit:

    • meerkeuzevragen met correctie voor raden (gewicht in het eindresultaat: 17/20)
    • open vragen (gewicht in het eindresultaat: 3/20).

    De gewogen resultaten behaald op de verschillende componenten worden bij elkaar opgeteld en vervolgens afgerond.

    ECTS Biological Data Analysis (B-KUL-G0S04A)

    3 ECTS English 34 First termFirst term Cannot be taken as part of an examination contract
    Wenseleers Tom (coordinator) |  Wenseleers Tom |  N.

    Aims

    After completing this course, the student is able to statistically analyze simple biological datasets using the software package R and to interpret and report the obtained results.

    Previous knowledge

    Basic knowledge of statistical theory as taught in the course 'Statistiek & data-analyse'.

    Onderwijsleeractiviteiten

    Biological Data Analysis (B-KUL-G0S04a)

    2 ECTS : Lecture 16 First termFirst term

    Content

    • The scientific method
    • Basics of statistical inference
    • One-sample t-test, paired t-test, unpaired t-test
    • Pearson correlation
    • Non-parametric methods
    • Simple and multiple linear regression
    • Model diagnosis, influential observations
    • Curvilinearity in regression
    • One-way and multi-way ANOVA
    • ANCOVA
    • Introduction linear mixed models, incl. repeated measures analysis
    • Introduction generalized linear models & generalized linear mixed models
    • Experimental design

    Course material

    • Course slides
    • TOLEDO

    Biological Data Analysis: Exercises (B-KUL-G0S05a)

    1 ECTS : Practical 18 First termFirst term
    Wenseleers Tom |  N.

    Content

    • Unpaired t-test, one-sample t-test, paired t-test
    • Pearson correlation
    • Non-parametric methods
    • Simple & multiple linear regression
    • Model diagnosis, outliers & influential observations
    • Curvilinearity in regression
    • One-way & multiway ANOVA
    • ANCOVA
    • Introduction linear mixed models, incl. repeated measures analysis
    • Introduction generalized linear models & generalized linear mixed models
    • Experimental design

    Course material

    • Course slides
    • TOLEDO

    Format: more information

    Practical exercises in R. The practicals for this course are obligatory.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluation: Biological Data Analysis (B-KUL-G2S04a)

    Type : Exam outside of the normal examination period
    Description of evaluation : Written
    Type of questions : Open questions
    Learning material : Computer, Reference work, Course material

    Explanation

    The evaluation consists of a fully written part with individual exercises in computer lab. 

    The student passes the course if they obtain a total score of at least 10/20.

    Information about retaking exams

    The modalities for re-taking the exam are the same as during the first exam round.

    ECTS Principles of Economics for Scientists (B-KUL-G0S62A)

    6 ECTS English 52 First termFirst term

    Aims

    Learn how to solve economic problems using calculus. Develop micro-economic thinking and learn how to apply this to problems in innovation.

    Students learn the principles of consumer and producer theory, decision making under uncertainty, competitive markets, monopoly, imperfect competition, game theory and information economics, innovation economics and network industries.

    Previous knowledge

    Students should have followed one of the following courses :
    - Students from bachelor Geologie, Geografie, Chemie, Biochemie en biotechnologie and Informatica : Wiskunde 1
    - Students from bachelor Wiskunde and Natuurkunde: Calculus 1
    - Students from bachelor Biologie : Wiskundige methoden voor biomedische wetenschappen
     

    Is included in these courses of study

    Onderwijsleeractiviteiten

    Principles of Economics for Scientists: Microeconomics - Lectures (B-KUL-G0S62a)

    2 ECTS : Lecture 16 First termFirst term

    Content

    The course covers principles of economics, with an emphasis on the economics of information and innovation. All topics will be based on microeconomic principles with an emphasis on calculus and problem-solving.
    Lectures will cover applications that are relevant for students in innovation.
    Part 1 Microeconomics
    1) Supply and demand (MLD, Ch 2,3) Rangel, Unit 4
    2) Government interventions (MLD, Ch 5,7,8) Rangel, Unit 5,6,9
    3) Producer theory (MLD, Ch 9,10,11) Rangel, Unit 3
    4) Consumer theory (MLD, Ch 12) Rangel, Unit 2
    5) Monopoly (MLD, Ch 15) Rangel, Unit 7
    6) Price discrimination and asymmetric information Rangel, Unit 7
    Students learn the principles of consumer and producer theory, decision making under uncertainty, competitive markets, monopoly.
     

    Course material

    - Antonio Rangel, Principles of Economics for Scientists (Coursera course), and recent 2014 version: Principles of economics with calculus (edX course)
    - Preston McAfee, Tracy Lewis, Donald Dale (MLD), Introduction to Economic Analysis, 2009
    The course material consists of slides used in the lectures, problem sets and a handbook in intermediate microeconomics (for example: McAfee, Lewis and Dale; selected chapters from Belleflamme and Peitz).
     

    Format: more information

    The type of instruction is based on lectures and illustrated with examples based on calculus.

    Principles of Economics for Scientists: Microeconomics - Assignments (B-KUL-G0S63a)

    1 ECTS : Practical 10 First termFirst term

    Content

    The assignments will cover applications that are relevant for students in innovation.

    Course material

    - Antonio Rangel, Principles of Economics for Scientists (Coursera course), and recent 2014 version: Principles of economics with calculus (edX course)
    - Preston McAfee, Tracy Lewis, Donald Dale (MLD), Introduction to Economic Analysis, 2009
    The course material consists of slides used in the lectures, problem sets and a handbook in intermediate microeconomics (for example: McAfee, Lewis and Dale; selected chapters from Belleflamme and Peitz).
     

    Format: more information

    There are several practical sessions where problem sets are solved.

    Principles of Economics for Scientists: Information and Innovation - Lectures (B-KUL-G0S64a)

    2 ECTS : Lecture 16 First termFirst term

    Content

    The course covers principles of economics, with an emphasis on the economics of information and innovation. All topics will be based on microeconomic principles with an emphasis on calculus and problem-solving.
    Lectures will cover applications that are relevant for students in innovation.
    Part 2 Information and innovation
    7) Dynamic choice and uncertainty (MLD, Ch 13)
    8) Game theory and oligopoly (MLD, Ch 16, 17) Rangel, Unit 8
    9) Information and incentives (MLD, Ch 18, 19)
    10) Innovation and R&D (BP, Ch 18)
    11) Intellectual property (BP, Ch 19)
    12) Networks, standards and two-sided markets (BP, Ch 20-22)
    Students learn the principles of imperfect competition, game theory and information economics, innovation economics and network industries.
     

    Course material

    - Preston McAfee, Tracy Lewis, Donald Dale (MLD), Introduction to Economic Analysis, 2009
    - Belleflamme and Peitz (BP), Industrial Organization: Markets and Strategies, Cambridge University Press, 2010
    The course material consists of slides used in the lectures, problem sets and a handbook in intermediate microeconomics (for example: McAfee, Lewis and Dale; selected chapters from Belleflamme and Peitz).
     

    Format: more information

    The type of instruction is based on lectures and illustrated with examples based on calculus.

    Principles of Economics for Scientists: Information and Innovation - Assignments (B-KUL-G0S65a)

    1 ECTS : Practical 10 First termFirst term

    Content

    The assignments will cover applications that are relevant for students in innovation.

    Course material

    - Preston McAfee, Tracy Lewis, Donald Dale (MLD), Introduction to economic Analysis, 2009
    - Belleflamme and Peitz (BP), Industrial Organization: Markets and Strategies, Cambridge University Press, 2010
    The course material consists of slides used in the lectures, problem sets and a handbook in intermediate microeconomics ( for example: McAfee, Lewis and Dale; selected chapters from Belleflamme and Peitz).
     

    Format: more information

    There are several practical sessions where problems sets are solved.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluation: Principles of Economics for Scientists (B-KUL-G2S62a)

    Type : Exam during the examination period
    Description of evaluation : Written
    Type of questions : Open questions
    Learning material : Calculator

    Explanation

    FEATURES OF THE EVALUATION

    The final exam:

    • The final exam will be a written, closed-book exam.
    • Students can use a NON-graphic calculator to solve mathematical questions
    • The exam consists of open questions

     

    DETERMINATION OF FINAL GRADES#

    * The grades are determined by the lecturer as communicated via Toledo and stated in the examination schedule. The result is calculated and communicated as a whole number on a scale of 20.

    Both components of the course (“Microeconomics” and “Information and Innovation”) will count for 50% of the final grade.

     

    SECOND EXAMINATION OPPORTUNITY

    *The features of the evaluation and determination of grades are identical to those of the first examination opportunity, as described above

    If a student passed for one of the components in the first examination period, he does not have to retake this part of the exam in the second examination period.

    ECTS Workshops innovatie in de praktijk (B-KUL-G0S66A)

    3 studiepunten Nederlands 15 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract
    Schoutens Wim (coördinator) |  Lips Daniel |  Maes Tom |  Schoutens Wim

    Doelstellingen

    - Aspecten van intellectual property en patentscreening als deel van het opzetten van innovatieve projecten in te schatten.
    - Leren hoe innovaties ontstaan, evolueren en welke aspecten hierin een cruciale rol spelen, zoals inzicht te hebben in het hele proces van vinding tot product,  afwegingen te maken aangaande commercialiseerbaarheid, scaling en productieproces, Design,...
    - Leren een wetenschappelijk verhaal te pitchen.
     

    Begintermen

    Dit opo mag enkel gevolgd worden door studenten die de minor Business & Innovation aan de faculteit Wetenschappen volgen.

    Plaats in het onderwijsaanbod

    Onderwijsleeractiviteiten

    Workshops innovatie in de praktijk (B-KUL-G0S66a)

    3 studiepunten : Opdracht 15 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Het vak Workshops Innovatie in de praktijk I bestaat uit verschillende thematische workshops:

    - Innovatie workshops

    - Picthing workshops

    - Intellectual Property workshops

    De studenten nemen verplicht deel aan elke van de workshops. Soms worden er assignments gegeven. Soms wordt er gevraagd in groep of teamverband  opdrachten uit te voeren. 

    Studiemateriaal

    werkmap

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Workshops innovatie in de praktijk (B-KUL-G2S66a)

    Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Paper/Werkstuk, Verslag, Presentatie, Self assessment/Peer assessment, Medewerking tijdens contactmomenten, Portfolio

    Toelichting

    Afhankelijk van de workshop worden er taken op gegegeven waarvoor een kort verslag hoor ingediend te worden. Studenten bereiden ook een pitch voor.

    Niet-deelname aan de contactmomenten of aan één van de evaluatieactiviteiten of het niet indienen van een taak, resulteert in 'niet geslaagd' voor dit opo.

    Door de specifieke vorm van deze workshops is het niet mogelijk om een tweede examenkans aan te bieden.

    Dit opo heeft een evaluatievorm geslaagd/niet geslaagd.

    Toelichting bij herkansen

    Door de specifieke vorm van deze workshops is het niet mogelijk om een tweede examenkans aan te bieden. 

    ECTS Innovatieproject (B-KUL-G0S68A)

    6 studiepunten Nederlands 30 Beide semestersBeide semesters Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    -Innovatie:  Studenten leren en denken na hoe een resultaat van (fundamenteel) wetenschappelijk onderzoek of een idee of concept tot een commercieel innovatief product kan leiden. De studenten maken kennis met de verschillende stappen tussen vinding/idee en product.

    -Communicatie:  Studenten leren een (complex) (wetenschappelijk) vinding/idee uit te leggen voor mensen buiten het vakgebied. Studenten leren een case te presenteren en voor te stellen; zij leren te communiceren over innovatieve vindingen en de uitwerking ervan.

    -Teamwork en management: Studenten leren in team te werken en de facetten van een gegeven opdracht zowel in de tijd als in de ruimte te managen.

    Begintermen

    Dit opleidingsonderdeel kan enkel opgenomen worden door studenten die de minor Business & Innovation aan de faculteit Wetenschap volgen.

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    (SOEPEL( G0S66A ) OF SOEPEL( D0X14A ))AND (SOEPEL( G0S62A ) OF SOEPEL( D0W67A ))AND (SOEPEL( D0H54A ) OF SOEPEL( X0F39A ) OF SOEPEL( D0W68A ) )AND GELIJKTIJDIG( D0T32A )


    G0S66AG0S66A : Workshops innovatie in de praktijk
    D0X14AD0X14A : New product and service development
    G0S62AG0S62A : Principles of Economics for Scientists
    D0W67AD0W67A : De globale economie
    D0H54AD0H54A : Marketing engineering
    X0F39AX0F39A : Bedrijfskunde en ondernemen
    D0W68AD0W68A : Markten en prijzen
    D0T32AD0T32A : Economics of Innovation and Intellectual Property


    Plaats in het onderwijsaanbod

    Onderwijsleeractiviteiten

    Innovatieproject (B-KUL-G0S68a)

    6 studiepunten : Opdracht 30 Beide semestersBeide semesters

    Inhoud

    Het vak innovatieproject bestaat o;a. uit verschillende thematische workshops, seminaries, excursies waaraan de studenten verplicht moeten deelnemen.   Soms worden er assignments gegeven. Soms wordt er gevraagd in groep of teamverband opdrachten uit te voeren. 

    Studenten werken in groepjes op een specifiek innovatieproject.  Een project bestaat uit

    • een specifiek onderzoeksresultaat waarvan men denkt dat de toepassing ervan potentieel commercialiseerbaar is;
    • een vinding waarover eventueel al verschillende initiatieven genomen zijn om deze vinding te valoriseren;
    • een concreet idee dat al of niet reeds in een start-up fase zit;

    Enerzijds leren de studenten het proces van vinding tot product tot in detail kennen, anderzijds krijgen de betrokken onderzoekers/projectbegeleiders feedback en input over de commercialiseerbaarheid van hun vinding. Mogelijks wordt er een second opinion aangeleverd.

    De studenten nemen actief contact op met de begeleider, zij bespreken zowel de vinding, de aangedragen pistes voor valorisatie en de mogelijke toepassingen ervan. Zij werken een concrete toepassing uit en overleggen hiervoor eventueel met andere mensen, diensten, bedrijven.

    Het project beoogt alsook een financieel en business plan uit te werken.

    Studenten die dit opleidingsonderdeel opnemen zullen een Non Disclosure Agreement moeten ondertekenen en afstand doen van alle rechten op het resultaat van het project.

    Studiemateriaal

    Elke begeleider stelt in samenspraak met de departementale coördinator een werkmap samen met achtergrondinfo, wetenschappelijke artikels, white-papers, rapporten,  referentie, contactpersonen, …
     

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Innovatieproject (B-KUL-G2S68a)

    Type : Permanente evaluatie zonder examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Paper/Werkstuk, Verslag, Presentatie, Self assessment/Peer assessment, Medewerking tijdens contactmomenten, Portfolio

    Toelichting

    Elke groep levert een tussentijds- en eindverslag in en geeft twee presentaties.

    Het eindverslag bestaat minstens uit de volgende delen:

    • Inleiding:  situatieschets, inleiding, waarom is er nood aan het product, over wat gaat het, …;
    • Vinding/idee: beschrijving van de wetenschappelijke vinding of het idee dat aan de basis ligt van het te ontwikkelen product. Nadruk ligt niet op het technische maar eerder op een formulering die nuttig kan zijn voor mensen buiten het specifieke vakgebied; 
    • Innovatie: beschrijving van het product (in de ruime zin) dat uit de vinding/idee eventueel kan voortvloeien.
    • Financieel en Business plan voor project met toelichten van de aannames.
    • Markt: Voor wie is het product bestemt, wie koopt het product, wie gebruikt het product,  wie is de concurrentie, hoe vergelijkt het zich met andere gerelateerde producten, prijszetting, groeimogelijkheden, distributiekanalen, … ;
    • Intellectual property: Kan het product gepatenteerd worden ? Hoe kan men (KU Leuven) het product beschermen ?  … ;
    • Marketing: Hoe zou je het product marketen ? Hoe breng je het product aan de man ?;
    • Conclusie 
    • Feedback: welke aspecten van de opleidingsonderdelen van de Minor Business and Innovation waren nuttig en heb je concreet gebruikt. Over welke onderdelen van het project had je graag meer achtergrond of basis informatie gehad ?

    Het tussentijdsverslag werkt de delen Inleiding en Vinding/idee in detail uit. Een eerste aanzet van een Financieel en Business Plan wordt aangeleverd. Verder bevat het verslag minimum ook een uitgewerkt eerste voorstel voor het deel Innovatie, en een plan/bulletpoints voor de delen Markt, Intellectual Property en Marketing.

    In het tweede semester werken de studenten voornamelijk de toepassing en de commercialiseerbaarheid ervan verder uit. Zij maken eventueel aanpassingen aan het eerste voorstel beschreven in hun tussentijdsrapport. Zij overleggen eventueel met andere mensen, mogelijke klanten, diensten, bedrijven, …

    Tenslotte presenteren de studenten hun werk:

    • Men maakt zelf een short video (1-2 min) die het product voor een zeer breed publiek voorstelt.
    • Pitch (10 min) van project (incl. business plan, IP aspecten)  gevolgd door een technische Q&A (15 min) voor begeleiders en coördinatoren.
    • Pitch (5 min) van idee en product (niet technisch) voor algemeen publiek (medestudenten, wetenschappers, onderzoekers, mensen uit bedrijfsleven, …) .

    Door de specifieke vorm van dit project is het niet mogelijk om een tweede examenkans aan te bieden.

    Toelichting bij herkansen

     

    ECTS Functionele biologie van planten (B-KUL-G0U90B)

    4 studiepunten Nederlands 26 Eerste semesterEerste semester

    Identieke opleidingsonderdelen

    G0U90A: Functionele biologie van planten

    Onderwijsleeractiviteiten

    Functionele biologie van planten (B-KUL-G0O63a)

    4 studiepunten : College 26 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    1. Oorsprong en definitie van leven
    2. Ecosystemen en ecologie
    3. Biologische oplossingen voor wereldproblemen:  een rol voor stress tolerante planten
    4. Planten versus andere organismen: mechanismen van autotrofie, rol van dynamische celwanden en open ontwikkeling.  Source-sink relaties
    5. Plantenweefsels en organen: de link tussen structuur en functie
    6. Mechanismen van wateropname en transport in planten
    7. Plantreproduktie: gelijkenissen en verschillen met dierlijke reproduktie
    8. Oorsprong van biodiversiteit
    9. Biodiversiteit en het centrale dogma: virussen
    10. Biodiversiteit bij prokaryoten
           a. Metabolische diversiteit
           b. Adaptaties
           c. Interacties met andere organismen
    11. Ontstaan van eukaryoten
    12. Biodiversiteit bij eukaryoten
           a. Protista
           b. Fungi
               1) Indeling en diversiteit
               2) Interacties met andere organismen
           c. Planten
               1) Wieren
                    a) Indeling 
                    b) Ecologische betekenis en (biochemische) diversiteit 
                    c) Interacties met andere organismen
               2) Hogere planten
                    a) Levermossen en bladmossen
                    b) Varenachtigen
                    c) Zaadplanten (naakt- en bedektzadigen)
    .               d) Fylogenie van bloemplanten met oog voor cultuurgewassen
    13. Rol van inwendige signalen (plantenhormonen en suikers) en uitwendige factoren (licht, temperatuur...) bij:
          a. Plantengroei en ontwikkeling
          b. Bloeiinductie
    14. Biochemische adapties bij hogere planten met focus op droogtetolerantie
    15. Plantenbiotechnologie, GGO's

    Toelichting werkvorm

    Hoorcollege met interactie in de vorm van vragen en antwoorden

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Functionele biologie van planten (B-KUL-G2U90b)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Portfolio
    Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Gesloten vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    Permanente evaluatie bestaat uit een tussentijdse toets met meerkeuzevragen (2 pt) en een portfolio (2 pt)

    Het schriftelijk examen in januari bestaat uit een hoofdvraag (9 pt), meerkeuzevragen (4 pt) en een levenscyclus (3 pt) 

    Toelichting bij herkansen

    De scores van de tussentijdse toets en portfolio blijven behouden in de tweede en derde examenperiode

    ECTS Oncobiology (B-KUL-G0W23A)

    3 ECTS English 26 Second termSecond term

    Aims

    - to explain the molecular and cellular mechanisms of the onset and development of cancer
    - to explain the principles of cancer treatment

    Previous knowledge

    The student has basic knowledge in celbiology, histology, genetics and metabolism of the normal animal organims. He has basic insights in the molecular mechanisms of transmission of genetic information, signal transduction and regulation of gene expression.

    Order of Enrolment



    ( FLEXIBLE( G0N04C ) OR FLEXIBLE( X0A97C ) OR FLEXIBLE( X0E45A ) ) AND
    ( FLEXIBLE( G0N12B ) OR FLEXIBLE( X0B24B ) OR FLEXIBLE( X0B24C ) ) AND
    ( FLEXIBLE( G0N05B ) OR FLEXIBLE( X0A83A ) OR FLEXIBLE( X0A83C ) OR FLEXIBLE( G0Z20B ) )


    G0N04CG0N04C : Celbiologie en biochemie
    X0A97CX0A97C : Biochemie
    X0E45AX0E45A : Biochemie
    G0N12BG0N12B : Genetica
    X0B24BX0B24B : Genetica
    X0B24CX0B24C : Genetica
    G0N05BG0N05B : Bouw en functie van dieren
    X0A83AX0A83A : Dierkundige biologie
    X0A83CX0A83C : Dierkundige biologie
    G0Z20BG0Z20B : Functionele biologie van dieren

    Onderwijsleeractiviteiten

    Oncobiology (B-KUL-G0W23a)

    3 ECTS : Lecture 26 Second termSecond term

    Content

    • Definition and pathology of cancer cells: benign, premalignant and malignant tumors. Grading and staging
    • Carcinogenesis as a multistep process, chemical carcinogens, irradiation, viral carcinogenesis etc.  
    • Cancer and the host: heredity of cancer, immunology of cancer, cachexia
    • Growth mechanisms of cancer cells: cytokines and receptors, signal transduction mechanisms, oncogenes, tumorsuppressor genes, the cell cycle, apoptosis, angiogenesis, telomerase, adhesion and metastasis, multidrug resistance etc.
    • Molecular techniques for diagnosis of cancer and minimal residual disease
    • Principles of cancer treatment: irradiation, chemotherapy, gene therapy, humoral and cellular immunotherapy, tumor vaccination, cytokines, anti-angiogenesis etc.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluation: Oncobiology (B-KUL-G2W23a)

    Type : Exam during the examination period
    Description of evaluation : Written, Oral

    ECTS Functionele biologie van dieren (B-KUL-G0Z20B)

    5 studiepunten Nederlands 39 Tweede semesterTweede semester Uitgesloten voor examencontract

    Identieke opleidingsonderdelen

    X0A83A: Dierkundige biologie
    G0Z20A: Functionele biologie van dieren

    Onderwijsleeractiviteiten

    Bouw en functie van dieren (B-KUL-G0N05a)

    5 studiepunten : College 39 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Na de situering van het dierenrijk en een algemene definitie van een 'dier', geeft deze cursus een overzicht van enkele typische levensfuncties van dieren (zowel gewervelden als ongewervelden). Elk hoofdstuk behandelt een specifiek probleem waarmee een dier in zijn omgeving geconfronteerd wordt (bv. het verwerken van voedsel, het verwijderen van schadelijke afvalstoffen, enz.) en illustreert zowel de evolutionair geconserveerde fysiologische mechanismen alsook de evolutionaire variaties op eenzelfde thema. De bouw en de werking van de verschillende orgaanstelsels wordt besproken met de nadruk op de relatie tussen de structuur (morfologie) en de werking (fysiologie).

    1. Inleiding tot de dierkunde.
    Indeling van de levende wezens. Definitie en kenmerken van een dier. Subdisciplines in de dierkunde. 
    2. De vroege embryonale ontwikkeling en de evolutionaire stamboom van dieren.
    Klievingsdelingen. Gastrulatie en de vorming van het coeloom. Indeling van het dierenrijk op basis van de vroege embryonale ontwikkeling. 
    3. Dierlijke weefsels.
    Dekweefsel. Steunweefsel. Spierweefsel. Zenuwweefsel. Organen en orgaanstelsels.
    4. Het zenuwstelsel.
    De membraanpotentiaal. De actiepotentiaal en impulsgeleiding. Synaptische transmissie. Neurotransmitters. Organisatie van het centraal en perifeer zenuwstelsel.
    5. Zintuigen.
    Fotoreceptoren. Bouw en evolutie van ogen. Mechanoreceptoren (haarcellen, tast, druk, evenwicht, evolutie van het oor). Chemoreceptoren. Thermoreceptoren, nociceptoren en electromagnetische receptoren. Andere receptoren.
    6. Het endocrien stelsel.
    Hydrofiele en lipofiele hormonen. Cellulair mechanisme van de hormoonwerking. Hormonen van de hypothalamus en de hypofyse, de schildklier en de bijschildklieren, de bijnieren, de pancreas, de gonaden. Melatonine. Andere hormonen.  Hormonen bij Protostomia.

    7. Steun en beweging. 
    Het skelet (hydroskelet, exoskelet, endoskelet). Het spierstelsel. Manieren van voortbeweging in het dierenrijk en evolutionaire adaptaties. 
    8. Spijsvertering.
    Voedingsstoffen. Voedselopname. Variaties en evolutionaire aanpassingen van het spijsverteringsstelsel. Spijsvertering bij zoogdieren (de mens). Neurale en hormonale regulatie van de spijsvertering. Heterotroof en toch niet eten. 
    9. Gasuitwisseling.
    Transport van gassen. Gasuitwisselingssystemen (longen, kieuwen, huid, tracheeën). Mechanisme van longventilatie

    10. Circulatie.
    Open en gesloten circulatiestelsel. Samenstelling en functie van bloed bij Vertebrata. De gesloten bloedsomloop bij Vertebrata (hart, perifere bloedsomloop). Het open circulatiesysteem van lymfevaten bij Vertebrata. Het open circulatiesysteem bij insecten. 
    11. Excretie en osmoregulatie.
    Osmose. De osmotische balans. Osmoconformers en osmoregulatoren. Excretie van stikstofhoudende afvalproducten. Excretieorganen (proto- en metanefridia, buisjes van Malpighi, nieren). Evolutie van de vertebrate nier. Bouw en werking van de nier bij de mens. 
    12. Voortplanting.
    Kiemcellen. Geslachtelijke en ongeslachtelijke voortplanting. Bouw en werking van het voortplantingsstelsel (spermatogenese, oögenese). Voortplantingsstelsel bij de mens, wormen en insecten).
    13. Ontwikkeling. Bevruchting. Klievingspatronen. Gastrulatie. Extra-embryonale vliezen. Het cleidoïsch ei. Het centrolecithaal ei. Organogenese. Regulatie van de ontwikkeling. Metamorfose. 
    14. Het immuunstelsel.
    De huid en mucosale epithelen. Aangeboren immuniteit. Verworven (adaptieve) immuniteit. De lymfoiede organen van het adaptief immuunsysteem. Verloop van de adaptieve immuunrespons. Auto-immuniteit. Allergie. Pathogenen die ontsnappen aan het immuunsysteem. 
    15. Gedrag. Aangeboren gedrag. Leergedrag. Inprenting. Communicatie. Cognitie. Gedrag en evolutie. Altruïsme. Dierlijke samenlevingen. 
     

    Studiemateriaal

    Cursustekst
    Powerpointpresentaties
    Multimedia
    Toledo

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    G0N05B : Bouw en functie van dieren

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Functionele biologie van dieren (B-KUL-G2Z20b)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Paper/Werkstuk, Take-home
    Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    De deelname aan het elektronisch leerplatform + werkstuk (permanente evaluatie) is verplicht. 

    De student slaagt indien de gewogen eindscore (80% examen theorie, 20% permanente evaluatie (werkstuk + e-opdrachten)) minstens 10/20 bedraagt. Wanneer de student echter op minstens 2 vragen van het theorie-examen of op 1 vraag van het theorie-examen én op de permanente evaluatie een onvoldoende haalt, wordt de totale eindscore met 1 punt verlaagd. 

    Toelichting bij herkansen

    Het theorie-examen verloopt identiek aan dat van de 1ste examenkans.

    Herkansen voor de permanente evaluatie (e-opdrachten + werkstuk) is om praktische redenen niet mogelijk en de oorspronklijke scores blijven daarom behouden voor het berekenen van het eindtotaal.

    ECTS Inleiding in de gedragsneurowetenschappen (B-KUL-G0Z21A)

    6 studiepunten Nederlands 39 Tweede semesterTweede semester

    Doelstellingen

    Na het voltooien van dit OPO:

    • beschikt de student over eenvoudige basiskennis en inzicht met betrekking tot de werking van het zenuwstelsel. Een dergelijke inleiding in de bouw en de werking van het zenuwstelsel is in toenemende mate relevant voor de moderne gedragswetenschapper.
    • verwerft de student inzicht in de bouw en de werking van zenuwcellen en in de wijze waarop het zenuwstelsel informatie verwerkt, transporteert en opslaat. De organisatiestructuur en de werking van somatosensorische en motorische systemen wordt bestudeerd, alsook de mechanismen van pijnperceptie, de slaap en de (hormonale) homeostase.
    • is de student in staat neurowetenschappelijk onderzoek en vakliteratuur van eenvoudig niveau te begrijpen.
    • beschikt de student over een analytisch vermogen en kritische houding zodat de reikwijdte en de geldigheid van informatie op een academisch verantwoorde manier kan beoordeeld worden.
    • heeft de student oog voor wetenschappelijke ontwikkelingen in de gedragsneurowetenschappen en volgt de actualiteit in de wetenschapspopulariserende pers.

    Begintermen

    Geen specifieke begintermen vereist.

    Onderwijsleeractiviteiten

    Inleiding in de gedragsneurowetenschappen (B-KUL-P0M09a)

    5 studiepunten : College 39 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Tijdens de hoorcolleges worden volgende thema's in chronologische volgorde behandeld:

    • De macroscopische en microscopische structuur van het zenuwstelsel.
    • De cellulaire en zelfs moleculaire processen die zich in het zenuwstelsel afspelen en die de biologische basis vormen van ons gedrag.
    • Na een korte algemene inleiding over de celbouw en -fysiologie wordt de student ingewijd in de specifieke bouw en de werking van de cellen die het zenuwstelsel opbouwen.
    • De eigenschappen van exciteerbare cellen worden bekeken en de mechanismen van de prikkelgeleiding worden uitgelegd.
    • Het gehele proces dat begint bij de registratie van externe prikkels over de prikkelgeleiding en verwerking van informatie tot de uiteindelijke motorische responsen en spiercontracties.
    • De belangrijkste functionele systemen voor de controle van bewegingen en de somatosensorische waarneming, de processen van thalamische gating, pijngewaarwording, slaap, (hormonale) homeostase.
    • Neurale mechanismen van leren en geheugen, neuroplasticiciteit.

    Studiemateriaal

    • Eigen notities te nemen tijdens het hoorcollege
    • Handboek (meest recente uitgave bij Acco)
    • Recent overzichtsartikel in leidinggevend neurowetenschappelijk tijdschrift

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    P0M09B : Inleiding in de gedragsneurowetenschappen

    Inleiding in de gedragsneurowetenschappen: zelfstudie oefening (B-KUL-G0Z21a)

    1 studiepunten : Opdracht 0 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Er wordt een substantieel review artikel uit Nature NeuroScience Reviews gekozen voor de studenten dat aansluit bij een thema uit de cursus (bv motivatie, slaapproblemen, dyslexie). Dit artikel moet dan na zelfstudie gekend zijn en er worden extra vragen over gesteld tijdens het schriftelijk examen.

    Studiemateriaal

    Er wordt een substantieel review artikel uit Nature NeuroScience Reviews gekozen voor de studenten dat aansluit bij een thema uit de cursus (bv motivatie, slaapproblemen, dyslexie). Dit artikel moet dan na zelfstudie gekend zijn en er worden extra vragen over gesteld tijdens het schriftelijk examen.

    Toelichting werkvorm

    Er wordt een substantieel review artikel uit Nature NeuroScience Reviews gekozen voor de studenten dat aansluit bij een thema uit de cursus (bv motivatie, slaapproblemen, dyslexie). Dit artikel moet dan na zelfstudie gekend zijn en er worden extra vragen over gesteld tijdens het schriftelijk examen.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Inleiding in de gedragsneurowetenschappen (B-KUL-G2Z21a)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk
    Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    Schriftelijk examen dat bestaat uit multiple choice vragen en mogelijk enkele open vragen of blinde figuren.

    ECTS Veredeling en biotechnologie (FWET) (B-KUL-I0N52A)

    6 studiepunten Nederlands 65 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract
    Buys Nadine (coördinator) |  Buys Nadine |  De Storme Nico

    Doelstellingen

     Hoorcollege

    • De studenten begrijpen de grondslagen van de veredeling en kunnen deze toepassen.
    • De studenten kunnen redeneren over de voortplantingsmechanismen van plant en dier, de genetica en over de biodiversiteit waarop veredeling berust.
    • De studenten kunnen uitleggen hoe de verschillende veredelingsmethodes kunnen worden toegepast.
    • De studenten kunnen toelichten hoe moderne moleculaire technieken kunnen worden gebruikt om de klassieke veredeling te ondersteunen.

    Practicum

    • De studenten kunnen de de verschillende veredelingsmethoden toepassen via praktijkwerk of via oefeningen.
    • De studenten kunnen werken met verschillende moleculaire merkers en kunnen resultaten correct analyseren en interpreteren in functie van veredeling.

    Begintermen

    • Grondige kennis van de biologie van dieren en planten en van hun voortplanting.
    • Basiskennis van celdeling, chromosomen en DNA
    • Basiskennis van populatiedescriptoren en verwerking van data

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    SOEPEL( G0N04A ) OF SOEPEL( G0N04C )


    G0N04AG0N04A : Celbiologie en biochemie
    G0N04CG0N04C : Celbiologie en biochemie

    Onderwijsleeractiviteiten

    Veredeling en biotechnologie: hoorcollege (B-KUL-I0N52a)

    4 studiepunten : College 39 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Inhoudsopgave theorie

    Deel 1 Plantenveredeling en biotechnologie

    Plantenveredeling
    1.   Situering en werkwijze van de plantenveredeling
    2.   Bloei, voortplanting, vruchtbaarheidsregulerende mechanismen en implicaties voor de plantenveredeling
    3.   Genetische basis voor de plantenveredeling
    4.   Veredelingsprogramma’s bij zelfbevruchters
    5.   Veredelingsprogramma’s bij kruisbevruchters en vegetatief vermeerderde gewassen
    6.   Terugkruisingen en hybride veredeling

    Biotechnologie bij planten
    1.   Moleculaire merkers: principe, technieken en genetische kaarten
    2.   Gene/QTL mapping en merker-gestuurde selectie
    3.   Transgenese en gene editing

    Deel 2 Dierenveredeling en biotechnologie

    Dierenveredeling
    1.   Algemene aspecten en vergelijking van veredeling van dieren en planten
    2.   Controle van voortplantingsmechanismen
    3.   Genetische basis van dierenveredeling
    4.   Principes van selectie en genetische vooruitgang

    Biotechnologie bij dieren
    1.   Basisprincipes van moleculaire genetica bij dieren
    2.   Koppelingsanalyse
    3.   Merker Ondersteunde Selectie
    4.   Biotechnologie bij dieren

    Studiemateriaal

    Slides en extra informatie -> zie Toledo

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    I0N52B : Veredeling en biotechnologie

    Veredeling en biotechnologie: taak (B-KUL-I0J35a)

    1 studiepunten : Opdracht 0 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    De student legt het principe van een bepaalde veredelingstechniek/technologie uit, en illustreert hoe die toegepast wordt of kan worden voor de genetische verbetering van planten of dieren.

    Studiemateriaal

    De studenten krijgen een paper over een bepaalde veredelingsstrategie of -techniek.

    Toelichting werkvorm

    Studenten krijgen een paper over een bepaalde techniek gerelateerd aan veredeling of biotechnologie die ze moeten toepassen in planten of dieren en krijgen hierover een vraag op het examen. Voor het oplossen  van deze vraag mogen ze de paper gebruiken.

    Veredeling en biotechnologie: practicum (B-KUL-I0N53a)

    1 studiepunten : Practicum 26 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    1. Labopracticum PCR-gebaseerde moleculaire merkers

    • aanleren van technieken
    • fingerprinting en QTL mapping

    2. Oefeningen in verband met merkeranalyses

    Het gepresenteerde werk staat op 2 punten  van het totaal

    Studiemateriaal

    Handleidingen -> zie Toledo

    Toelichting werkvorm

    Laboratoriumsessie - Oefensessie

    - Labopracticum met presentatie en experimenteel werk
    - Oefeningen rond het gebruik van merkers in veredeling 

    Het gepresenteerde werk staat op 2 punten  van het totaal

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    I0N52B : Veredeling en biotechnologie

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Veredeling en biotechnologie (FWET) (B-KUL-I2N52a)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Presentatie, Medewerking tijdens contactmomenten
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    Practicum is verplicht. Studenten die ongewettigd afwezig zijn, worden automatisch uitgesloten voor het examen. Het opleidingsonderdeel wordt dan als "niet-afgelegd" (NA) beschouwd.

    De evaluatie van het Opleidingsonderdeel 'Veredeling en biotechnologie' (6 sp.) bestaat uit:

    • Een score op de opdracht van het practicum (2 punten)

    Een schriftelijk examen (gesloten boek) met open vragen tijdens de examenperiode (telt mee voor 18 van de 20 punten)

    • Dierenveredeling en Biotechnologie bij prof. Buys (7 punten)
    • Plantenveredeling en Biotechnologie bij prof. De Storme (7 punten)
    • Een bijkomende vraag over de opdracht met gebruik van de paper (telt mee voor 4 van de 20 punten)

    Bijkomende slaagvoorwaarde: De student moet voor het onderdeel dierenveredeling en -biotechnologie (prof. Buys) én voor het onderdeel plantenveredeling en -biotechnologie (prof. De Storme) minimaal een tolereerbaar resultaat van 8/20 behalen om voor het OPO te kunnen slagen. De student met  een niet tolereerbaar resultaat voor één van deze onderdelen zal een  9/20 gegeven worden, tenzij de berekende score lager is.

    Toelichting bij herkansen

    Er is geen herkansing mogelijk van het practicum. De  score op het practicum wordt overgedragen naar de derde examenperiode.

    ECTS Milieutechnische microbiologie (B-KUL-I0N96A)

    5 studiepunten Nederlands 48 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract

    Doelstellingen

    De student verwerft inzicht in de microbiologie en de microbiële processen van biotechnologische systemen, toegepast in milieutechnologie.

    De student leert  

    - de biochemische mechanismen betrokken in polluentverwijdering onderscheiden,

    - de fylogenie van de desbetreffende organismen begrijpen,

    - een keuze maken uit systemen om de desbetreffende organismen en processen op te volgen,

    - een keuze maken uit biotechnologische behandelingsmethoden van verontreinigde bodem, water en lucht en afvalverwerking,

    - een schriftelijk rapport maken van een praktische oefening gerelateerd aan milieubiotechnologie.

     

    Begintermen

    Basiskennis microbiologie en biochemie.

    Plaats in het onderwijsaanbod

    Onderwijsleeractiviteiten

    Milieutechnische microbiologie: hoorcollege (B-KUL-I0N96a)

    4 studiepunten : College 28 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Het vak omvat vier delen.

    In een eerste deel wordt aandacht besteed aan de polluenten zelf, aan hun gedrag wat betreft verspreiding in het leefmilieu, aan de omgevingsfactoren die hun verspreiding beïnvloeden en aan de weerslag daarvan op de mogelijke toepassing van biologische systemen voor de verwijdering van de polluenten uit dat milieu. Daarnaast wordt aandacht gegeven aan algemeen gebruikte termen in leefmilieubiotechnologie.

    Een tweede gedeelte behandelt de verschillende mechanismen en processen die micro-organismen gebruiken in het omgaan met verontreinigingen zoals de microbiële afbraakwegen van organische polluenten (zowel in aërobe als anaërobe omstandigheden), microbiële resistentiemechanismen tegen zware metalen, verwijderingsmechanismen van zware metalen, processen die worden gebruikt voor nutrient (stikstof en fosfaat) verwijdering en processen voor de verwerking van organische afval tot nuttige producten. Dit wordt procesmatig maar ook op biochemisch en genetisch vlak bekeken. 

    Deel drie voorziet de toepassing van de kennis in delen 1 en 2 in de biologische behandeling van gecontamineerde bodems (ex situ en in situ), van afvalwater en van afvalverwerking.

    Een vierde deel spitst zich toe op de methodes om milieubiotechnologische activiteiten en het gedrag van organismen in het verontreinigd biotoop op te volgen. Daaronder vallen methodes voor de detectie van de polluent, de detectie van mogelijke afbraakprodukten, isotoopanalyse, en microbiële en moleculaire methodes die zich rechtstreeks richten naar de microbiologie.

     

    Studiemateriaal

    Slides beschikbaar via Toledo.

    Toelichting werkvorm

    Interactief hoorcollege.

    Milieutechnische microbiologie: practicum (B-KUL-I0N97a)

    1 studiepunten : Practicum 20 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    De studenten testen in het labo de pesticideresidubiodegradatiecapaciteit van zandfilters die gebruikt worden in systemen voor productie van drinkwater uit grondwater. De biologische afbraak van twee verschillende pesticideresidus wordt onderzocht waarbij UPLC-UV-VIS wordt gebruikt om de pesticideresiduconcentraties te meten. Daarnaast worden gerichte moleculaire technieken zoals PCR toegepast om genfuncties betrokken in de bioafbraak te detecteren. Verschillende zandfilters afkomstig van verschillende drinkwaterproductiesystemen worden met elkaar vergeleken. De stalen zijn afkomstig van operationele drinkwatrproductiesystemen aangeleverd door De Watergroep.    

    Studiemateriaal

    Practicumhandleiding beschikbaar via Toledo.

    Toelichting werkvorm

    Het practicum gebeurt in groepsverband (groepen van 3-4 studenten). Elke groep heeft een begeleider (PhD student of post-doc behorende tot de afdeling). In een introductiesessie wordt een overzicht gegeven van het practicum door de practicumverantwoordelijke van de organiserende afdeling en worden de verwachtingen naar de studenten verduidelijkt. De studenten beschikken via Toledo ook over een gedetailleerde practicumhandleiding die zowel achtergrondinformatie bevat over het behandelde thema als praktische informatie. De handleiding wordt verwacht doorgenomen te zijn voor de inleidende sessie. Het practicum verloopt over verschillende halve dagen. Het practicum leidt tot een verslag waarin kinetieken van afbraak worden besproken en een interpretatie gebeurt van de resultaten. De resultaten worden na het practicum in een on line sessie met de docent besproken. Dit gebeurt voor het indienen van het verslag. De studenten worden wel verwacht de resultaten steeds op te volgen en hun eigen interpretatie naar voren te brengen.

    De bedoeling van het practicumproject is dat de studenten in contact komen met een experimentele setup die de bioafbreekbaarheid van organische polluenten onderzoekt. Zij leren hoe dergelijke testen worden opgesteld (met inbegrip van geschikte controles) en opgevolgd. Zij komen daarbij in contact met verschillende reeds gekende monitoringstechnieken maar leren hoe deze worden toegepast bij deze specifieke toepassing. Zij werken in groep waarbij verschillende taken tegelijkertijd worden uitgevoerd en waarbij de groep zich moet organiseren. Zij leren hoe de resultaten moeten worden weergegeven en geïnterpreteerd op basis van literatuur. Bovendien wordt er in het practicum ook gewerkt rond een wetenschappelijke vraag in verband met adaptatie van de microbiële bodemgemeenschap naar afbraak van een polluent toe en leren de studenten hiermee omgaan.

     

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Milieutechnische microbiologie (B-KUL-I2N96a)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Mondeling, Schriftelijk, Verslag, Self assessment/Peer assessment, Medewerking tijdens contactmomenten
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    Practicum (4/20) en afsluitend examen (16/20). De student is geslaagd voor het examen indien de totaliteit van de punten ≥ 10/20 is. De punten van het practicum kunnen overgedragen worden naar het volgend academiejaar met vrijstelling van het practicum indien de score ≥ 2/4 is. Vóór de ISP-deadline van semester 1 van het volgende academiejaar richt de student hiertoe zijn vraag per e-mail aan de verantwoordelijke docent.

    Alle labosessies zijn verplicht.

    Een afwezigheid moet zo snel mogelijk en uiterlijk vóór de start van de sessie gemeld worden aan de lesgever. Bovendien moeten studenten hun niet-deelname verantwoorden aan de hand van een geldig bewijsstuk. Gewettigd afwezige studenten kunnen eventueel, in samenspraak met de docent, de gemiste sessie inhalen op een andere dag indien die mogelijkheid zich biedt. Studenten die niet (tijdig) hun afwezigheid melden of niet (tijdig) een geldig attest bezorgen, worden uitgesloten voor het eindexamen van het opleidingsonderdeel (OPO) in alle examenperiodes van het betreffende academiejaar. Het betreffende OLA en OPO worden in alle examenperiodes van dat academiejaar als "niet-afgelegd" (NA) beschouwd.

    Eigenlijk examen.

    Tijdens het examen worden er vier vraagstellingen opgegeven.

    • 2 schriftelijk
    • 2 mondeling met schriftelijke voorbereiding waaronder één vraag die de bespreking behandelt van een opgegeven artikel. Het artikel mag (ongeschreven) geraadpleegd worden tijdens het examen. 

    Toelichting bij herkansen

    Tijdens de herkansing is de modaliteit van het afrondend examen identiek. Voor het practicum is echter geen tweede examenkans voorzien; het resultaat hiervoor uit de eerste examenperiode wordt meegenomen naar de tweede examenkans. 

     

    ECTS Levensmiddelenchemie en -technologie (B-KUL-I0O10A)

    5 studiepunten Nederlands 39 Eerste semesterEerste semester

    Doelstellingen

    Kennis over het domein van de levensmiddelenchemie en -technologie is noodzakelijk om op een veilige en efficiënte wijze kwaliteitsvolle voeding te produceren en ze te bewaren.
     
    Op het einde van de cursus wordt het volgende verwacht van de studenten:
    - De studenten hebben inzicht verworven in de historische ontwikkeling van voedselvoorziening en de totstandkoming van hedendaagse levensmiddelenproductiesystemen.
    - De studenten hebben basiskennis over de samenstelling van levensmiddelen en de chemische structuur van hun majorconstituenten.
    - De studenten hebben zich vertrouwd gemaakt met de belangrijkste eenheidsbewerkingen die gebruikt worden in de levensmiddelenproductie en kunnen deze plaatsen in de keten van grondstof tot volledig afgewerkt product.
    - De studenten hebben basisinzicht verworven in de toepassing van klassieke en moderne biotechnologie (fermentatie, enzymen, GMO) in de levensmiddelensector  
    - De studenten zijn vertrouwd met basisbegrippen en concepten op het gebied van verpakking, nutritionele waarde van levensmiddelen en sensorische analyse.
    - De studenten zijn vertrouwd met het productieproces van een aantal basislevensmiddelen en de principes die aan de gronslag liggen van deze processen.
    - De studenten kunnen ten slotte bovenstaande kennis toetsen aan reële levensmiddelen
     

    Begintermen

    Basiskennis organische chemie en biochemie.

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    ( SOEPEL(I0N03D) OF ( SOEPEL(X9X03A) OF SOEPEL(X0E39A) ) OF SOEPEL(G0N08A) OF SOEPEL(G0O35A) ) EN ( SOEPEL(G0N01C) OF SOEPEL(X0C33A) OF SOEPEL(X0C33C) OF SOEPEL(X0E41A) OF SOEPEL(I0N26C) ) EN ( SOEPEL(I0N13C) OF SOEPEL(G0N04C) OF SOEPEL(X0A97C) OF SOEPEL(X0E45A) )


    I0N03DI0N03D : Algemene chemie
    X9X03AX9X03A : Bio-organische chemie
    X0E39AX0E39A : Bio-organische chemie
    G0N08AG0N08A : Bio-organische chemie
    G0O35AG0O35A : Organische chemie
    G0N01CG0N01C : Grondslagen van de chemie
    X0C33AX0C33A : Grondslagen van de chemie
    X0C33CX0C33C : Grondslagen van de chemie
    X0E41AX0E41A : Grondslagen van de chemie
    I0N26CI0N26C : Anorganische chemie
    I0N13CI0N13C : Biochemie
    G0N04CG0N04C : Celbiologie en biochemie
    X0A97CX0A97C : Biochemie
    X0E45AX0E45A : Biochemie

    Onderwijsleeractiviteiten

    Levensmiddelenchemie en -technologie (B-KUL-I0O10a)

    5 studiepunten : College 39 Eerste semesterEerste semester

    Inhoud

    Kennis van levensmiddelenchemie en -technologie is noodzakelijk om op een veilige en efficiënte wijze kwaliteitsvolle voeding te produceren en ze te bewaren. In dit OPO worden levensmiddelenchemie en -technologie in relatie gebracht met tal van elementen in het brede domein van voeding. Op deze wijze wordt hun onderliggend belang duidelijk en wordt tegelijk een overzicht gegeven van dit domein.

    Na een inleiding over de historische ontwikkeling van voedsel-voorziening en de totstandkoming van de hedendaagse levensmiddelen-productiesystemen (hoofstuk 2), wordt ingegaan op de samenstelling van levensmiddelen en de chemische structuur van hun majorconstituenten (hoofdstuk 3). De belangrijkste eenheidsbewerkingen die worden gebruikt in de levensmiddelenproductie worden besproken en worden geplaatst in de keten van grondstof tot volledig afgewerkt product (hoofdstuk 4). Verder wordt de studenten basisinzicht aangereikt met betrekking tot de toepassing van klassieke en moderne biotechnologie [fermentatie (hoofdstuk 5), enzymen (hoofdstuk 6), GMO (hoofdstuk 7)] in de levensmiddelensector. De studenten worden verder vertrouwd gemaakt met basisbegrippen en concepten op het gebied van verpakking (hoofdstuk 8), voeding en gezondheid (hoofdstuk 9), kwaliteitsborging (hoofdstuk 10) en sensorische analyse (hoofdstuk 11). Als integratie van voorgaande hoofdstukken wordt het productieproces van een aantal basislevensmiddelen en de principes die aan de gronslag liggen van deze processen bestudeerd (hoofdstukken 12 - 13 en volgende). Aan de studenten wordt gevraagd om tijdens het jaar de opgedane kennis te toetsen aan reële levensmiddelen.

    De cursus bestaat uit volgende hoofdstukken:
    0. Syllabus
    1. Inleiding tot de levensmiddelenchemie en -technologie
    2. Onze dagelijkse voeding
    3. Bronnen en samenstelling van levensmiddelen
    4. Verwerking van levensmiddelen
    5. Levensmiddelenbiotechnologie: fermentatie
    6. Levensmiddelenbiotechnologie: enzymen in levensmiddelenproductie
    7. Levensmiddelenbiotechnologie: GMO in een levensmiddelencontext
    8. Verpakking van voedingsmiddelen
    9. Voeding en gezondheid
    10. Kwaliteitsborging en voedselcrisissen
    11. Smaak en sensorische evaluatie
    12. Productie van chocolade
    13. Productie van sojaolie
    (14. Bijkomende productieprocessen)

    Studiemateriaal

    Cursustekst (via docent)
    Presentatiemateriaal (slides) (Toledo)
    Twee wetenschappelijke artikels (Toledo)

     

    Toelichting werkvorm

    De lessen hebben de vorm van een interactief hoorcollege.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Levensmiddelenchemie en -technologie (B-KUL-I2O10a)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Mondeling
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    De evaluatie van het Opleidingsonderdeel 'Levensmiddelenchemie en -technologie' bestaat uit een mondeling, gesloten boek examen tijdens de examenperiode. Eén vraag betreft een aan het begin van het semester zelfgekozen verpakt en verwerkt levensmiddel. De student brengt dit levensmiddel mee op het examen en heeft het ter beschikking tijdens het examen.

    Toelichting bij herkansen

    De evaluatie van het Opleidingsonderdeel 'Levensmiddelenchemie en -technologie' bij herkansing bestaat uit een mondeling, gesloten boek examen tijdens de examenperiode. Eén vraag betreft een aan het begin van het semester zelfgekozen verpakt en verwerkt levensmiddel. De student brengt dit levensmiddel mee op het examen en heeft het ter beschikking tijdens het examen.

    ECTS Gentechnologie (B-KUL-I0O11A)

    6 studiepunten Nederlands 65 Eerste semesterEerste semester Uitgesloten voor examencontract
    Lavigne Rob (coördinator) |  Lavigne Rob |  Paeshuyse Jan |  N. |  Mühlemann Joëlle (plaatsvervanger)

    Doelstellingen

    Doel van dit college is het aanbrengen van de basisprincipes, -technieken, en strategieën die worden gebruikt bij moleculaire klonering, met voornamelijk Escherichia coli als gastorganisme. Deze kennis vormt de basis voor het volgen van colleges waarin de verschillende toepassingsdomeinen van de genbiotechnologie worden belicht en besproken.

    Het practicum biedt de studenten de mogelijkheid enkele standaardtechnieken van gen-transfer, -analyse en -bewerkingen experimenteel toe te passen.
    Na studie en verwerking van deze materie is de student in staat het werken met genetische informatiedragende macromoleculen te begrijpen, nauwkeurig te beschrijven, en praktische constructies en analyses te simuleren.

    Begintermen

    Van de student wordt kennis verwacht van de bouwstenen voor de belangrijkste klassen van biologische macromoleculen en hun belangrijkste cellulaire functies. Er wordt inzicht verwacht in de ruimtelijke structuur van proteïnen en de katalytische activiteit van enzymen, en de mechanismen van codering, replicatie en expressie van genetische informatie. Basisbegrippen van metabolisme en microbiologie zijn een pluspunt.

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    ( SOEPEL (I0N28A) OF ( SOEPEL (X0B41B) OF SOEPEL (X0E51A) ) OF SOEPEL (G0N16B) OF SOEPEL (G0N16C) OF SOEPEL (G0O53A) OF SOEPEL (G0O53C) )


    I0N28AI0N28A : Microbiologie
    X0B41BX0B41B : Microbiologie
    X0E51AX0E51A : Microbiologie
    G0N16BG0N16B : Microbiologie
    G0N16CG0N16C : Microbiologie
    G0O53AG0O53A : Moleculaire biologie
    G0O53CG0O53C : Moleculaire biologie


    Onderwijsleeractiviteiten

    Gentechnologie (B-KUL-I0O11a)

    4.5 studiepunten : College 39 Eerste semesterEerste semester
    Lavigne Rob |  Paeshuyse Jan |  N. |  Mühlemann Joëlle (plaatsvervanger)

    Inhoud

    • Isolatie en visualisatie van nucleïnezuren
    • Manipulatie van nucleïnezuren
    • PCR & afgeleide technieken
    • Van plasmide tot basisvectoren
    • Gespecialiseerde vectoren
    • Van genklonering tot DNA banken
    • Overzicht van nucleïne-gebaseerde analysetechnieken
    • Mutagenese
    • Recombinante eiwitexpressie
    • Biotechnologie in gist
    • Moleculaire klonering van hogere organismen

    Studiemateriaal

    • Opbouw cursus: overzichtspagina's, slides, extra figuren & documentatie (via Toledo)
    • Basisboek: Principles of Gene Manipulation and Genomics, S.B. Primrose & R.M. Twyman, 2006 (7th ed.), ISBN  1-4051-3544-1

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    I0J41A : Biomoleculaire technologie en analyse

    Gentechnologie: oefeningen (B-KUL-I0O12a)

    1.5 studiepunten : Practicum 26 Eerste semesterEerste semester
    Lavigne Rob |  Paeshuyse Jan |  N. |  Mühlemann Joëlle (plaatsvervanger)

    Inhoud

    De oefeningen in dit practicum ondersteunen en verduidelijken de theoretische concepten uit het hoorcollege. Specifiek worden de volgende oefensessies voorzien:

    • Manipulatie van nucleïnezuren (1&2)
    • PCR & afgeleide technieken (3&4)
    • Combinatieoefeningen (5)
    • biochemische analysetechnieken (6)
    • Verslagoefeningen (7&8)

    Studiemateriaal

    - Theoretische achtergrond en opgaven worden meegedeeld via Toledo

    Toelichting werkvorm

    - Verplicht volgen van oefenzittingen

    - Maken van oefeningen en verslagen

     

    Komt ook voor in andere opleidingsonderdelen

    I0J41A : Biomoleculaire technologie en analyse

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Gentechnologie (B-KUL-I2O11a)

    Type : Partiële of permanente evaluatie met examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk, Verslag, Medewerking tijdens contactmomenten
    Vraagvormen : Open vragen
    Leermateriaal : Formularium

    Toelichting

    Theoretisch luik (75%)

    - Open domeinvraag die peilt naar kennis, begrip, analyse en synthese van het cursusmateriaal

    - Techniekvraag: definiëren en illustreren van specifieke technologieën (Kennis, Begrip & analyse)

    - Definitievragen die synthesevaardigheden vereisen

    Practicum (25%)

    - Medewerking en verslagen uit de verplichte oefenzittingen. Studenten die niet deelnemen aan het practicum, mogen geen examen afleggen. Deze deelscore wordt overgedragen naar de tweede zittijd

    - Oefening tijdens het examen, die peilt naar analyse, synthese, toepassing en evaluatie van specifieke technieken. Voor deze oefening kan mogelijk een specifiek formularium (bv lijst van restrictie-enzymes) beschikbaar worden gesteld.

     

    Een student kan kan voor het luik practicum een deelvrijstelling aanvragen bij de docent voor het volgende academiejaar.

    ECTS Ontstaansmechanismen van ziekte (B-KUL-K0B28A)

    5 studiepunten Nederlands 36 Tweede semesterTweede semester

    Doelstellingen

    Na het volgen van dit opleidingsonderdeel hebben de studenten inzicht in de oorzaken die de normale homeostase van het menselijk lichaam verstoren. De studenten kennen het verschil tussen uitwendige en inwendige verstoringsreacties en begrijpen hoe het lichaam hierop reageert. Ze kunnen dit linken aan het ontstaan van ziekten. De studenten kunnen de processen beschrijven maar ook kritisch beredeneren en tot op een bepaald niveau vertalen naar de klinische praktijk.

    De bacheloropleiding in de Farmaceutische wetenschappen beoogt een aantal opleidingsleerresultaten (OLR’s) die de studenten uiteindelijk moet gehaald hebben wanneer zij hun diploma behalen. Deze OLR’s liggen vast. Alle opleidingsonderdelen in het programma van de bacheloropleiding bouwen samen aan deze OLR’s. Elk OPO heeft zijn specifieke bijdrage tot één of meerdere OLR’s, zonder de ganse OLR te willen omvatten. Onderstaand staan telkens eerst die OLR’s weergegeven waartoe dit OPO meewerkt. In de opsomming daaronder staat gespecifieerd hoe dit OPO bijdraagt aan het behalen van de OLR. Het is de som van de doelstellingen van de verschillende OPO’s die ervoor zorgt dat de OLR uiteindelijk zal behaald worden.

    OLR. De bachelor heeft een grondige kennis van en inzicht in chemie en kan deze toepassen in een farmaceutische context.

    • De studenten kunnen basisprincipes van de biochemie en eigenschappen van fysiologisch relevante biochemische stoffen inzetten om eenvoudige casussen binnen de pathofysiologie op te lossen.

    OLR. De bachelor heeft een grondige kennis van en inzicht in celbiologie en kan deze toepassen in een farmaceutische context.

    • De studenten kunnen vanuit onderliggende cellulaire en moleculaire processen beredeneren hoe pathofysiologische storingsmechanismen kunnen optreden.

    OLR. De bachelor heeft kennis van en inzicht in de biologische systemen en processen waarop geneesmiddelen inwerken.

    • De studenten kunnen beredeneren welke punten van het pathofysiologisch proces geschikte aangrijpingspunten zouden kunnen zijn voor geneesmiddelen ter behandeling van het ongewenste effect.

    OLR. De bachelor kent de belangrijkste ziektebeelden en heeft een inzicht in de processen die een rol spelen bij het ontstaan ervan.

    • De studenten kunnen de algemene processen waardoor de normale homeostase ontregeld geraakt, beschrijven.
    • De studenten kunnen de gevolgen van een ontregelde homeostase beredeneren en verklaren.
    • De studenten kunnen de oorzaken van een ontregelde homeostase beredeneren.
    • De studenten kunnen aan de hand van duidelijke symptomen, casussen en/of pathologieën aanduiden welke pathofysiologische processen verstoord zijn.

    Begintermen

    Basiskennis van cellulaire en moleculaire processen, (bio)chemie en fysiologie van de organen.

    Volgtijdelijkheidsvoorwaarden



    GELIJKTIJDIG(K0B27B) OF GELIJKTIJDIG(K0B27A) OF GELIJKTIJDIG(K04B7A) OF GELIJKTIJDIG(G0Z20B)


    K0B27BK0B27B : Orgaanfysiologie
    K0B27AK0B27A : Orgaanfysiologie
    K04B7AK04B7A : Orgaanfysiologie
    G0Z20BG0Z20B : Functionele biologie van dieren


    Identieke opleidingsonderdelen

    K05B8A: Algemene ziekteleer

    Onderwijsleeractiviteiten

    Ontstaansmechanismen van ziekte (B-KUL-K0B28a)

    5 studiepunten : College 36 Tweede semesterTweede semester

    Inhoud

    Dit opleidingsonderdeel behandelt de algemene processen die leiden tot een verstoring van de normale homeostase (pathofysiologie). De nadruk ligt daarbij op de wetenschappelijke basis die nodig is voor het begrijpen van gerelateerde ziekteprocessen, en niet op de klinische aanpak van therapie of diagnose. Er wordt veel belang gehecht aan verdedigingssystemen (zowel niet-specifiek als specifiek) tegen lokale of veralgemeende beschadiging. Per stoornis van het normale functioneren komen minstens de oorzaken, het onderliggende mechanisme en de gevolgen aan bod. Vanuit deze processen wordt de link gelegd met mogelijke farmacologische interventie.

    Onderstaande inhouden komen aan bod:

    • Morbiditeit vs mortaliteit en gerelateerde (intrinsieke en extrinsieke) oorzaken
    • Ziekte en veroudering: oorzaken, mechanisme, gevolgen
    • Infectie en ontsteking: oorzaken, rol van chemokines, complementsysteem, stollingsreactie,
    • Chronische ontsteking
    • Immuniteit en immuundeficiëntie: aangeboren immuunrespons, verworven immuunrespons, hypersensitiviteit
    • Stressreacties van het lichaam: fysiologische oorzaken, mechanisme, gevolgen
    • Stoornissen van thermoregulatie: koorts (wat, mechanisme, gevolgen)
    • Acute en chronische pijn: soorten, oorzaken, mechanisme, gevolgen
    • Stoornissen van de homeostase: osmolaliteit, dehydratatie
    • Stoornissen van de homeostase: ionenbalans (calcium en kalium)
    • Stoornissen van de homeostase: zuur-base balans (acidose, alkalose)
    • Stoornissen en beschadiging van genetisch materiaal en ziekte (inleidend)
    • Inleiding tot de klinische oncologie (ontstaan van tumoren, metastasen)

     

    Studiemateriaal

    presentaties beschikbaar via toledo

    Toelichting werkvorm

    Casusgebaseerd college

    Om studenten reeds vroeg in hun opleiding kennis te laten maken met klinisch redeneren en voor te bereiden op het vervolgOPO Ziekteleer, wordt in de mate van het mogelijke de inhoud en/of verwerking van de inhoud aangeboden via relevante casussen.

    Evaluatieactiviteiten

    Evaluatie: Ontstaansmechanismen van ziekte (B-KUL-K2B28a)

    Type : Examen tijdens de examenperiode
    Evaluatievorm : Schriftelijk
    Vraagvormen : Meerkeuzevragen, Open vragen
    Leermateriaal : Geen

    Toelichting

    Het examen peilt zowel naar kennis als inzicht, en toetst het redeneervermogen van studenten (o.a. aan de hand van casussen). Het examen bevat een beperkt aantal meerkeuzevragen, naast de open vragen.

    Toelichting bij herkansen

    Zelfde modaliteiten als in reguliere examenperiode.